博士科研启动基金(B-8201-08-0279)
- 作品数：4 被引量：49H指数：4
- 相关作者：李家乐冯建彬丁怀宇华雪铭李应森更多>>
- 相关机构：上海海洋大学淮阴师范学院杭州市农业科学研究院更多>>
- 发文基金：博士科研启动基金上海市科委重大科技攻关项目江苏省环洪泽湖生态农业生物技术重点实验室开放基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 洪泽湖日本沼虾9个野生群体遗传多样性微卫星分析被引量：28
- 2010年
- 利用微卫星标记分析了洪泽湖避风港、蒋坝、鲍集等9个日本沼虾(Macrobrachium nipponense)野生群体的遗传多样性。结果表明,8个微卫星位点呈现高度多态性;每个群体中至少有5个位点显示杂合不足,显著偏离了Hardy-Weinberg平衡;9个日本沼虾野生群体均表现出较高的遗传多样性水平,洪泽湖中、东部避风港和蒋坝等群体遗传多样性高于西部鲍集和界集群体。突变-漂移平衡分析表明,洪泽湖日本沼虾群体部分位点杂合显著过剩,表明洪泽湖日本沼虾群体部分位点偏离了突变-漂移平衡,但近期没有经历过瓶颈效应,群体数量也没有下降。群体间F-统计量及AMOVA分析表明,群体遗传分化极显著(F ST=0.0643,P<0.01);基于D A遗传距离构建的NJ和UPGMA聚类树均显示,地理位置相邻的群体聚在一起。结论认为,洪泽湖日本沼虾群体具有丰富的遗传多样性,在洪泽湖地区建立日本沼虾种质资源自然保护区,可以更好地有效保护洪泽湖水域的日本沼虾种质资源。
- 冯建彬吴春林丁怀宇华雪铭李应森李家乐
- 关键词：洪泽湖日本沼虾微卫星
- 日本沼虾太湖和鄱阳湖群体及其F_1的遗传结构分析被引量：5
- 2011年
- 采用12对微卫星标记分析了日本沼虾太湖、鄱阳湖两个野生群体及其双列杂交的F1的遗传结构和遗传多样性。结果显示,所用引物的平均等位基因数（Na）为17.67个,有效等位基因数（Ne）为12.48个,大小在112~427 bp之间。平均观测杂合度（Ho）为0.693 8,平均期望杂合度（He）为0.913 4。2个亲本及4个子代组合的两两遗传分化指数FST值在0.020 5~0.042 7之间,基因流（Nm）数值在5.607 5~11.957 0之间,表明日本沼虾组合间分化不明显。聚类分析结果表明,TP（太湖♀×鄱阳湖♂）组合与PT（鄱阳湖♀×太湖♂）组合,TT（太湖♀×太湖♂）组合与TH（太湖亲本）组合,PP（鄱阳湖亲本）组合与PY（鄱阳湖♀×鄱阳湖♂）组合分别先聚在一起,之后是TP,PT,TT,TH组合聚在一起,最后再与PP,PY组合聚合在一起。试验结果显示,杂交组合的观测杂合度有明显提高;杂交组合与其它组合分化不明显;杂交子代与母本的遗传结构更相似。本试验通过杂交来分析亲本及子代各个组合之间遗传多样性及遗传结构的变化情况,为日本沼虾资源保护和开发利用提供理论依据。研究亮点：试验结果发现通过杂交可以显著提高观测杂合度而不引发群体遗传结构显著分化,所以通过种内杂交可以用来丰富群体的遗传多样性和提高群体的种质状况,既可以为进一步群体选育优良品系做准备,同时,对于保护和恢复受到污染造成种质资源衰退的湖泊群体而言,又具有积极的意义。
- 李瀚声冯建彬谢楠冯晓宇李应森李家乐
- 关键词：日本沼虾双列杂交微卫星
- 钱塘江日本沼虾野生群体遗传变异的SSR分析被引量：12
- 2011年
- 利用微卫星标记分析了钱塘江干流水域闻堰、富阳、场口、桐庐等7个野生日本沼虾群体的遗传多样性和遗传结构。结果表明:10个微卫星位点呈现高度多态性;闻堰、富阳、场口、新安江等中下游野生群体的遗传多样性水平有高于歙县和休宁两个上游群体遗传多样性水平的趋势。符号检验和Wilcoxon符号秩次检验的结果表明,钱塘江日本沼虾群体近期没有发生瓶颈效应,群体数量也没有下降。FST的范围介于0.0201～0.1069。分子方差分析结果显示,大部分的遗传变异(93.48%)存在于个体间,少部分遗传变异(6.52%)存在于群体之间。群体间FST及AMOVA分析表明,群体处于中等遗传分化水平;基于DA遗传距离构建的NJ聚类树显示,地理位置相邻的群体聚在一起。STRUCTURE分析413份参试的日本沼虾样本被分为2个理论种群,即上游歙县和休宁群体为一个理想种群,其余中下游的5个群体为另一个理想种群。日本沼虾的遗传多样性和遗传结构与所生存的地理位置具有相关性。
- 马克异冯建彬谢楠冯晓宇李家乐
- 关键词：日本沼虾微卫星
- 日本沼虾微卫星引物筛选及群体遗传多样性分析被引量：18
- 2010年
- 采用(CT)15、(CA)15两种生物素标记及磁珠富集法构建了太湖日本沼虾基因组微卫星富集文库。120个微卫星克隆中83个位点的核心序列重复在10个以上,长度介于191～580bp,平均为311bp;重复类型中,(CA/GT)n及(AG/TC)n分别占59.09%及20.45%,还检测到(GC)n、(AAG)n、(ACAA)n和(GGCAGA)n等17种类型,包括25.75%完美型、20.45%非完美型和53.80%复合性。用其中12条微卫星引物扩增吴江、滨湖、宜兴和吴兴4个群体240个个体的基因组DNA,各位点表现出较高的遗传多样性,除Mni86、Mni103和Mni114外,其它群体位点大都表现出显著的杂合子缺失,4个群体的遗传分化为低度分化(FST<0.05),4个群体中97.58%遗传变异存在于群体内,仅有2.42%的遗传变异来自于群体之间;吴江和吴兴群体亲缘关系最近,与宜兴和滨湖群体亲缘关系渐远。
- 冯建彬马克异李家乐华雪铭丁怀宇
- 关键词：日本沼虾微卫星引物
