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国家自然科学基金(30671855)

作品数:7 被引量:18H指数:3
相关作者:曾争田地崔建军席宏丽于敏更多>>
相关机构:北京大学第一医院国家人口计生委科学技术研究所更多>>
发文基金:国家自然科学基金国际科技合作与交流专项项目国家科技重大专项更多>>
相关领域:医药卫生生物学更多>>

文献类型

  • 7篇中文期刊文章

领域

  • 6篇医药卫生
  • 1篇生物学

主题

  • 3篇乙型
  • 3篇基因
  • 3篇HBV
  • 2篇多态
  • 2篇多态性
  • 2篇乙型肝炎
  • 2篇突变
  • 2篇转归
  • 2篇基因多态性
  • 2篇干扰素
  • 2篇肝炎
  • 2篇感染者
  • 2篇病毒
  • 1篇信号
  • 1篇信号传导
  • 1篇信号传导通路
  • 1篇阳性
  • 1篇乙型肝炎病毒
  • 1篇乙型肝炎病毒...
  • 1篇乙型肝炎病毒...

机构

  • 6篇北京大学第一...
  • 1篇国家人口计生...

作者

  • 6篇曾争
  • 3篇崔建军
  • 3篇田地
  • 2篇于敏
  • 2篇席宏丽
  • 1篇田国保
  • 1篇于岩岩
  • 1篇郑颖颖
  • 1篇尹胜杰
  • 1篇王彬彬
  • 1篇黄中红
  • 1篇张独佾
  • 1篇田国宝
  • 1篇白晓燕
  • 1篇田庚善
  • 1篇陆海英
  • 1篇郑金鑫
  • 1篇王芳

传媒

  • 2篇临床肝胆病杂...
  • 1篇北京医学
  • 1篇遗传
  • 1篇中华肝脏病杂...
  • 1篇国际病毒学杂...
  • 1篇Virolo...

年份

  • 1篇2020
  • 1篇2019
  • 1篇2014
  • 1篇2011
  • 3篇2008
7 条 记 录,以下是 1-7
排序方式:
干扰素信号传导通路与其基因组多态性网络模型的建立被引量:5
2008年
通过检索Pubmed、Embase数据库,整合文献资料,运用Teranode Design Suite(TDS)生物软件,建立干扰素(IFN)发挥生物学作用的信号传导通路。应用SNP Trawler软件搜索通路中相关基因的SNP信息,并以属性形式在通路模型中给以显示。结果构建了融合基因的遗传信息尤其是SNP相关信息的IFN发挥生物学作用的信号传导通路的网络模型,此模型共包含JAK-STAT,MAPK-p38和PI3K3条主要传导通路,干扰素通过不同的信号传导通路发挥不同的生物活性,其中Ⅰ型干扰素通过这3条通路发挥抗病毒、抗细胞增殖及免疫调节等重要作用,而Ⅱ型干扰素则通过JAK-STAT和MAPK-p38路径发挥生物学作用,Ⅲ型干扰素则仅通过PI3K通路发挥生物学作用;这3条传导通路包含98个基因和19693个SNPs,组成了复杂的基因间相互作用网络。此通路模型的成功建立,一方面为研究SNP对IFN生物学作用的影响而预测IFN疗效提供理论基础,另一方面为实现个体化诊疗、发现新的药物作用靶点及开发新的药物奠定基础。
崔建军田庚善田地曾争
关键词:干扰素信号传导通路基因多态性
中国西部、北部地区410例汉族病例乙型肝炎病毒基因型与肝病转归的相关性研究被引量:2
2008年
目的探讨乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)基因型与肝病转归的关系。方法随机选取中国西部、北部地区汉族HBV感染者DNA含量104以上者410例,煮沸法提取HBV基因组模板,PCR扩增S区基因,应用自动测序仪测定目的基因序列,进行基因分型,应用SPSS10.0软件统计分析。结果C型占91.95%,B型占6.83%,B、C混合型占0.24%,D型占0.98%。疾病进展研究分4种情形对基因型C、基因型B进行单因素方差分析:慢性病毒携带者(ASC),慢性乙型肝炎(chronic hepatitisB,CHB),肝硬化(liver cirrhosis,LC),原发性肝细胞性肝癌(primary hepatocellular carcinoma,HCC)。统计显示,感染基因型C后CHB更易发展为LC和(或)HCC,有统计学意义,但两基因型之间LC发展为HCC差别无统计学意义。LCvs.(CHB+HCC)统计显示:两组在基因型方面虽无统计学差异,但从Means Plots可以看出感染基因型C向肝硬化或肝细胞癌方向发展的趋势更明显。结论中国西部、北部汉族HBV感染者中以感染基因型C为主,且感染基因型C较基因型B更容易发展为严重的肝病。
黄中红田国宝崔建军田地于敏席宏丽陆海英曾争
关键词:乙型肝炎病毒基因型转归
APOBEC3G基因多态性与HBV感染后疾病转归的关系被引量:2
2008年
目的研究中国汉族人群载脂蛋白BmRNA编辑酶催化多肽3G(APOBEC3G)基因多态性与慢陆乙型肝炎和肝硬化的关系。方法应用焦磷酸测序,检测202例HBV感染自然痊愈者(对照组)、217例慢性乙型肝炎患者和216例乙型肝炎肝硬化患者APOBEC3G基因rs8177832位点多态性,确定其基因型及等位基因分布。同时通过建立DNA池技术初步对APOBEC3G基因的另外4个标签单核苷酸多态性位点(tagSNP)rs17000736、rs17496046、rs9622924和rs2899313进行疾病相关性的初步筛选;HBVDNA检测采用实时定量PCR。结果rs8177832在中国汉族人群中以A/A为主要存在形式,其基因型频率和等位基因频率在对照组、慢性乙型肝炎组和乙型肝炎肝硬化组中的分布差异无统计学意义。慢性乙型肝炎组中携带G等位基因的患者HBVDNA水平为6.25log10拷贝/ml,携带A等位基因的患者为5.54log10拷贝/ml,t=2.111,P=0.036。rs127000736和rs9622924两位点在中国汉族人群中分别只有G/G和C/C一种单-基因型存在,rs17496046和rs2899313两位点分别以G等位基因和A等位基因为主,这4个tagSNP(rs17000736、rs17496046、rs9622924和rs2899313)在对照组、慢性乙型肝炎组和乙型肝炎肝硬化组中等位基因频率差异均无统计学意义。结论汉族人群APOBEC3G基因中rs8177832位点的多态性可能与HBV的复制有关,但这5个tagSNP可能与HBV感染后疾病的进展无关。
田地曾争田国保崔建军
关键词:乙型基因载脂蛋白B
HBV感染者HBs Ag、抗-HBs双阳性对肝细胞癌发生影响的Meta分析被引量:4
2019年
目的探讨HBV感染者HBsAg、抗-HBs双阳状态对肝细胞癌(HCC)发生的影响。方法 检索PubMed、Embase、Cochrane Library英文数据库及中国知网、万方中文数据库1975年7月1日-2019年3月27日发表的有关血清HBsAg、抗-HBs双阳状态对HCC发生风险的文献。采用RevMan5.3和Stata11.2软件对纳入文献数据进行统计分析。对纳入的各研究进行异质性分析,如果各研究间存在显著异质性,则采用随机效应模型分析;若各研究间异质性不显著,则采用固定效应模型分析。比值比(OR)和相应的95%可信区间(95%CI)被用于评估HBsAg、抗-HBs双阳状态与HCC发生的关系。采用Begg漏斗图和Egger检验进行发表偏倚分析。通过每次去除一篇文献的敏感性分析方法评估Meta分析的质量和可信度。结果 最终纳入4篇文献,其中2项研究来自韩国人群,2项研究来自中国人群,共3042例患者。Meta分析结果显示,HBsAg、抗-HBs双阳状态与HCC发生之间无显著性关联(OR=1.46,95%CI:0.76~2.80, P =0.25)。基于国别的亚组分析显示,在韩国人群中,双阳状态与HCC发生之间存在显著性关联(OR=2.67,95%CI:1.61~4.43, P =0.000 1);而在中国人群中无显著性关联(OR=0.89,95%CI:0.48~1.64, P =0.70)。结论 HBsAg、抗-HBs双阳状态与HCC发生无明显关联,未来需更多研究证实这一可能。
范梦洁曾争
关键词:乙型肝炎抗体
慢性HBV感染者抗病毒治疗前HBV基本核心启动子及前C区突变的检测及意义被引量:3
2011年
目的研究慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染者抗病毒治疗前HBV基本核心启动子(BCP)突变和前C区(PreC)突变与HBeAg、HBV DNA水平和慢性肝病进展的关系。方法收集283例慢性HBV感染者抗病毒治疗前的血清标本,其中慢性乙型肝炎(CHB)185例,肝硬化(LC)98例。采用PCR后直接测序法检测HBV BCP和PreC区突变,同时确定基因型。结果在HBeAg阴性和HBeAg阳性CHB患者中,前C区A1896变异率分别为44.6%(37/83)和21.6%(22/102)(χ2=11.154,P=0.001),LC患者分别为43.4%(23/53)和17.0%(8/47)(χ2=8.101,P=0.004)。在HBeAg阳性患者中,BCP T1762/A1764双突变率LC组和CHB组分别为89.4%(42/47)和70.6%(72/102)(χ2=6.310,P=0.012)。在单变量分析中,只有年龄(≥45岁)(χ2=27.861,P<0.001)、BCP T1762/A1764双突变(χ2=8.675,P=0.003)和HBV DNA(≥105拷贝/ml)(χ2=20.499,P<0.001)与LC进展有关。多因素Logistic回归分析(匹配年龄和性别)发现,BCP T1762/A1764双突变(OR=3.260,95%CI:1.401~7.586;wald=7.517,P=0.006)和HBV DNA(≥105拷贝/ml)(OR=4.640,95%CI:2.331~9.237;wald=19.089,P<0.001)是LC进展的危险因素。结论前C区A1896突变与HBeAg的消失有关;年龄(≥45岁)、BCP T1762/A1764双突变和HBV DNA高载量(≥105拷贝/ml)与肝硬化进展有关。
郑金鑫于敏席宏丽郑颖颖尹胜杰张独佾王芳曾争于岩岩
关键词:突变
New Gene Variants Associated with the Risk of Chronic HBV Infection被引量:1
2020年
Some patients with chronic hepatitis B virus(HBV)infection failed to clear HBV,even persistently continue to produce antibodies to HBV.Here we performed a two stage genome wide association study in a cohort of Chinese patients designed to discover single nucleotide variants that associate with HBV infection and clearance of HBV.The first stage involved genome wide exome sequencing of 101 cases(HBsAg plus anti-HBs positive)compared with 102 control patients(antiHBs positive,HBsAg negative).Over 80%of individual sequences displayed 209 sequence coverage.Adapters,uncertain bases[10%or low-quality base calls([50%)were filtered and compared to the human reference genome hg19.In the second stage,579 chronic HBV infected cases and 439 HBV clearance controls were sequenced with selected genes from the first stage.Although there were no significant associated gene variants in the first stage,two significant gene associations were discovered when the two stages were assessed in a combined analysis.One association showed rs506121-“T”allele[within the dedicator of cytokinesis 8(DOCK8)gene]was higher in chronic HBV infection group than that in clearance group(P=0.002,OR=0.77,95%CI[0.65,0.91]).The second association involved rs2071676—A allele within the Carbonic anhydrase(CA9)gene that was significantly elevated in chronic HBV infection group compared to the clearance group(P=0.0003,OR=1.35,95%CI[1.15,1.58]).Upon replication these gene associations would suggest the influence of DOCK8 and CA9 as potential risk genetic factors in the persistence of HBV infection.
Mengjie FanJing WangSa WangTengyan LiHong PanHankui LiuHuifang XuDaria V.ZhernakovaStephen J.O’BrienZhenru FengLe ChangErhei DaiJianhua LuHongli XiYanyan YuJianguo ZhangBinbin WangZheng Zeng
关键词:VARIATION
干扰素调节因子3 rs2304204野生型及突变型重组质粒的构建及活性分析被引量:1
2014年
目的构建干扰素调节因子3(IRF-3)rs2304204野生型及突变型重组质粒并比较二者启动子活性。为进一步研究IRF-3对HBV感染的影响打下基础。方法以人全血DNA为模板,扩增含rs2304204位点的IRF-3启动子区1355bp目的序列,插入pGL3-Basic载体中,构建rs2304204野生型的重组质粒(wIRF-3)。以wIRF-3为模板,利用基因定点突变试剂盒构建rs2304204突变型重组质粒(mIRF-3)。wIRF.3、mIRF-3和pGL3-Basic质粒分别转染HEK293细胞,采用双荧光素酶报告基因检测试剂盒检测荧光素酶活性,并计算荧光素酶相对活性单位(RLU)。结果成功构建IRF-3rs2304204野生型及突变型重组质粒,且wIRF-3质粒转染组RLU明显高于mIRF-3质粒转染组(P〈0.005)。结论野生型重组质粒的启动子活性明显高于突变型重组质粒,启动子活性的不同可能进而影响机体抗HBV感染的临床结局。
白晓燕王彬彬曾争
关键词:干扰素调节因子3HBV启动子活性
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