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博士科研启动基金(1212318)

作品数：6 被引量：29H指数：3
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文献类型

  • 6篇中文期刊文章

领域

  • 4篇农业科学
  • 3篇生物学

主题

  • 6篇珠母贝
  • 6篇马氏珠母贝
  • 5篇克隆
  • 5篇基因
  • 4篇基因克隆
  • 3篇荧光
  • 3篇荧光定量
  • 2篇荧光定量PC...
  • 1篇特异性表达
  • 1篇同源
  • 1篇组织表达分析
  • 1篇组织特异性
  • 1篇组织特异性表...
  • 1篇外套膜
  • 1篇内参
  • 1篇内参基因
  • 1篇基因CDNA
  • 1篇基因表达
  • 1篇基因序列
  • 1篇分子

机构

  • 6篇广东海洋大学

作者

  • 6篇焦钰
  • 6篇邓岳文
  • 4篇杜晓东
  • 4篇黄荣莲
  • 4篇王庆恒
  • 2篇闫芳
  • 2篇罗少杰
  • 1篇田荣荣
  • 1篇郑哲
  • 1篇阎芳

传媒

  • 3篇基因组学与应...
  • 2篇广东海洋大学...
  • 1篇水产学报

年份

  • 1篇2015
  • 4篇2014
  • 1篇2013
共 6 条 记 录，以下是 1-6
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排序方式：
马氏珠母贝IKKε同源基因的克隆及表达分析被引量：8
2014年
IKKε(inhibitor of NF-κB kinasesε)是NF-κB(nucleur factorκB)信号通路中的关键成员,参与调控细胞的分化、发育、凋亡及免疫反应。本研究根据马氏珠母贝转录组数据库中注释为IKKε的unigene序列设计引物,应用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆获得了马氏珠母贝(Pinctada martensii)IKKε基因cDNA的全长序列(PmIKKε)并对其序列特征进行分析;同时利用荧光定量PCR(Real-time PCR)技术检测了马氏珠母贝六个组织中PmIKKε基因mRNA的表达。结果表明:PmIKKε基因cDNA全长2 843 bp,其中5'UTR为116 bp,3'UTR为516 bp,含有27 bp polyA,开放阅读框为2 211 bp,编码737个氨基酸残基。预测其分子量为85.07 kD,等电点为6.17。多序列比对显示PmIKKε与其它物种IKKε有较高的同源性,与牡蛎的序列相似性有45%。软件分析结果显示PmIKKε的N端含有一个蛋白激酶功能结构域和一个MAPKK(mitogen-activated protein kinase kinase)的激活位点,C端含有一个亮氨酸拉链(leucin zipper,LZ)和一个螺旋-环-螺旋结构(helix-loop-helix,HLH)。荧光定量PCR分析表明PmIKKε在马氏珠母贝肝胰脏、性腺、血淋巴、鳃、外套膜、闭壳肌六个组织中均有表达,肝胰脏中表达量最高。本研究为进一步阐述PmIKKε在马氏珠母贝生长、发育及先天性免疫中的作用提供理论基础。
焦钰杜晓东王庆恒黄荣莲邓岳文
关键词：PINCTADA基因克隆荧光定量PCR
马氏珠母贝LST8基因cDNA的分子特征及表达分析被引量：11
2014年
LST8(lethal with SEC13 protein 8)是TOR(target of rapamycin)复合物的重要组成成分,在生物生长和发育的调控中发挥重要作用。本研究根据马氏珠母贝转录组数据库中注释为LST8的unigene序列设计引物,采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆获得了马氏珠母贝LST8基因cDNA全长序列(pm-LST8);同时利用荧光定量PCR(Real-time PCR)技术检测了pm-LST8在马氏珠母贝各个组织中的表达含量。结果表明,pm-LST8基因cDNA全长1 350 bp,其中开放阅读框为948 bp,编码316个氨基酸残基,5'UTR为104 bp,3'UTR为298 bp,含有29 bp polyA。预测其分子量为35.4 kD,等电点为6.11。多序列比对显示pm-LST8与其它物种的LST8有较高的保守性,与牡蛎的同源序列高达82%。蛋白质结构预测显示pm-LST8具有典型的WD40结构域。荧光定量PCR分析表明pm-LST8在马氏珠母贝闭壳肌、鳃、外套膜、肝胰脏、性腺、足、血淋巴七个组织中均有表达,其中在性腺中表达量最高。本研究为进一步阐述LST8在马氏珠母贝生长和发育调控中的作用提供理论基础。
焦钰田群莉杜晓东黄荣莲王庆恒邓岳文
关键词：马氏珠母贝基因克隆
马氏珠母贝TOR基因cDNA的克隆与组织表达分析被引量：1
2014年
TOR(target of rapamycin)是一类进化上非常保守的蛋白激酶,参与调节多种生化代谢,协调蛋白质的生物合成和降解。本研究采用c DNA末端快速扩增技术(RACE),克隆获得了马氏珠母贝TOR基因c DNA全长序列(pm-TOR);同时利用荧光定量技术检测了pm-TOR基因m RNA在马氏珠母贝各个组织中的表达含量。结果表明:pm-TOR基因c DNA序列全长9 220 bp,开放阅读框(ORF)长7 488 bp,编码2 495个氨基酸,5'非翻译区(5'UTR)长157 bp,3'UTR长1 575 bp。氨基酸序列同源比对分析显示pm-TOR氨基酸序列与其他物种具有较高的保守性,与牡蛎(Crassostrea gigas)的TOR的序列相似度为79%。荧光定量PCR数据分析显示,TOR基因的m RNA在马氏珠母贝血液、性腺、肝胰脏、外套膜、闭壳肌和鳃组织中均有表达,其中肝胰脏和性腺中表达量较高,血液中表达量较低。本研究为进一步阐述TOR在马氏珠母贝中生长和发育调控中的作用提供理论基础。
田群莉邓岳文杜晓东焦钰黄荣莲王庆恒
关键词：马氏珠母贝基因克隆REAL-TIMEPCR
马氏珠母贝基质金属蛋白酶基因MMP-17的克隆及表达分析被引量：14
2015年
基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinases,MMP)是一种能够降解细胞外基质的蛋白水解酶。MMP-17是一种膜型基质金属蛋白酶,通过糖基磷脂酰肌醇连接于细胞表面,参与调控有机体的内环境稳定、宿主防御等多种生理过程。为研究MMP-17在马氏珠母贝免疫反应中的作用,实验运用RACE技术,克隆得到马氏珠母贝MMP-17(Pinctada martensii MMP,PmMMP-17)基因c DNA全长序列,并对其序列特征及功能进行初步分析。结果显示,Pm-MMP-17基因c DNA全长2 794 bp,开放阅读框(ORF)为1 923 bp,编码640个氨基酸,5'UTR长156bp,3'UTR长715 bp,分子量约为73.11 ku,等电点为8.98;多序列比对和系统进化树分析表明,Pm-MMP-17与其他物种的MMP具有较高的保守性,与长牡蛎的MMP-17相似性高达82%;功能结构域分析表明,Pm-M M P-17有5个高度保守的结构区域:N-末端的信号肽、前导区、催化区、铰链区和C-末端的类血红素结合蛋白区;荧光定量数据分析表明,Pm-MMP-17基因在马氏珠母贝的闭壳肌、珍珠囊、足、外套膜、血淋巴、肝胰腺、性腺、鳃等8个组织中均有表达,在血液中的表达量最高,闭壳肌和鳃次之;脂多糖(LPS)刺激后,Pm-MMP-17基因表达水平上调,12 h后达到最大值,之后又逐渐下调并恢复到正常水平。研究表明,Pm-MMP-17基因可能在马氏珠母贝的免疫反应中起着重要作用。
罗少杰闫芳郑哲田荣荣邓岳文焦钰
关键词：马氏珠母贝克隆荧光定量
马氏珠母贝Su(H)基因克隆与组织特异性表达被引量：1
2013年
Su(H)基因(Suppressor of Hairless gene)对生物体细胞的分化、增殖和凋亡起重要的调控作用。根据马氏珠母贝(Pinctada martensii)转录组数据库中注释为Su(H)的unigene序列设计基因特异性引物,应用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆获得了马氏珠母贝Su(H)[pm-Su(H)]基因cDNA全长序列。结果表明:pm-Su(H)基因全长3 830 bp,其中开放阅读框含有1 920 bp,编码640个氨基酸残基,5'UTR为1 568bp,3'UTR为342 bp,含有27 bp polyA;预测其分子质量为70.6 ku,等电点为7.38;多序列比对显示,pm-Su(H)与其他物种的Su(H)有较高的保守性,与牡蛎(Crassostrea gigas)的同源序列高达80%;荧光定量PCR分析表明,pm-Su(H)在马氏珠母贝闭壳肌、鳃、珍珠囊、外套膜、肝胰脏、性腺、足、血淋巴等8组织中均有表达,其中以性腺中表达量最高,其次是珍珠囊和外套膜。
焦钰阎芳杜晓东黄荣莲王庆恒邓岳文
关键词：马氏珠母贝基因克隆基因序列基因表达
马氏珠母贝外套膜中央膜与边缘膜荧光定量PCR分析中内参基因的筛选
2014年
为筛选能在马氏珠母贝外套膜边缘膜与中央膜区域稳定表达的内参基因,应用荧光定量PCR技术,对3-磷酸脱氢酶(GAPDH)、β-肌动蛋白(β-actin)、胆色素原脱氨酶(PBGD)、微管蛋白(TUB)、TATA盒结合蛋白(TBP)、磷脂酶A2(PLA-2)、葡萄糖苷酶(GUSB)、18S核糖体r RNA(18Sr RNA)等8个常用的内参基因在马氏珠母贝外套膜边缘膜与中央膜区域的表达情况进行分析,并利用ge Norm、Norm Finder、Best Keeper及Ref Finder软件对8个内参基因的表达稳定性进行分析。结果表明:8个内参基因均可获得特异性扩增产物,但稳定性各异,其在外套膜边缘膜和中央膜区的表达稳定性顺序依次为PBGD/TBP>TUB>GUSB>18Sr RNA>PLA-2>GAPDH>β-actin;在荧光定量PCR中,PBGD和TBP在马氏珠母贝外套膜边缘膜和中央膜区的表达比较稳定,为研究贝壳矿化机制中理想的内参基因。
闫芳罗少杰田群莉焦钰邓岳文
关键词：荧光定量PCR内参基因马氏珠母贝
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