四川省卫生厅科研基金(100553)
- 作品数：4 被引量：29H指数：3
- 相关作者：孙明伟江华蔡斌曾俊蒋忠宁更多>>
- 相关机构：四川省医学科学院(四川省人民医院)四川省医学科学院中国医学科学院更多>>
- 发文基金：四川省卫生厅科研基金四川省自然科学基金四川省科技厅科技支撑计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 急性心肌梗死早期基因表达和代谢调控网络扰动的可视化研究被引量：2
- 2013年
- 目的应用系统生物学方法，研发一种基于转录组表达谱的基因网络可视化工具，以直观显示急性心肌梗死后早期的转录组和代谢调控的整体变化。方法在美国国立卫生研究中心（NCBI）GEO数据库下载编号为GDS2331的一个急性心肌梗死后大鼠心脏左心室的基因芯片表达文件，其平台编号为GPL83。筛选实验时间在15min，60min，4h，12h，24和48h的假手术和急性心肌梗死模型亚组数据，利用Mathwork bioinformatics toolbox工具包将数据转化为计算机可读的结构体。利用模式识别算法剔除表达背景噪声；最后获得心肌梗死建模后表达模式扰动最明显的基因谱。利用K—mean算法对这些基因进行分类，并进行基因本体分析（gene ontology，GO）。进而将有关通路标定在京都基因和基因组百科数据库（kyoto encyclopedia of genes and genomes，KEGG）中，形成基因组．表达谱系统分析。结果共有1400个基因被筛选出来。在损伤后的前48h，这些基因的变化模式可归为16类。根据可以获得基因本体分析发现：在生物学过程上，心肌梗死后早期调控发生改变主要和发育基因相关，其中主要包括蛋白激酶B信号传导途径，中枢神经系统发育途径，以及cytochalasin B调控相关途径。在分子功能上，这些功能主要和磷酸化，肌动蛋白的结合以及核酸的配对解离有关。在细胞成分上，主要与细胞内外膜相结构之间的联系、高尔基复合体、出胞作用、以及细胞骨架特别是dynactin complex等结构有关。KEGG作图标记可显示在分子调控传导路径当中，受到影响的基因很可能通过该传导通路的上下游分子进行调控。如以肌动蛋白为核心的细胞骨架信息传导途径的调控中，GF RTK Vav／tiam Rac mlCK Myosin整个调控途径中的分子都有相同的调控模式。结论利用系统生物学技术可以实现急性心肌梗死后基因表达波动模式的�
- 蔡斌江华潘海霞蒋忠宁陈伟杨浩周志远胡卫建Charles Damien Lu彭谨
- 关键词：急性心肌梗死可视化生物统计系统生物学
- 基于数据挖掘的地震创伤患者入院后结局预测模型被引量：3
- 2014年
- 目的模式识别技术（PRT）是一种挖掘重要信息的新型工具，可以从海量数据中提取新的知识。基于汶川特大地震中创伤患者的数据，笔者采用PRT建立地震伤员结局预测模型，旨在为提高灾难医学救援水平提供一种新的方法。方法采用回顾性数据挖掘方法，数据来自于四川省医学科学院创伤数据中心2008年5月12日至20日收治的2316例住院地震伤患者病例信息。将患者资料按照生存与死亡、是否发生多器官功能不全综合征（multiple organ dysfunction syndrome，MODS）分组。根据正态性分布检验结果，计量资料以均数±标准差（x-±s）或者中位数（四分位数）表示，统计检验采用StudentT检验或者Wilcox检验；计数资料采用构成比表示，统计检验采用X^2检验或者Fisher检验。多元统计分析采用偏最小二乘法判别分析（partial least square-discriminant analysis, PLS-DA）。多元聚类图采用二维主成分的PLS的投影图，并采用重要性投影指标值（variable important projection, VIP）筛选与临床结局相关的重要变量，工效曲线（receiver operating characteristic curve, ROC）作变量灵敏性分析。结果经数据清理后1919例患者的病例资料纳入研究；筛选出31项人口学指标、生理一生化指标以及干预因素作为暴露参数；获得36例院内死亡病例和17例MODS病例。MODS相关病死率为47．1％。经过PLS．DA分析，二维主成分得分图可以辨识出生存、MODS和死亡模式。对病死率和MODS进行预测，ROC曲线下面积（areaunder curve，AUC）分别为0．882和0．979。PLS-DA的重要性投影指标值（VIP）确定了8项生理指标（pH，BE，PaCO2，PaO2，HCO3^-1，SBHC03，Cr和首日补液量）构成了与院内死亡和MODS发生的相关模型。结论研究建立了一项可以预测特大地震创伤入院患者预后模型（由人院接受创伤治疗的生理-生化指标集合和液体复苏干预构成）�
- 孙明伟江华蔡斌彭谨杨浩周志远陈伟Charles Damien Lu曾俊
- 关键词：地震伤创伤多器官功能损害数据挖掘病例对照
- 加速康复外科对胃肠道恶性肿瘤术后病人临床结局的影响被引量：16
- 2013年
- 目的:系统评价加速康复外科(FTS)对接受手术治疗的胃肠道恶性肿瘤病人临床预后和治疗费用的影响。方法:检索中国生物医学文献数据库(CBM)、中国知网(CNKI)和维普数据库(VIP),鉴定随机对照研究(RCT)。纳入标准:①采用随机对照的临床研究,设立平行对照,正确描述随机化方法;②因胃肠道恶性肿瘤接受根治性切除手术;③是否接受围术期FTS干预,是两组唯一差异;④报告至少一项临床结局指标,包括术后并发症、住院时间、肠道功能恢复时间(肛门排气排便)和费用。研究的方法学质量按Cochrane评价员手册及改良Jadad评分表进行评估。用RevMan 5.0软件进行Meta分析。结果:在113篇相关文献中,共5个随机对照研究符合全部纳入标准。术后并发症共有4个研究报道296例病人中发生的51起术后并发症,合并相对风险度(RR)=1.05,95%CI为0.64,1.72(P=0.85),两组并发症风险无显著性差异(P>0.05)。住院时间采用随机效应模型合并,合并均数(MD)=-3.04,95%CI为-4.06,-2.03(P<0.01)。肠功能恢复时间共有5个研究报道356例病人肛门恢复排气时间。FTS组与对照组比,肠道功能恢复时间缩短约1 d。共有3个研究报道236例病人的住院费用,与对照组比,FTS组病人总住院费用约减少2 850元。结论:胃肠道恶性肿瘤手术病人接受围术期FTS干预,可缩短术后胃肠功能恢复时间和住院时间,减少住院治疗费用。但对降低病人术后的并发症则不明显。
- 余阳艳孙明伟蔡斌刘婕张薇江华曾俊
- 关键词：加速康复外科胃肠道恶性肿瘤择期手术META-分析
- 急诊患者等候时间与处置时间现状调查与分析被引量：8
- 2012年
- 目的:了解急诊患者在急诊科就诊的等候时间与处置时间现状,分析影响急诊患者就诊时间的相关原因,为减少患者等候时间提供依据。方法:采用人口学相关资料调查表和就诊时间调查表对就诊患者进行问卷调查,并收集患者在整个就诊流程中每个步骤所耗费时间的相关数据,采用SPSS13.0统计学软件进行分析。结果:患者在急诊科的平均等候时间(30.3±11.2)min,处置时间(2.8±1.6)min,抢救室患者的处置时间是(20.0±9.3)min。急诊患者在急诊科的总体停留时间是(78.3±20.5)min,高危病人在急诊的等候时间和处置时间均是最短。结论:急诊科可以通过缩短患者检查结果等候时间、分诊时间、治疗等候时间等提高急诊患者处置速度,提高患者及家属满意度。
- 蒋忠宁孙明伟
