国家科技重大专项(2009ZX08001-005B) 作品数:13 被引量:101 H指数:6 相关作者: 王军 杨杰 仲维功 范方军 刘凤权 更多>> 相关机构: 江苏省农业科学院 南京农业大学 安徽农业大学 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 国家科技支撑计划 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
杂草稻红色果皮基因的功能标记开发 被引量:8 2009年 红色果皮是杂草稻的基本特征之一,为了给杂草稻的分子鉴定提供依据,本研究根据已克隆的普通野生稻(Oryza rufipogen)红色果皮Rc与白色果皮rc等位基因第6外显子的差异,设计了InDel标记RID14。利用RID14标记对F2群体和江淮流域所收集到的24份红色果皮杂草稻、3份普通野生稻以及21份品种资源进行了标记基因型分析。研究表明,红色果皮均为非缺失带型,而白色果皮和紫色果皮为缺失带型,F2群体中杂合带型和非缺失带型均为红色果皮,而缺失带型为白色果皮。因此,RID14标记与白色果皮和红色果皮共分离,可以作为鉴定红色果皮杂草稻的分子标记。 杨杰 王军 曹卿 陈志德 汤陵华 仲维功关键词:杂草稻 灰飞虱共生菌groEL基因的克隆、生物信息学分析及其植物双元表达载体构建 2010年 本研究克隆了江苏南京地区灰飞虱(Laodelphax striatellus Fallén)体内共生菌Wolbachia的groEL基因全长序列。序列分析表明,其开放阅读框为1659bp,编码552个氨基酸残基,分子量为58.884kD,等电点为5.01。序列比对发现克隆的groEL基因与已登录的groEL基因(登录号:EF468716)起始密码子下游424bp处存在一个核苷酸的差异,与另一groEL基因(登录号:DQ356890)完全一致。利用PROTEIN DATA BANK在线软件对灰飞虱的groEL蛋白立体结构进行预测,结果表明灰飞虱的groEL蛋白为同型寡聚复合物,具有分子伴侣功能。本研究进一步构建了含该groEL基因和潮霉素基因的双元表达载体,为下一步转化水稻奠定了基础。 曹卿 杨杰 王军 范方军 仲维功 张玉琼 张云华关键词:灰飞虱 共生菌 WOLBACHIA GROEL 生物信息学分析 分子伴侣 直立穗基因qPE9-1基因标记的开发及利用 水稻理想株型是高产形成的基础,直立穗品种表现出耐肥抗倒,较好的群体通风透光条件,较高的光合效率和增产潜力.为了给直立穗型品种的分子鉴定提供依据,本研究根据已克隆的水稻直立穗基因qPE9-1和弯曲穗基因qpe9-1第5个外... 朱金燕 王军 杨杰 范方军 杨金欢 仲维功水稻启动子OsN1p的克隆与功能分析 被引量:2 2012年 将OsN1基因上游881 bp启动子(OsN1p)序列取代pBI121中gus基因上游的35S启动子,构建植物表达载体pBIN1p,经农杆菌介导转化水稻品种‘日本晴’,获得转基因植株。GUS组织化学染色结果表明,由该启动子驱动的gus基因能在愈伤组织中较低水平地表达;稻瘟病菌接种转基因植株24 h后,GUS活性为未接种前的4.2倍;5 mmol.L-1水杨酸(SA)和0.5 mmol.L-1茉莉酸甲酯(MeJA)分别喷施转基因植株叶面6 h后,GUS活性分别为处理前的5.9和2.4倍。表明,OsN1p启动子具有启动活性,同时明显具有受稻瘟病菌、SA和MeJA诱导表达的特性。 吴智丹 王光 郭玲 李林 刘凤权 邵敏关键词:转基因水稻 GUS基因 稻瘟病菌 基于CSSSLs的水稻穗长QTL的定位 被引量:13 2012年 穗长是影响水稻产量的重要因子之一,是典型的数量性状,遗传基础复杂,且易受环境等因素的影响。染色体单片段代换系(Chromosome single segment substitution lines,CSSSLs)减少了个体间遗传背景的干扰,是鉴定复杂性状QTL的新型遗传材料。本研究以广陆矮4号为受体、日本晴为供体的85个染色体单片段代换系群体为试验材料,通过单因素方差分析和Dunnett's多重比较测验单片段代换系与受体亲本广陆矮4号之间穗长的差异,对代换片段上穗长QTL进行了鉴定。以P<0.001为阈值,共检测到22个穗长QTLs,分布于除第10染色体以外的11条染色体上,其加性效应值的变化范围为-2.63~3.87,加性效应百分率变化范围为-11.47%~16.88%。这些QTLs的鉴定,为进一步克隆穗长QTL以及水稻穗长的分子改良提供了重要的依据。 王军 朱金燕 周勇 杨杰 王中德 范方军 梁国华 仲维功关键词:水稻 穗长 单片段代换系 QTL 水稻细菌性条斑病菌RpfCxoc/RpfGxoc双组分系统的功能 被引量:6 2012年 【目的】旨在阐明双组分系统RpfCxoc/RpfGxoc在水稻细菌性条斑病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzicola,Xoc)DSF(diffusible signal factor)合成、致病性等相关方面的生物学功能。【方法】以Xoc野生型菌株Rs105为母体,利用自杀载体pK18mobsacB缺失突变rpfCxoc、rpfGxoc和rpfGCxoc(rpfCxoc和rpfGxoc双基因),测定突变体及其互补菌株的DSF合成水平、对水稻的致病性、胞外多糖(extracellular polysaccharide,EPS)产量、菌体形态及群体结构。【结果】从Rs105基因组中克隆了rpfCxoc和rpfGxoc基因,并获得了相应的单基因或双基因缺失突变体。与Rs105相比,ΔrpfCxoc和ΔrpfGCxoc过量合成DSF信号分子,但是ΔrpfGxoc合成DSF的能力显著下降;rpfCxoc和rpfGxoc单基因或双基因的缺失突变均导致Xoc的致病性丧失,EPS合成水平下降34.1%-48.5%,形成菌体高度聚集的生物膜结构。【结论】RpfCxoc/RpfGxoc双组分系统调控Xoc的DSF生物合成、EPS产生和生物膜的驱散,是Xoc保持致病性所必需的因子。 赵延存 刘春晖 钱国良 殷芳群 周奕景 宋志伟 刘凤权关键词:水稻细菌性条斑病菌 DSF 毒性 生物膜 利用染色体单片段代换系定位水稻株高QTL 被引量:5 2011年 株高是典型的数量性状,易受遗传背景的干扰和环境因素的影响,利用单片段代换系(single segment substitution lines,SSSLs)能减少遗传背景的干扰。以85个单片段代换系为材料,其受体亲本为籼稻广陆矮4号(Oryzasativassp.in-dica),供体亲本为粳稻日本晴(Oryza sativa ssp.japonica)。通过单因素方差分析和Dunnett’s多重比较,分析单片段代换系与受体亲本之间株高的差异,对代换片段上的株高QTL进行鉴定。以P≤0.001为阈值共检测到24个株高QTLs,分别分布于除第10染色体外的其它11条染色体上,其中3个QTLs的加性效应表现为减效作用,另外21个株高QTLs的加性效应表现为增效作用。QTLs加性效应变化范围为-6.5-31.74,加性效应百分率的变化范围为-8.81%-41.96%。该研究对进一步发掘和利用新的矮秆或半矮秆基因资源具有重要意义。 朱金燕 嵇朝球 周勇 王军 王中德 杨杰 范方军 梁国华 仲维功关键词:株高 数量性状位点 水稻 单片段代换系 香软米携带的香米等位基因的分子检测 被引量:1 2012年 利用香米等位基因fgr的2对InDel标记InDel-E2、InDel-E7,对香稻新材料香软米的香味基因进行分子检测,结果表明:香软米携带有第2个外显子缺失7 bp的香米等位基因。 杨金欢 虞利俊 田胜尼 杨杰 王军 朱金燕 范方军 仲维功关键词:水稻 香味 基因 分子检测 水稻多酚氧化酶基因功能标记的开发与应用 水稻酚反应是水稻分类的重要依据。控制水稻酚反应的多酚氧化酶基因(PPO)已经克隆,根据其等位基因的DNA序列差异设计了InDel功能标记FMppo-18和FMppo-29。利用这两个标记对45份品种资源材料进行了标记基因... 杨杰 王军 范方军 曹卿 张玉琼 仲维功关键词:多酚氧化酶 水稻 分子标记ST10对水稻条纹叶枯病抗性基因Stv-b^i的检测 被引量:8 2009年 近年来,利用与抗病基因紧密连锁的分子标记进行辅助选择已经成为抗病育种的重要手段。本研究利用显性标记ST10对24个水稻品种以及24个水稻品种中的镇稻88/武育粳3号和武运粳7号/徐稻3号的2个F2群体进行检测。PCR结果显示,17个抗病品种有8个能扩增出约727bp的目标片段;在镇稻88/武育粳3号杂交组合中,感病亲本武育粳3号和F2群体中的8个感病单株均不能扩增出目标片段,抗病亲本镇稻88、F1和13个不感病单株中的11株都能够扩增出目标片段;用于检测的武运粳7号/徐稻3号的F2群体中,8株感病单株没有检测出目标片段,而13株不感病的单株有9株扩增出目标片段。结果表明,ST10与条纹叶枯病抗性基因Stv-bi紧密连锁,表现为共分离。 王军 杨杰 曹卿 陈志德 范方军 仲维功关键词:水稻 条纹叶枯病