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国家自然科学基金(30570987)

作品数:2 被引量:24H指数:2
相关作者:王强唐萍陈建群季军杨四海更多>>
相关机构:南京大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金更多>>
相关领域:生物学农业科学更多>>

文献类型

  • 2篇中文期刊文章

领域

  • 1篇生物学
  • 1篇农业科学

主题

  • 1篇叶绿
  • 1篇叶绿体
  • 1篇正选择
  • 1篇水稻
  • 1篇水稻基因
  • 1篇水稻基因组
  • 1篇茄科
  • 1篇茄科植物
  • 1篇抗病
  • 1篇抗病基因
  • 1篇基因
  • 1篇基因转换
  • 1篇基因组
  • 1篇NBS-LR...

机构

  • 2篇南京大学

作者

  • 1篇陈建群
  • 1篇田大成
  • 1篇杨四海
  • 1篇唐萍
  • 1篇季军
  • 1篇王强

传媒

  • 1篇中国农业科学
  • 1篇遗传

年份

  • 1篇2008
  • 1篇2007
2 条 记 录,以下是 1-2
排序方式:
水稻基因组中抗病基因正选择方式及基因转换的研究被引量:9
2007年
【目的】了解正选择压力和基因转换对水稻全基因组中NBS-LRR抗病基因家族进化的影响及二者之间的相互关系。【方法】对水稻全基因组中的NBS-LRR基因进行鉴别与分类,利用PAML和GENECONV程序分别进行正选择替代和基因转换分析。【结果】在19个组(包含89个NBS-LRR基因)中检测出了显著的正选择替换位点,且约有60%正选择位点位于LRR区域;56个基因至少参与了1次基因转换事件。同时,基因转换、正选择以及基因簇之间存在明显的相关性。在84%的参与基因转换的基因中都能检测出正选择位点,且至少有84%的发生基因转换或正选择的基因都位于基因簇中。【结论】水稻基因组中的NBS-LRR基因之间,存在着频繁的正选择替代和基因转换。
季军杨四海田大成
关键词:水稻NBS-LRR正选择基因转换
茄科植物叶绿体基因组插入、缺失和核苷酸替代的发生方式及影响被引量:15
2008年
核苷酸替代和indels(插入、缺失统称)发生是进化的重要动力。以茄科植物为研究对象,探讨茄属中番茄和马铃薯、烟草属中绒毛状烟草和普通烟草分化时叶绿体基因组indels和核苷酸替代的发生方式,以及这两种突变对基因组造成的影响。结果显示:indels和核苷酸替代的发生都不是随意的。indels发生在A+T丰富的区域,1 bp indels占据总数的30%以上,大部分indels都为低于10bp的较短片段。核苷酸替代表现出Ts(转换)/Tv(颠换)偏差,但T→G,A→C颠换频率却明显增加。Ts/Tv比值出现种属特异性,番茄和马铃薯比较时替代的Ts/Tv比值低于绒毛状烟草和普通烟草比较时Ts/Tv比值。不同物种替代的(A+T)/(G+C)比值有一定差异,从而影响基因组的(G+C)%,此比值的差异与形成物种的生长习性有一定的关系。
唐萍王强陈建群
关键词:茄科植物叶绿体
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