公共文化服务平台

国家自然科学基金(30471841): 作品数：10 被引量：98H指数：5; 相关作者：申阿东焦伟伟孙桂芝孙琳李墨更多>>; 相关机构：首都医科大学附属北京儿童医院首都医科大学附属北京胸科医院传染病预防控制国家重点实验室更多>>; 发文基金：国家自然科学基金更多>>; 相关领域：医药卫生更多>>

Molecular characteristics of rifampin and isoniazid resistant Mycobacterium tuberculosis strains from Beijing,China被引量：40: 2007年; 背景中国是 Mycobacterium 的高负担国家之一肺结核(TB ) 感染全球性，与高发生和死亡。我们学习了 rifampin ( RIF )和抵抗 Mycobacterium 肺结核从中国北京拉紧的异菸肼( INH )的分子的特征，四十 pansusceptible 和 Mycobacterium 肺结核的 81 抵抗紧张从北京孤立以便为特定的药 resistance.Methods 的快速的察觉发现基因标记，中国在 2002-2005 期间被分析。修改 rifampin oligonucleotide (RIFO ) 试金基于反向的线污点杂交被用来在 rpoB 基因的 81 bp 热点区域检测变化，它与 RIF 抵抗被联系。INH 抵抗联系了基因，规章的区域 mab-inhA (-15C/T) 和结构的基因 katG S315T 被反向的线污点杂交和 PCR 限制碎片长度多型性(RFLP ) 检测方法分别地。所有紧张被 spoligotying 打，北京遗传型被 NTF 地点分析进一步细分。药抵抗的分发在上述基因联系了变化在这些 groups.Results 被比较 65 (91.5%) 抵抗的 71 RIF 并且 52 (92.9%) 56 multidrug 抵抗(MDR，对至少 RIF 和 INH 抵抗的 .e ) 紧张被发现在 rpoB 热点区域怀有变化。没有变化在 RIF 敏感紧张被检测。修改 RIFO 试金的特性和敏感是 100% 并且 91.5% 分别地。katG315 AGCACC 和 inhA-15CT 变化在 40 被发现(60.6%) 并且 10 (15.2%) 66 NH 抵抗紧张，分别地； 7.6%INH 抵抗的紧张在这两基因有变化。因此， katG315 和 inhA-15 的联合使用识别了 68.2%INH 抵抗的紧张。北京遗传型说明了 91.7% 全部的紧张并且进一步被细分进“现代”(76.6%) 并且“祖先”(23.4%) 组。在药的 prevaiance 的“祖先”、“现代”的组之间没有重要差别联系抵抗的基因 mutations.Conclusions rpoB 基因的热点区域能为 RIF 抵抗紧张的察觉被用作基因标记；katG315 和 inhA-15 的联合使用能改进 INH 抵抗紧张的察觉率；北京遗传型在中国北京是流行的；修改 RIFO 试金能是为抵抗的 RIF 的快速的察觉的一个实际工具， MDR 在平淡的诊断工作孤�; JIAO Wei-weiMokrousov IgorSUN Gui-zhiLI MoLIU Jia-wenNarvskaya OlgaSHEN A-dong; 关键词：异烟肼北京株分子特征

不同串联重复序列位点组合用于中国结核分枝杆菌基因分型的能力比较分析被引量：10: 2009年; 目的初步评价不同串联重复序列（VNTR）位点在中国8省市结核分枝杆菌基因分型中的应用，寻找适合中国地区结核分枝杆菌基因分型的位点组合。方法从中国8个省（市、自治区）2800余株结核分枝杆菌临床分离菌株中以简单数字表法随机抽取140株，采用多位点数目可变串联重复序列分析方法（MLVA）对27个数目可变VNTR位点进行基因多态性检测，采用BioNumerics数据库软件进行单位点和不同位点组合的分辨率（Hunter-Gaston指数，HGI）分析，并比较分析其对140株菌的基因分型鉴定能力。同时采用间隔区寡核苷酸分型（Spoligotyping）将140株菌分为北京家族和非北京家族，评价上述不同VNTR位点组合在北京家族和非北京家族中的分型能力。结果140株菌主要可分为2个基因群，即北京家族112株，占80％；非北京家族28株，占20％。Spoligotyping分型对140株结核分枝杆菌的HGI为0．4589。MLVA分析结果显示不同位点在不同菌株群存在明显的多态性，不同位点的HGI具有较大差异（0～0．809），对全部菌株、北京家族菌株、非北京家族菌株的HGI达到0．5以上的VNTR位点数分别为8、7和14个。27个VNTR位点进行不同的位点组合：优化筛选的8位点组合、国际推荐的12个、15个和24个位点组合。4个组合的HGI分别为0．9991、0．9882、0．9980和0．9986；在北京家族菌株中，上述组合的HGI依次为0．9987、0．9318、0．9969和0．9975；在非北京家族菌株中分别为1、0．9894、1和1。结论不同的VNTR位点和不同VNTR位点组合在中国8省市结核分枝杆菌中的HGI均存在明显差异；本研究优化的8个位点组合MLVA分型方法在中国结核分枝杆菌流行病学研究可能具有良好的应用前景。; 李兆娜刘梅吕冰赵秀芹刘志广焦伟伟孙琳贾文祥申阿东万康林; 关键词：核酸细菌分型技术

不同VNTR位点组合用于北京基因型结核分枝杆菌基因分型的研究被引量：16: 2008年; 目的评价不同串联重复序列(VNTR)位点组合在北京地区北京基因型结核分枝杆菌基因分型中的应用。方法采用多位点数目可变串联重复序列分析(MLVA)技术对72株北京地区北京基因型菌株的24个VNTR位点进行分析,基因多态性分析采用BioNumerics软件。结果24个位点的多态性差异较大,位点QUB-11b(HGI 0.651)、Mtub 21(HGI0.556)和QUB-26(HGI 0.518)的多态性较高,有两个位点(MIRU 2和MIRU 24)则不具有多态性;不同VNTR位点组合(12位点,15位点,24位点)在北京基因型菌株中的分辨指数依次升高,分别为0.788,0.990,0.992,后两个组合的差异仅是由位点Mtub 29引起的。结论不同的VNTR位点在北京地区北京基因型菌株中的分辨力存在差异;推荐的基础VNTR 15位点与Mtub 29组合可作为北京地区结核分枝杆菌分子流行病学研究的一线方法。; 李墨焦伟伟孙桂芝Igor Mokrousov郭雅洁申阿东; 关键词：结核分枝杆菌北京基因型串联重复序列基因分型

结核分支杆菌耐药性的分子机制研究进展被引量：17: 2006年; 由结核分支杆菌(MTB)引起的结核病是当今世界上最普遍的人类传染病之一。中国是全球22个结核病高发病国家之一,结核病人数位居世界第二位,因此,结核病已成为威胁人类健康的最重要的疾病。高耐药率和耐多种药物菌株的不断扩散是引起结核病卷土重来的主要原因。近年来随着分子生物学技术的飞速发展和应用,MTB菌株插入序列IS6110的限制性片段长度多态性基因分型方法,已被证明是非常有效的分子流行病学及耐药性研究的基因标志。用分子生物学技术检测临床一线抗结核药物的常见耐药基因位点,对了解MTB的耐药性及耐药性的分子机制以及对结核病的控制具有深远意义。; 申阿东杨永弘江载芳; 关键词：抗多种药物性结核分支杆菌耐药性分子机制

RIFO杂交和限制性片段长度多态性检测耐利福平和异烟肼的结核分枝杆菌被引量：2: 2007年; 目的评价利福平寡核苷酸探针杂交技术(RIFO 杂交)和 PCR-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)在结核分枝杆菌(MTB)耐利福平(RIF)和异烟肼(INH)快速检测中的应用价值。方法选取121株北京地区 MTB 菌株,分别采用 RIFO 杂交技术和 PCR-RFLP 检测 RIF 耐药相关基因 rpoB 核心区和 INH 耐药相关基因 katG315位点突变,并对所有菌株的 rpoB 基因核心区进行测序验证。结果 RIFO 杂交检测发现,91.5%(65/71)的 RIF 耐药株和92.9%(52/56)的耐多药菌株(至少对 RIF 和 INH 耐药)存在 rpoB 基因核心区突变,而 RIF 敏感株中未发现突变;RIFO 杂交与测序结果完全一致,测序结果中有突变的位点在 RIFO 杂交中均有相应的野生型杂交信号缺失;PCR-RFLP 结果显示,INH 耐药株中 katG315突变率为60.6%(40/66)。结论 rpoB 基因核心区可作为 RIF 耐药检测的分子标志及耐多药的筛选指标;RIFO 杂交技术是检测 MTB 耐 RIF 的快速、准确的实验方法,具有推广及潜在的临床应用价值;PCR-RFLP 可检测出大部分 INH 耐药株,可作为临床 INH 耐药性检测的辅助手段。; 焦伟伟Igor Mokmusov孙桂芝李墨刘佳文Olga Narvskaya申阿东; 关键词：分枝杆菌结核利福平异烟肼

结核分枝杆菌基因分型方法研究进展被引量：1: 2008年; 结核病是单一病原体所致死亡的主要原因。近年来，人口流动的增加和耐药结核分枝杆菌的增多更加剧了结核病在人群间的传播，因此必须加强对结核感染的控制和监测。分子流行病学，尤其是基因分型方法是监测结核病传播的有效途径。目前国内外广泛使用的基因分型方法有：插入序列6110限制性片段长度多态性、间隔区寡核苷酸分型法、多位点数目可变串联重复序列分析、单核苷酸多态性分析及缺失分析等。该文就这些分型方法作一综述。; 焦伟伟申阿东; 关键词：分枝杆菌结核基因分型

等位基因特异多重PCR快速检测结核分枝杆菌异烟肼耐药性研究被引量：1: 2009年; 了解北京地区异烟肼(INH)耐药结核分枝杆菌(MTB)的分子特点,评价等位基因特异多重PCR在INH耐药性快速检测中的应用价值。选取102株北京地区MTB临床分离株,首先分别采用PCR-RFLP和反向线性杂交技术(RLB)检测耐药相关基因katG和inhA突变,然后运用等位基因特异多重PCR方法同时检测katG和inhA基因突变,并与PCR-RFLP和RLB分别检测的结果进行比较。采用等位基因特异多重PCR检测发现,INH耐药株中60.3%(35/58)存在katG315突变,13.8%(8/58)发生了inhA突变,两者同时突变率为6.9%(4/58),INH敏感株中没有发现katG315突变,而inhA突变率为18.2%(8/44)。上述检测结果与PCR-RFLP和RLB分别检测的结果完全一致,且等于两种方法结果之和,提示等位基因特异多重PCR可完全取代PCR-RFLP和RLB。北京地区INH耐药菌株以katG315 AGC→ACC突变为主;联合检测katG315和inhA基因可提高INH耐药株的检出率。等位基因特异多重PCR操作简便,结果易于判断,可作为临床MTB菌株中INH耐药性快速检测的辅助手段。; 焦伟伟孙琳李兆娜顾艺孙桂芝申阿东; 关键词：结核分枝杆菌抗药性异烟肼 PCR-RFLP

应用反向线性杂交技术快速检测结核分枝杆菌利福平耐药性研究被引量：4: 2007年; 探讨反向线性杂交技术(reverse line blot assay,RLB)在结核分枝杆菌利福平(RFP)耐药性快速检测中的应用价值。采用RLB将包含rpoB基因核心区的扩增产物与标记特异性探针的膜进行杂交,共对121株结核分枝杆菌进行RFP耐药性检测,并将结果与常规药敏实验进行比较。结果发现,121株中有71株对RFP耐药,56株为多重耐药株;采用RLB共检测到65株RFP耐药株rpoB基因核心区存在突变,其灵敏度为91.5%(65/71);50株RFP敏感株中均未检测到突变,则特异性为100%(51/51);56株多耐药菌株中,92.9%(52/56)存在rpoB基因核心区突变。因此,用RLB检测结核分枝杆菌RFP耐药株具有快速,高效,特异性和灵敏度高的优点,且可用于多耐药菌株的筛选,具有推广和潜在的临床应用价值。; 焦伟伟李墨Igor Mokrousov孙桂芝刘佳文Olga Narvskaya申阿东; 关键词：分枝杆菌利福平耐药 RPOB基因

全血γ干扰素测定试验在结核病诊断中的应用被引量：6: 2008年; 实验室检验是结核病最重要的诊断方法。目前结核病诊断的金标准是临床检查结合细菌培养和痰涂片镜检。但是结核分枝杆菌（MTB）培养周期长且阳性率低，对于这些患者的诊断只能借助于临床观察和X线检查。因此，上述手段在需要早期发现和及时治疗的潜伏性和活动性结核病患者的快速诊断中受到限制。近年来免疫学检测以其简便、快速以及较高的特异度和敏感度，在结核病的诊断中得到了广泛的应用。; 孙琳申阿东; 关键词：结核病诊断 Γ干扰素全血结核分枝杆菌痰涂片镜检结核病患者

多位点数目可变串联重复序列分析在北京基因型结核分枝杆菌基因分型中的应用被引量：3: 2008年; 目的评价多位点MLVA的15位点组合在北京基因型结核分枝杆菌（MTB）基因分型研究中的应用价值。方法采用MLVA（15位点）对来源于北京胸科医院的72株北京基因型MTB菌株进行基因分型，并将结果与金标准IS6110-RFLP的分型结果进行比较。结果MLVA（15位点）分型后共得到59个类型，其中53个为独特类型，其总体分辨力为0．990，多态性较好的位点有Qub—J1b、Mtub21和QUB-26；IS6110-RFLP分型后共得到69个类型，其中66个为独特类型，分辨力高达0．999，并可对MLVA（15位点）中成簇的菌株进一步区分。结论MLVA（15位点）在北京基因型菌株中具有较好的分辨能力，但成簇菌株仍需采用金标准IS6110-RFLP进一步细分。; 焦伟伟李兆娜孙琳孙桂芝Igor Mokrousov郭雅洁Olga Narvskaya申阿东; 关键词：基因型

国家自然科学基金(30471841)

文献类型

领域

主题

机构

作者

传媒

年份

用户反馈

国家自然科学基金(30471841)

文献类型

领域

主题

机构

作者

传媒

年份

用户登录

用户反馈