广东省农科院院长基金(201019)
- 作品数：6 被引量：41H指数：4
- 相关作者：操君喜李冬梅孙映波朱根发吕复兵更多>>
- 相关机构：广东省农业科学院广东省农业科学院环境园艺研究所更多>>
- 发文基金：广东省农科院院长基金广州市科技计划项目国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 兜兰查尔酮合成酶基因的克隆与表达分析被引量：8
- 2012年
- 以同色兜兰为试材,采用RT-PCR和RACE方法从花中获得一个兜兰查尔酮合酶基因(chalconesynthase,CHS)的cDNA全长,命名为PcCHS,GenBank登录号JQ030889。序列分析表明,PcCHS全长1 424 bp,包含106 bp的5′非编码区、133 bp的3′非编码区和一个长度为1 185 bp编码394个氨基酸的开放阅读框。氨基酸序列分析显示,PcCHS具有CHS家族保守的功能活性位点和特征多肽序列。序列比对表明,PcCHS与兰科植物的蝴蝶兰、文心兰和石斛兰等的CHS蛋白有很高的同源性。系统进化分析显示,PcCHS与兰科植物的CHS分支2的蛋白亲缘关系比较近。表达分析表明,PcCHS在花芽发育过程中均有表达,在花中的表达量最高,其次是蕊柱,再次是苞叶、子房、花瓣和萼片,在唇瓣中表达量最低,在根、叶和花茎中几乎检测不到。
- 李冬梅朱根发操君喜吕复兵刘海林孙映波
- 关键词：兜兰查尔酮合成酶基因基因克隆基因表达
- 文心兰叶绿体基因组密码子使用的相关分析被引量：14
- 2012年
- 通过对文心兰叶绿体基因组全序列密码子的研究,利用Mobyle在线软件分析了文心兰叶绿体42个基因密码子的使用模式。结果表明,文心兰叶绿体基因组密码子GC3含量为28.59%,明显低于GC1和GC2含量,说明密码子第3位富含AT。GC1与GC2极显著相关(r=0.572**),GC3与GC1(r=-0.051)和GC2(r=-0.08)均未达到显著水平。对应性分析表明第一向量轴上基因的位置坐标与该基因的表达水平(CAI)极显著负相关(r=-0.556**),与GC3和ENC的相关系数分别为0.025和0.281,均未达到显著水平;GC含量与ENC、CAI以及第一向量轴上基因位置坐标的相关系数分别为0.228、0.381*和-0.354*。将高表达优越密码子分析法和高频密码子分析法相结合,确定了17个为文心兰叶绿体基因组的最优密码子。
- 李冬梅吕复兵朱根发操君喜孙映波刘海林王真
- 关键词：文心兰叶绿体基因组密码子使用GC含量
- 兜兰DEFICIENS(DEF)-和GLOBOSA(GLO)-like基因的克隆及表达分析被引量：11
- 2012年
- 以‘同色兜兰’品种为材料,采用RT-PCR和RACE技术获得了DEFICIENS(DEF)-和GLOBOSA(GLO)-like基因的cDNA全长,命名为PcDEF和PcGLO,并用半定量RT-PCR和实时PCR研究了PcDEF和PcGLO在花芽发育过程和不同组织部位的表达特性。结果表明,PcDEF和PcGLO的全长cDNA分别为1 039bp和934bp,分别编码224和210个氨基酸;蛋白比对表明,PcDEF和PcGLO蛋白都具有典型MADS-box蛋白的MADS和K结构域;蛋白同源性分析显示,PcDEF和PcGLO与已登录的其它兰科植物的DEF/AP3和GLO/PI蛋白的相似性分别在75%～96%和87%～98%;系统进化树分析表明,PcDEF和PcGLO分别属于B类MADS-box蛋白家族的AP3和PI亚家族。表达分析显示,PcDEF和PcGLO在花芽发育中均有表达,PcDEF在成熟花、唇瓣和花瓣中的表达量高,在蕊柱、萼片、苞叶和根中次之,在花茎和叶中较低,在子房中几乎不表达;PcGLO在各组织中均有不同丰度的表达。
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- 关键词：兜兰MADS-BOX基因RACE进化分析RT-PCR
- 蝴蝶兰蔗糖合成酶基因的cDNA克隆及其表达分析被引量：2
- 2013年
- 利用低夜温诱导的蝴蝶兰花芽的抑制消减杂交文库中分离的蔗糖合成酶基因的ESTs片段,采用RT-PCR和RACE技术,从蝴蝶兰花芽中克隆得到蔗糖合成酶基因的全长cDNA,命名为PhSUS,GenBank登录号JX162557。该基因全长2 816 bp,包含147 bp的5′非编码区、218 bp的3′非编码区和一个长度为2 451 bp编码816个氨基酸的开放阅读框。PhSUS预测的分子量为93.30 ku,等电点为5.95。蛋白同源性分析结果表明,PhSUS与兰科植物的文心兰、石斛兰和莫氏兰(Mokara)等的蔗糖合成酶有很高同源性。保守结构域分析结果表明,PhSUS含有蔗糖合成酶和葡糖基转移酶两个保守功能域及4个ADP结合位点。表达分析结果表明,PhSUS在检测的组织中都有表达,但表达丰度不同。PhSUS在花蕾发育中后期、成熟花和花器官的表达量都较营养阶段根和叶中的表达量高。PhSUS的克隆为研究其参与花芽分化和发育的表达调控奠定了重要基础。
- 李冬梅朱根发操君喜孙映波王真吕复兵
- 关键词：基因克隆基因表达
- 兜兰二氢黄烷酮醇-4-还原酶基因的克隆及其表达特性被引量：3
- 2012年
- 克隆同色兜兰二氢黄烷酮醇-4-还原酶基因DFR,分析其序列特征,了解其在不同组织部位的表达情况。采用RT-PCR和RACE技术从花中克隆DFR的全长cDNA,用生物信息学方法分析序列特征,并用半定量RT-PCR研究其在不同组织的表达。分离到DFR,该cDNA全长1267bp,具有1个1074bp的完整开放阅读框,编码357个氨基酸。序列分析表明,该DFR蛋白含有1个NADB_Rossmann superfamily保守结构域,1个NADP(H)结合域和1个底物特异性结合域,其与文心兰、石斛兰和大花蕙兰等的DFR同源性在75%～80%。系统进化树显示,该DFR蛋白与兰科植物的DFR蛋白亲缘关系比较近。半定量RT-PCR表明,该DFR在成熟花和营养叶中的表达量最高,在子房、苞叶、萼片和花瓣中的表达量相当,在唇瓣中的表达量次之,在蕊柱中的表达量较唇瓣中的低,在花茎中的表达量最低,在根中几乎检测不到。原核表达结果表明,该DFR在大肠杆菌中获得表达。从兜兰中克隆到花色代谢途径中的关键酶基因DFR,该基因可能参与调控花色素的合成。
- 李冬梅操君喜朱根发吕复兵孙映波王真
- 关键词：兜兰RT-PCR
