引进国际先进农业科技计划(2011-G12) 作品数:37 被引量:234 H指数:8 相关作者: 孙效文 常亚青 丁君 李超 鲁翠云 更多>> 相关机构: 大连海洋大学 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所 上海海洋大学 更多>> 发文基金: 引进国际先进农业科技计划 国家高技术研究发展计划 公益性行业(农业)科研专项 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 经济管理 环境科学与工程 更多>>
镜鲤头长及头长体长比性状的主效QTL挖掘 被引量:2 2014年 为挖掘镜鲤头长及头长体长比性状的主效QTL区间,实验利用368个SSR、336个SNP标记对镜鲤良种后代杂交F1群体的68个个体进行基因型检测,运用JoinMap 4.0软件包构建遗传连锁图谱。该图谱包含535个分子标记并被分配到50个连锁群上,覆盖基因组总长度为2 244.66 cM,标记间平均距离为4.63 cM。利用MapQTL 5.0(interval mapping,IM)区间作图法进行QTL检测。结果显示,共得到2个与头长相关的QTL区间,分别分布在LG21和LG42,可解释型变异分别为28.2%、32.6%;6个与头长体长比性状相关的QTL位于LG8、LG15、LG18、LG21、LG39、LG40,可解释表型变异范围是16.4%-49.3%。全部QTL区间中贡献率大于20%的主效QTL有7个,HL-21和HL-42是头长性状的主效区间;HBR-8、HBR-15、HBR-21、HBR-39和HBR-40是头长体长比性状的主效QTL区间。利用SPSS的一般线性模型(GLM)针对另一群体进行验证,结果表明HLJ692与镜鲤头长体长比显著相关。 单云晶 鲁翠云 张晓峰 李超 程磊 孙效文关键词:镜鲤 遗传连锁图谱 大口黑鲈GHRH基因启动子区域序列分析及其活性检测 被引量:5 2016年 生长激素释放激素(growth hormone releasing hormone,GHRH)是下丘脑弓状核合成和分泌的小分子多肽,其主要功能是调节垂体细胞合成和释放生长激素。为研究大口黑鲈(Micropterus salmoides)GHRH基因5’侧翼启动子区域的活性和该区域中潜在的转录因子对GHRH基因表达的调控作用,对该基因5’端启动子区域约1400 bp长度的片段进行序列分析,预测顺式作用元件,获得了Oct-1、SP1、NF-1、C/EBPalp和C/EBP等多个潜在的调控GHRH基因表达的调节因子结合位点序列。在包括外显子1和内含子1的GHRH基因5’侧翼区两侧加入两个限制性酶切位点Xho I和Bam H I,对其进行改造,并将该片段插入红色荧光蛋白报告基因载体p DsRed2-1,构建了重组表达质粒pGHRH1-RFP。同时,用不含有外显子1和内含子1的GHRH基因5’侧翼区构建重组表达质粒p GHRH-RFP。将质粒pGHRH1-RFP和p GHRH-RFP转染鲤(Cyprinus carpio)上皮细胞(epithelioma papillosum cyprinid,EPC)。经过48 h的培养,在pGHRH1-RFP转染的部分细胞中检测到红色荧光蛋白表达。又将pGHRH1-RFP或p GHRH-RFP质粒注射到斑马鱼(Danio rerio)一细胞或二细胞期的胚胎中,注射了pGHRH1-RFP的胚胎在受精后48 h约有22.5%能检测到有红色荧光蛋白表达,受精后72 h约有29%的仔鱼检测到红色荧光蛋白表达。实验结果表明,目前分离到的GHRH基因5’侧翼序列具有启动基因表达的活性,且该基因的内含子1和外显子1是启动子的活性所必需的。另外,pGHRH1-RFP质粒注射的斑马鱼胚胎只能在胚胎和仔鱼的脊椎和肌肉中检测到RFP的表达,而在脑中没有检测到表达。推测扩增到的大口黑鲈GHRH启动子序列1407 bp(-1043 bp^362 bp)只是起到了驱动RFP脊椎和骨骼肌表达的作用,而不包括驱动在脑组织中特异性表达的启动子,本研究为GHRH基因功能的深入分析奠定了基础。 马冬梅 韩林强 白俊杰关键词:生长激素释放激素 启动子活性 大口黑鲈 中国对虾对白斑综合征病毒的类免疫反应与验证 被引量:7 2012年 对中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)能否产生类免疫保护作用进行了初步探讨。将健康的中国对虾接种经不同辐照强度γ射线灭活的白斑综合征病毒(white wpot wyndrome virus,WSSV),连续投喂接种20 d后,对其存活个体进行抗WSSV性能测试,检验其存活情况。结果显示,至216 h实验组(射线辐照剂量分别为5 kGy、10 kGy、15 kGy和20 kGy)存活率分别为45.5%、54.2%、68%和65.4%,存活对虾的病毒携带量分别为(14.0±11.9)、(14.1±4.3)、(24.5±15.0)和(15.1±7.8)copies/ng DNA,死亡对虾病毒携带量分别为(2.1±2.0)×105、(5.2±4.4)×105、(3.8±4.4)×105和(6.2±7.7)×105copies/ng DNA,阳性对照组存活率为20%,其存活和死亡对虾病毒携带量分别为(24.7±7.4)×105copies/ng和(5.8±6.9)×105copies/ng DNA。以上结果说明,中国对虾可能存在类免疫保护作用,而且通过接种经γ射线灭活的WSSV能够提高对虾后续抗感染能力。研究结果旨为采用免疫学手段预防对虾白斑综合征提供参考。 李战军 孟宪红 孔杰 单从文 罗坤 栾生 常亚青关键词:中国对虾 Γ射线 白斑综合征病毒 大口黑鲈“优鲈1号”生长相关优势基因型的分析 被引量:1 2014年 大口黑鲈(Micropterus salmoides)“优鲈1号”是经多年选育获得的生长性状改良的养殖新品种,与非选育大口黑鲈相比,生长速度提高了17.8%一25.3%。为了研究具有生长相关优势基因型经聚合后对生长性状的改良起的贡献作用大小,本研究从大口黑鲈“优鲈1号”与非选育大口黑鲈群体中各随机挑选140ind,应用STR基因分型技术检测8个生长相关分子标记在这两个群体中的分布情况。8个生长标记中有4个微卫星位点,分别为JZL60、JZL67、MisaTpw76和MisaTpwll7,其余4个是单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,分别位于胰岛素样生长因子-I(insulin—like growth factor—I,IGF-I)、肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)、垂体特异性转录因子(pituitary specific transcription factorl,POUlFl)和生长抑素前体(preprosomatostatin,PSSIII)基因上。结果表明,“优鲈1号”与非选育群体中优势基因型的数量为1—6个,两个群体含有的平均数量分别为2.606、2.312,表明人工选育在一定程度上聚合了优势基因型,研究结果为下一步生长性状相关标记的聚合及辅助选育应用提供参考依据。 徐磊 白俊杰 李胜杰 樊佳佳关键词:大口黑鲈 短串联重复序列 基因聚合 基因分型 源于鳞被相关基因的微卫星标记与鲤4种生长性状的相关性分析 被引量:1 2014年 选用来源于鲤基因组中的鳞被相关基因(ant、eda、edar、fgfr)及其上下游序列中的155个微卫星标记,对德国镜鲤(Cyprinus carpio L.)与黑龙江野鲤(Cyprinus carpio haematopterus)杂交的F2 116尾个体的遗传多样性进行检测,以卡方检验估计群体Hardy-Weinberg平衡。结果表明,36个微卫星标记表现为多态,各标记的等位基因数在2~4个浮动,共检测到86个等位基因,平均每个标记2.388 9个;平均有效等位基因数为2.209 4;平均观测杂合度为0.624 5;平均期望杂合度为0.529 2;平均多态信息含量为0.432 1,其中23个微卫星标记表现为中度多态(0.25≤PIC<0.5),13个微卫星标记表现为高度多态(PIC≥0.5),说明这个群体属于中度多态性水平。Hardy-Weinberg平衡检验结果显示,61%标记显著偏离平衡,人工选择压力和自交对家系造成了严重的影响。SPSS 17.0分析发现分别有10(28%)、7(19%)、7(19%)和11个(31%)标记与体质量、体长、体高和体厚存在显著相关性,并发现11个优势基因型。源于鳞被相关基因的微卫星标记与生长性状连锁的比例较高,以上结果从分子水平上提示鳞被基因与所研究4种生长性状存在一定的相关性。 肖同乾 鲁翠云 李超 曹顶臣 程磊 孙效文关键词:生长性状 微卫星标记 鲫体重和体厚相关的EST-SSRs标记筛选及同源基因分析 被引量:1 2013年 利用300个EST-SSRs标记对普通二倍体鲫(Carassius auratus)自交F2代的181个个体进行基因型检测,并对其体重、体厚两种经济性状进行单标记回归分析。Permutation检验(10 000次)结果显示,38个标记与所检测的经济性状相关,其中26个标记达到显著性相关(P<0.05),12个标记达到极显著性相关(P<0.01)。在38个相关标记中,有27个标记与体重相关,25个标记与体厚相关,14个标记与体重、体厚均相关。对同一标记的不同基因型之间进行多重比较,找到了与两种经济性状相关的基因型。将与性状相关的38个标记与斑马鱼(Da-nio rerio)基因组序列进行BLAST同源性比对,找到10条相似性高且功能已知的EST-SSRs序列(E 郭薇 郑先虎 匡友谊 崔晓亮 曹顶臣 孙效文关键词:EST-SSRS 体重 三个鲤品种微卫星丰度与遗传多样性分析 被引量:8 2013年 鲤(Cyprinus carpio)是世界上分布最广的淡水鱼类,由于地理隔离、突变、自然和人工选择等原因,在我国历史上形成了许多鲤鱼品种,如分布于江西省婺源县的荷包红鲤( Cyprinus carpio var. wuyuanensis)和兴国县的兴国红鲤(Cyprinus carpio var. singuonensis),它们都有近千年的养殖历史。这两个红鲤品种是我国优良的鱼类遗传育种材料,曾作为亲本生产了许多有较高经济价值的杂交种。 曾繁振 俞小牧 童金苟关键词:微卫星 丰度 虾夷扇贝选育新品系与常规养殖群体经济性状比较分析 随机抽取大连海洋大学培育的虾夷扇贝'象牙白'新品系2龄贝162枚及对照组虾夷扇贝常规养殖群体2龄贝123枚,测量其壳长(X)、壳高(X)、壳宽(X)、壳重、活体重(Y)、软体重(Z)和闭壳肌重(m),计算其相关系数。采用... 商国良 常亚青 丁君关键词:虾夷扇贝 出肉率 文献传递 中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)多性状复合育种方案的遗传和经济评估 被引量:5 2013年 设计中国对虾Fenneropenaeus chinensis多性状复合育种方案,模拟选择20个世代,预测和评估目标性状(收获体重(BW),存活率(SR)和饲料摄入量(FI))的遗传进展及经济效益。利用选择指数理论,估计目标性状的选择反应和遗传进展;通过三级金字塔传递系统(核心群、扩繁群和生产群)放大遗传进展并计算其经济效益;对影响利润(RP)和效益成本比率(BCR)的生物学参数(遗传力、育种目标是否包括FI),经济学参数(对虾价格、饲料价格、贴现率、初投资、年费用)和运行参数(首次回报年份、扩繁效率)进行敏感性分析。结果表明,在基础参数值下,BW、SR和FI每个世代的选择反应分别为0.81g、1.41%和1.30g;以1 000尾虾为单位计算,BW、SR和FI的经济加权值分别为32元,20元和-8元,育种目标的遗传进展为43.69元,育种方案执行20年产生的RP和BCR分别为8 660.99万元和14.34。敏感性分析显示,生物学参数中,目标性状遗传力变化对RP和BCR影响程度中等,遗传力值越高,RP和BCR越大;将FI经济加权值设为0,育种方案的RP和BCR明显高于基础参数。经济学参数中,对虾价格的变化对RP和BCR影响较大;饲料价格、贴现率和年费用的变化对RP和BCR影响较小,但初投资变化对BCR影响较大。运行参数中,首次回报年份越晚,RP和BCR越低。扩繁效率是影响RP和BCR的最重要因素。高扩繁效率下,生产群规模扩大1 736.15%,RP和BCR分别提高1 866.92%和1 736.75%。 栾生 金武 孔杰 罗坤 孟宪红 张天时 王清印关键词:利润 不同壳性状虾夷扇贝体腔液三种酶活力的比较 被引量:1 2015年 研究利用生物化学方法对不同壳性状虾夷扇贝体腔液中超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化氢酶(CAT)和过氧化物酶(POD)活力进行比较分析。结果表明,不同贝壳形态的虾夷扇贝,其体腔液中SOD、CAT和POD 3种酶活力不存在著性差异(P>0.05);不同壳色虾夷扇贝体腔液中,SOD和CAT酶活力存在显著差异(P<0.05),而POD酶活力差异并不显著。研究结果显示,虾夷扇贝的贝壳形态与其体腔液中抗氧化酶活力高低不存在相关性,而虾夷扇贝贝壳的壳色性状与其体腔液中抗氧化酶SOD和CAT活力高低存在一定的相关性。研究结果可为深入研究扇贝贝壳性状积累一定的理论数据,同时也对扇贝的良种选育具有一定的指导意义。 段立柱 黄显雅 胡婉彬 刘敏博 湛垚垚 丁君 郝振林 常亚青 于瑶 明月关键词:虾夷扇贝 体腔液 过氧化氢酶 过氧化物酶