国家高技术研究发展计划(2012AA100103) 作品数:33 被引量:383 H指数:10 相关作者: 张晓芬 陈斌 耿三省 刁卫平 王述彬 更多>> 相关机构: 北京市农林科学院蔬菜研究中心 江苏省农业科学院 中国农业科学院蔬菜花卉研究所 更多>> 发文基金: 国家高技术研究发展计划 国家科技支撑计划 国家现代农业产业技术体系建设项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 经济管理 更多>>
黄瓜抗枯萎病基因连锁分析和定位 被引量:10 2015年 为筛选出与黄瓜抗枯萎病相关基因连锁的SSR分子标记,以对黄瓜抗枯萎病为单显性基因的母本WIS2757和感枯萎病父本津研2号及其F1、F2分离群体为试材,通过构建抗、感池对黄瓜枯萎病抗性进行SSR分析。结果表明:通过对278对SSR引物进行筛选,获得在双亲间存在多态性的引物102对,进一步通过抗、感池筛选,获得抗感池DNA间有差异的引物10对。经F2感病群体验证,共获得9个与黄瓜枯萎病抗性基因(Foc-4)连锁的SSR分子标记,并初步将Foc-4基因定位在2号染色体两标记SSR17631和SSR00684之间,距基因Foc-4的遗传距离分别为1.0 c M和0.9 c M,为进一步开发抗枯萎病分子标记及克隆黄瓜抗枯萎病基因奠定了基础。 周红梅 董从娟 张海英 任毅 郭绍贵 杨文才 毛爱军关键词:黄瓜 枯萎病 抗病基因 水稻株高QTLQph1的精细定位 被引量:5 2012年 利用珍汕97B与南阳占的重组自交系(recombinant inbred line,RILs)构建了以珍汕97B为背景的近等基因系(near isogenic line,NILs)BC3F2,通过对其320株随机分离小群体的研究,发现Qph1同时具有加性效应和显性效应,其可解释的遗传变异达71.28%,局部QTL连锁分析把该QTL定位于2.1cM、180.2kb的RM6333-RM11961区间内;进一步发展6 000株大群体,筛选出230株极端隐性重组单株,利用重叠作图法将Qph1进一步精细定位于距离约为90kb的SSR标记SHL4和InDel(Insertl Deletion)标记HL13间,通过与已克隆的sd1基因比较,发现二者并不在同一个区域,这为进一步克隆该QTL和分子标记辅助选择培育矮秆水稻新品种奠定了基础。 孔会利 刘文俊 王令强 高冠军 何予卿关键词:水稻 株高 QTL 近等基因系 基于辣椒基因组重测序的InDel标记开发及应用 被引量:17 2015年 基于全基因组重测序进行分子标记开发是一种新的方法和趋势。本研究基于辣椒全基因组重测序数据鉴定出的InDel位点,在2号染色体上随机选择并设计了40个InDel标记,以24份辣椒种质验证其有效性。结果显示:40个标记可获得扩增产物,其中具有多态性的标记35个,多态率为87.5%,同时35个标记可以有效地区分24份辣椒种质的多样性和特异性。以上结果表明,基于重测序数据开发辣椒InDel标记切实可行。 郭广君 孙茜 刘金兵 潘宝贵 刁卫平 戈伟 高长洲 王述彬关键词:辣椒 INDEL标记 种质鉴定 甘蓝抗枯萎病基因的定位 甘蓝枯萎病由尖孢镰刀菌引起,在国内发现于本世纪初,自出现以来严重影响甘蓝的生产,甚至在部分地区如山西寿阳和北京延庆等地区成为毁灭性病害。在此前的研究中,作者已确定甘蓝对枯萎病的抗性符合显性单基因遗传,并进行了分子标记的研... 吕红豪 刘博 王晓武 康俊根 方智远 杨丽梅 张扬勇 刘玉梅 庄木 谢丙炎关键词:甘蓝 枯萎病 INDEL标记 尖孢镰刀菌 辣椒花青素生物合成相关基因的表达分析研究 被引量:8 2014年 为了明确辣椒花青素生物合成途径中相关基因的表达调控模式,选取3种不同果实颜色的辣椒品系(紫晶、淡紫、水晶)为试材,提取果实不同发育阶段的RNA并反转录成cDNA,利用qRT-PCR技术分析相关基因( CHS、CHI、F3H、F3′5′H、DFR、ANS、UFGT、ANP、GST)在不同辣椒材料果实不同发育阶段的表达情况。结果显示:CHS、CHI在3种材料果实发育过程中表达量都很少且无规律可循,F3H在淡紫、紫晶中表达量较高,且在果实发育的第15~20天时出现较大峰值,与之相比在水晶中的表达量可以忽略不计。 F3′5′H、ANP、GST、DFR、UFGT在3种材料中相对表达量随着果实的发育分别呈现同步变化,且F3′5′H、ANP、GST在材料紫晶果实发育的第15天相对表达量出现较大峰值,ANS在3种材料果实发育过程中的相对表达量变化没有一定规律可循。 F3H、F3′5′H、ANP、GST是辣椒花青素代谢途径的关键基因。 李珍 刘金兵 刁卫平 王述彬 潘宝贵 戈伟 郭广君关键词:辣椒 花青素 生物合成 番茄抗TYLCV基因新标记的开发及其在多抗聚合选择中的应用 被引量:5 2014年 根据已经克隆的番茄黄化曲叶病毒病(TYLCV)抗性基因Ty-1/Ty-3和与基因Ty-4紧密连锁的分子标记在抗感材料中的序列差异,开发出简单可靠的InDel标记,建立了多重PCR体系。采用分子标记辅助选择将TYLCV、斑点病、疮痂病和溃疡病中一个病害的多个抗性基因或不同病害的抗性基因聚合到一个材料中,培育出育种中间材料。 胡霞 王蓉 李菲菲 周涛 杨文才关键词:番茄 疮痂病 斑点病 基于转录组测序的茄子SSR标记开发 被引量:36 2016年 应用Trinity软件对茄子转录组测序数据组装,得到总长度为47919660 bp的45404条Unigenes,MISA从中检索到8316个SSR位点,发生频率为18.32%,平均5.63 kb一个位点。SSR位点中单碱基重复类型最多,为5372个,占到64.60%;其次为三碱基重复1628个,占到19.58%。三碱基重复中AAG/CTT是优势重复单元,占三碱基重复数的31.6%;二碱基重复中AG/CT是优势重复单元,占二碱基重复数的42.3%。利用Primer 3设计引物,共得到858对SSR引物,随机选取100对引物对17份茄子材料进行扩增,结果表明:有84对可以扩增出条带清晰的片段,有47对引物扩增片段为多态性片段。对47对多态性引物进行分析,多态性信息含量范围为0.10-0.64,平均多态性信息含量为0.32,UPGMA聚类分析可将17份材料分为3类。以上结果表明,基于茄子转录组测序开发的SSR标记可以为茄子的遗传多样性分析和遗传图谱构建提供更加丰富的标记来源。 魏明明 陈钰辉 刘富中 张映 连勇关键词:茄子 转录组 SSR 引物 多态性 黄果番茄果实部分风味品质及氨基酸组成分析 被引量:31 2016年 为评价黄果番茄的营养价值,采用常规方法和全自动氨基酸分析仪,比较了黄果番茄和红果番茄果实口感、可溶性固形物含量、可溶性糖含量、可滴定酸含量和VC含量等品质相关指标和氨基酸组分,计算了糖酸质量比、氨基酸比值系数(R),并对呈味氨基(FAA)进行了分析。结果表明,黄果番茄的整体口感偏甜,而红果番茄的整体口感偏酸,除可滴定酸含量外,供试的黄果番茄品种各品质指标的平均值均高于红果番茄品种,其中,VC含量增加31.94%,增加幅度最大。在黄果番茄和红果番茄中均鉴定出16种氨基酸,含量最高的均为谷氨酸,其次为天冬氨酸,含量最低的均为胱氨酸。除蛋氨酸,其余氨基酸含量黄果番茄均低于红果番茄;其中变化幅度最大的是谷氨酸,降幅为41.78%,变化幅度最小的为组氨酸。与人体必需氨基酸模式谱比对后发现,黄果番茄的蛋白质较接近理想蛋白质的要求,其果实中符合氨基酸模式谱的氨基酸种类多于红果番茄;缬氨酸的RC评分最低,为黄果番茄和红果番茄的第一限制氨基酸,亮氨酸为黄果番茄的第二限制氨基酸,异亮氨酸为红果番茄的第二限制氨基酸。红果番茄果实中各呈味氨基酸含量均高于黄果番茄。 刘娜 岳冬 鲁博 田守波 张辉 朱龙英 朱为民关键词:氨基酸 营养评价 我国辣椒品种市场需求变化趋势及育种对策 被引量:107 2015年 我国辣椒栽培面积约占我国蔬菜栽培总面积的10%,已经形成六大重点产区,呈现出专业化、精品化和高端化的发展态势。在品种市场上,不同栽培条件下专用型辣椒品种需求增加,品质优良的耐贮运辣椒品种将具有市场发展前景,抗逆性、适应性强的优良品种市场占有率将提高,对品种的复合抗病水平要求更高,优质、抗病、适于机械化采收的干椒品种有市场空间。 耿三省 陈斌 张晓芬 杜和山关键词:辣椒品种 干椒 辣椒栽培 精品化 线椒 基于番茄抗黄化曲叶病毒病基因Ty-5CAPS的SNP标记开发 被引量:2 2015年 为了促进SNP技术在番茄抗黄化曲叶病毒病育种中的应用,探讨了将番茄Ty-5 CAPS标记转换成SNP标记进行检测的可行性。首先对Ty-5的CAPS标记Sl NAC1的扩增产物进行测序,设计多对引物,以感病自交系9179和抗病自交系07-025为材料进行PCR,筛选出只在抗病自交系中能扩增出特异条带的SNP引物,将这对引物作为SNP标记;然后,用SNP标记对番茄材料进行分析,验证标记的可行性。结果表明,利用番茄Ty-5 CAPS标记转化的SNP标记,可直接用于番茄抗黄化曲叶病毒病的分子标记辅助选择育种。 姚祝平 叶青静 王荣青 周国治 阮美颖 李志邈 万红建 杨悦俭关键词:番茄 番茄黄化曲叶病毒 SNP标记 育种