国家自然科学基金(30960245)
- 作品数：8 被引量：22H指数：3
- 相关作者：张立岭赵静陈琦马月辉赵春萍更多>>
- 相关机构：海南大学内蒙古农业大学内蒙古医学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技支撑计划“十一五”国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 绵羊Hoxc8与d11基因甲基化的量子力学特征与功能被引量：1
- 2011年
- 文章研究了蒙古羊和德国美利奴肉羊、陶赛特肉羊、澳洲美利奴细毛羊的Hoxc8和Hoxd11基因及其第1位外显子的甲基化位置、数量、稳定程度,以及甲基化的量子力学性质。与蒙古羊相比,内含子序列有数个碱基的差异,外显子一致。外显子序列的甲基化在转录和翻译过程中的功能,与甲基化导致的分子轨道和量子力学变化有关。甲基化胞嘧啶在密码与反密码中的第2位,决定甲基化是否对转录和翻译产生效应。蒙古羊14枚胸椎个体的父本Hoxc8 exon-1和Hoxd11 exon-1序列甲基化程度高,母本的甲基化程度低;13枚胸椎个体的父本和母本相应序列的甲基化程度都低。
- 赵静张立岭巴图陈琦
- 关键词：绵羊甲基化量子力学分子轨道
- 利用交错式热不对称PCR法获取多脊椎蒙古羊Hoxc8启动子序列的研究被引量：2
- 2012年
- [目的]探索获得蒙古羊Hoxc8基因启动子序列的方法。[方法]尝试利用交错式热不对称PCR法,获得蒙古羊Hoxc8启动子序列。[结果]通过PCR获得的序列不理想,测序结果无法与已知序列相匹配。虽然利用交错式热不对称PCR法未获得蒙古羊的Hoxc8的启动子序列,但可为今后的相关研究提供借鉴。[结论]该研究为进一步分析蒙古羊Hoxc8的启动子区域的甲基化状态奠定了基础。
- 陈琦赵静张立岭马月辉
- 关键词：启动子
- 多脊椎蒙古羊Hoxc8 exon-1和exon-2的序列分析被引量：2
- 2011年
- 参考牛的Hoxc8基因序列设计引物,扩增正常蒙古羊(胸椎数13)和多脊椎蒙古羊(胸椎数14)Hoxc8的exon-1和exon-2基因,对得到的序列进行生物信息学分析。结果表明,经序列比对二者的DNA序列,除两侧个别碱基有差异外,中间序列完全一致。蒙古羊Hoxc8的exon-1和exon-2序列分别与其他物种进行同源性比对,蒙古羊Hoxc8 exon-1与人、小鼠、大鼠、犬的同源性达到96%以上,与斑马鱼的同源性为75.8%;exon-2与大猩猩、犬、人、小鼠、大鼠的同源性达到91%以上,与斑马鱼的同源性为74%。
- 陈琦赵静张立岭马月辉
- 绵羊HOXC8基因的DNA甲基化研究被引量：4
- 2011年
- 本研究测定了蒙古羊和德国美利奴肉羊,道塞特肉羊,澳洲美利奴细毛羊Hoxc8全基因序列。蒙古羊与这3个外国品种的Hoxc8基因,只有内含子存在8个碱基差异。但是exon-1的甲基化模式存在极大差异。蒙古羊14枚胸椎个体的甲基化程度高于13枚胸椎个体。蒙古羊甲基化程度普遍高于外国品种。蒙古羊特有的可遗传甲基化位点共有6个(5,69,1,62,6,27),国外品种在这些位置不发生甲基化。并且,这6个位点的甲基化程度高低可能决定了第14枚胸椎的长短和骨化程度。
- 赵静张立岭陈琦巴图
- 关键词：绵羊CPG
- 利用交错式热不对称PCR法获取多脊椎蒙古羊Hoxc8启动子序列的研究(英文)
- 2012年
- [目的]探索获得蒙古羊Hoxc8基因启动子序列的方法。[方法]尝试利用交错式热不对称PCR法,获得蒙古羊Hoxc8启动子序列。[结果]通过PCR获得的序列不理想,测序结果无法与已知序列相匹配。虽然利用交错式热不对称PCR法未获得蒙古羊的Hoxc8的启动子序列,但可为今后的相关研究提供借鉴。[结论]该研究为进一步分析蒙古羊Hoxc8的启动子区域的甲基化状态奠定了基础。
- 陈琦赵静张立岭马月辉
- 关键词：启动子
- 缅甸蟒线粒体基因组全序列测定与分析被引量：5
- 2014年
- 采用LA—PCR（10ngandaccuratePCR）、巢式PCR及TA克隆测序技术，首次获得缅甸蟒Pythonbivittatus线粒体基因组全序列（GenBank登录号NC_021479）。分析结果表明：缅甸蟒线粒体全长17617bp，与其它多数蛇类线粒体基因组结构相似，由13个蛋白编码区、2个rRNA、22个tRNA和双控区组成，基因间排列紧凑；与蟒属其它物种相比，缅甸蟒线粒体在氨基酸数目上存在增减现象；tRNA中tRNA—Cys长度最短，只有57bp，二氢尿嘧啶环无配对的茎区；缅甸蟒在两个控制区各存在3个相同的串联重复，可能是造成个体问相差87～89bp的原因。
- 刘雅芳曹婷刘建才于萍赵春萍侯冠彧张立岭
- 关键词：线粒体基因组氨基酸控制区
- 蒙古羊Hoxd11基因CpG位点分布特征分析被引量：3
- 2010年
- 蒙古羊的Hoxd11基因全长1 772 bp。其中exon-1为778 bp,exon-2为236 bp,内含子为758 bp(Gen-Bank Accession No.GU059862)。Hoxd11 exon-1序列共有120个CpG,其中位于密码第1～2位的CpG共8个,全都编码精氨酸。位于密码第2～3位的CpG共47个,占所有CpG的39.17%(47/120),分别编码5个丝氨酸,18个脯氨酸,2个苏氨酸,22个丙氨酸。Hoxd11 exon-1的CpG数量明显高于第2外显子(12个)。Hoxd11exon-1序列中的高密度CpG,提示这个序列有可能是甲基化的高发区。这对于进一步分析这个基因对调控腰椎发育的作用,具有重要意义。
- 赵静张立岭巴图
- 关键词：CPG蒙古羊外显子
- 蒙古羊Hoxc8基因甲基化与胸椎数量的关系被引量：8
- 2011年
- 为了研究蒙古羊Hoxc8基因的甲基化与胸椎数的关系,试验采用亚硫酸氢盐测序PCR方法进行检测。结果表明:蒙古羊的14枚胸椎个体(T14)占26.1%,7枚腰椎个体(L7)占69.5%,其中Hoxc8 exon-1含27个CpG。T13型个体的甲基化CpG分别为6,3,6;T14型个体的甲基化CpG分别为23,20,21。T13和T14的甲基化比例平均值分别为(18.500±0.064)%和(79.030±0.056)%(P=0.002)。T14蒙古羊Hoxc8 exon-1的甲基化功能区(120～142个碱基)的CpG胞嘧啶全部甲基化,而T13则相反。说明蒙古羊Hoxc8 exon-1甲基化CpG的密度和数量影响Hoxc8基因的表达,并且调控胸椎的发育。
- 赵静张立岭陈琦巴图
- 关键词：蒙古羊
