国家高技术研究发展计划(2012AA101107-3)
- 作品数：15 被引量：65H指数：4
- 相关作者：官春云张振乾陈社员熊兴华刘聪更多>>
- 相关机构：湖南农业大学作物基因工程湖南省重点实验室更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划国家自然科学基金湖南省科技重大专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 利用转录组及iTRAQ技术筛选高油酸油菜抗病相关基因被引量：4
- 2015年
- 高油酸油菜和低油酸油菜对菌核病的抗性存在显著差异,为了弄清其分子机理,以一组高油酸油菜近等基因系自交授粉后20-35 d的种子为材料,分别进行转录组和同位素相对标记与绝对定量技术分析。分析了与抗病相关的氧化磷酸化、植物激素信号转导通路和植物病原体互作3个分类,将注释的基因和蛋白进行关联,并对其中可能与抗病相关的基因进行定量PCR验证。结合前人研究发现,基因表达或蛋白表达发生显著变化的基因gi｜260505503（多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白）、gi｜226346102（HSR203J类蛋白）、gi｜470103214（钙调蛋白类）与抗病相关;而gi｜297843222（结合蛋白）、gi｜18397961（2-铁,2-硫-铁氧化还原类蛋白）、gi｜196052306（还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚基）、gi｜18423437（还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶（辅酶）1α-复形5）和gi｜297794581（激酶家族蛋白）等基因差异显著。
- 张振乾肖钢官春云邬贤梦熊兴华李云昌胡琼陈社员
- 关键词：菌核病转录组定量PCR
- 油菜蛋白质组学研究进展被引量：3
- 2013年
- 蛋白质是生理功能的执行者,是生命现象的直接体现者,要对生命的复杂活动有全面和深入的认识,就必须进行蛋白质组学方面的研究。菜籽油是中国重要的食用油,随着油菜产业的发展,出现了各种不同的育种要求,为了达到这些目标,需要了解其分子机理,为此要加强油菜蛋白质组学方面的研究。本研究总结了油菜蛋白质提取方法及双向电泳条件优化,营养元素、低温、盐和水等胁迫方面的研究,种子、汁液、花粉、叶片、种皮、线粒体等不同组织材料的生理生化研究和抗病研究等方面的蛋白质组学研究。指出目前的研究存在一些不足之处,如没有紧密联系生产需求、研究不系统、研究方法相对滞后,如能够在今后的研究中加强,将会促进中国油菜产业的发展,保障中国的食用油安全。
- 解伟陈社员张振乾
- 关键词：油菜蛋白质组学质谱双向电泳
- 甘蓝型油菜叶面喷施植物动力2003防冻效果分析被引量：2
- 2015年
- 冻害严重影响冬油菜的生长。为揭示冬油菜抗寒机理,采用植物动力2003喷施杂1613与湘油15号油菜,以喷施清水为对照进行比较。生理指标测定结果:喷施植物动力2003的油菜叶片电导率、丙二醛含量比对照低,SOD活性、SPAD值、可溶性蛋白、可溶性糖及脯氨酸含量比对照高;2品种间的可溶性蛋白含量、SOD活性差异不大。由此表明,植物动力2003可提高油菜抗寒能力。
- 张振乾孙玉洁王国槐官春云陈社员
- 关键词：甘蓝型油菜冻害生理指标植物动力2003
- 甘蓝型油菜WRI1基因cDNA的克隆与序列分析被引量：7
- 2013年
- 通过RT-PCR方法克隆了甘蓝型油菜湘油15号5个WRI1基因cDNA。测序结果显示,BnWRI1-1大小为1 248 bp,BnWRI1-2和BnWRI1-3大小为1 254 bp,BnWRI1-4、BnWRI1-5大小为1 242 bp;聚类分析结果显示,所克隆WRI1基因cDNA在进化关系上属于AP2/ERF转录因子家族,同拟南芥AtWRI1(At3G54320)同处1个分支,并且所克隆基因cDNA来自甘蓝型油菜不同的基因组;通过核苷酸序列比对分析,得到所克隆WRI1基因cDNA单核苷酸变异位点40个;特异性酶切位点分析显示,来源于A基因组的BnWRI1-1、BnWRI1-2、BnWRI1-3第892位与来源于C基因组的BnWRI1-4和BnWRI1-5第880位的核苷酸发生变异,导致Bcl I识别位点的变化;酶切试验结果表明,采用BclI酶可区分甘蓝型油菜的AtWRI1-like WRI1基因的A或C基因组来源。
- 施春霖刘聪肖旦望陈社员官春云熊兴华
- 关键词：甘蓝型油菜CDNA
- 5个与脂肪酸代谢相关基因在油菜不同生育期表达量被引量：2
- 2016年
- 为了明晰与脂肪酸代谢相关基因在不同油酸含量油菜中的表达情况,以出苗后7 d、5~6叶期和越冬期的叶片、花瓣和授粉后20~35 d的种子为材料,对5个转录组分析得到的差异基因（Bna0691280,Bna0421530,Bna0547440,Bna0799930和Bna0764010）在高油酸油菜近等基因系中的表达情况进行研究。结果发现,在营养生长期（出苗后7 d、5~6叶期和越冬期）的叶片中,5个基因在高油酸油菜材料中的表达量均高于低油酸油菜中的表达量。在花中除Bna0547440和Bna0764010外,其它3个基因在高油酸油菜中的表达量高于低油酸油菜中的表达量。在授粉后20~35 d的种子中除Bna0799930外,其余4个基因在高油酸油菜材料中的表达量均低于低油酸油菜中的表达量。研究结果可为高油酸油菜育种和分子机理研究提供参考。
- 刘凯肖刚张振乾官春云陈社员邬贤梦
- 关键词：实时荧光定量PCR脂肪酸代谢
- 近等基因系在农作物中的应用被引量：1
- 2013年
- 近等基因系在农作物中的应用十分广泛,介绍了近等位基因系的构建,综述了近等基因系在水稻、小麦等农作物品种培育、抗病、生理生化和分子标记等方面的应用,最后对其应用研究前景进行了展望。
- 谭敏张振乾邬贤梦
- 关键词：近等基因系农作物
- 转录组学和蛋白质组学关联分析在植物研究中的应用被引量：14
- 2018年
- 转录组学与蛋白质组学是后基因组学发展的热点领域,目前转录组学和蛋白质组学在植物研究中都有了大量应用。转录组/蛋白质组学分析可获得植物转录/翻译水平上的信息,而两者关联分析能够对植物转录与翻译过程进行系统研究,从而对复杂的生命活动有全面和深入的认识,受到越来越多研究者的关注。但目前相关的研究较少,为促进该技术在植物研究中的应用,本研究综述了两者关联分析在蔬菜、大田作物、水果等植物中的应用,对当前研究存在的不足之处进行了讨论,并结合当前分子生物学技术发展,对其发展提出了一些意见和建议。
- 王晓丹肖钢张振乾肖楠陈浩官春云
- 关键词：转录组学蛋白质组学基因
- 甘蓝型油菜LPAT4基因克隆及其生物信息学分析被引量：2
- 2014年
- 为进一步研究油菜LPAT4基因,通过检索与拟南芥LPAT4序列相似度较高的油菜EST序列,拼接后与白菜和甘蓝的LPAT4序列进行同源比对,设计一对引物,从甘蓝型油菜湘油15中扩增全长LPAT4 CDs序列。共获得2条CDs序列,它们的长度分别为1 143,1 140 bp,分别命名为BnLPAT4-1和BnLPAT4-2。BnLPAT4-1编码380个氨基酸,所得蛋白质的相对分子质量和等电点分别为43.29 kDa和8.74;BnLPAT4-2编码379个氨基酸,所得蛋白质的相对分子质量和等电点分别为43.16 kDa和8.93。他们均具有LPLAT_LCLAT1样结构域,同属于LPLAT超基因家族。比较所用油菜序列SNP分析显示,LPAT4共存在41个多态性位点,其中单变异位点7个,简约信息位点34个。这41个多态性位点中,引起同义变异的位点为23个,引起取代变异的位点18个,共导致16个氨基酸发生改变。分析表明,BnLPAT4-1和BnLPAT4-2为甘蓝型油菜湘油15号LPAT4基因的2个拷贝,从序列组成、理化性质、保守结构域以及同源建模4个方面来看,它们均具备LPLAT超基因家族的特征,为该基因家族的2个成员。
- 肖旦望刘聪胡学芳邬克彬官春云熊兴华
- 关键词：甘蓝型油菜保守结构域SNP
- 甘蓝型油菜LPAT4基因的克隆与表达被引量：2
- 2014年
- 植物溶血磷脂酸酰基转移酶(lysophospholipid acid actyltransferase,LPAT)是三酰甘油生物合成过程中的一个关键酶,在脂质的合成、种子的发育以及生物膜的流动性等方面有重要作用。本研究采用同源克隆的方法,获得LPAT4基因的2条全长CDS,长度分别为1143 bp和1140 bp。生物信息学分析表明,它们均具有LPLAT_LCLAT1样结构域,同属于LPLAT超基因家族,并分别被命名为BnLPAT4-1和BnLPAT4-2。时空表达分析表明,它们均为组成型表达基因,其中BnPAT4-1在叶中的表达量最高,而BnLPAT4-2在胚中的表达量最高。逆境分析表明,BnLPAT4-1和BnLPAT4-2在NaCl、PEG-4000、水渍、6BA和ABA的胁迫下呈现出不同的表达模式。极差分析显示,ABA对BnLPAT4-1的表达影响较大,而BnLPAT4-2的表达对PEG-4000更敏感。本试验为进一步研究油菜BnLPAT4基因功能奠定了基础。
- 肖旦望刘聪胡学芳陈社员官春云熊兴华
- 关键词：甘蓝型油菜非生物逆境
- 甘蓝型油菜2个GPAT6同源基因的克隆与表达分析被引量：7
- 2014年
- 甘油-3-磷酸酰基转移酶(sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase,GPAT)是三酰甘油生物合成的关键酶,催化三酰甘油合成的起始步骤,在植物中参与调节生长发育、脂质的合成和逆境应答等过程。本试验通过RT-PCR从甘蓝型油菜品种湘油15中克隆得到GPAT6基因的2个拷贝,分别命名为BnGPAT6-1(GenBank登录号为KJ000117)和BnGPAT6-2(KC106728)。它们的编码区序列(coding DNA sequence,CDS)均为1506 bp,编码501个氨基酸。预测其蛋白结构N端含有一个类卤酸脱卤酶(haloacid dehalogenase-like hydrolase,HAD-like)活性结构域,C端含有一个溶血磷脂酰基转移酶(lysophospholipid acyltransferase,LPLAT)功能域。蛋白序列比对和进化树分析表明,甘蓝型油菜与白菜(B.rapa)、甘蓝(B.oleracea)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)和琴叶拟南芥(A.lyrata)中的GPAT6序列相似性最高。组织表达结果表明BnGPAT6基因在花中的表达量最高,在未成熟的胚中表达量呈先升高后降低的趋势。BnGPAT6的表达受ABA的抑制;在干旱和6-BA胁迫下几乎同时升高;在盐胁迫下,短时间内升高,达到峰值后降低;在水渍条件下没有明显变化。
- 刘聪肖旦望胡学芳邬克彬官春云熊兴华
- 关键词：甘蓝型油菜甘油-3-磷酸酰基转移酶基因克隆逆境胁迫
