江苏省科技支撑计划项目(BE2012309)
- 作品数：11 被引量：89H指数：5
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- 利用染色体单片段代换系定位水稻结实率QTLs被引量：2
- 2013年
- 以85个籼稻广陆矮4号为受体亲本、粳稻日本晴为供体亲本的染色体单片段代换系为材料,通过单因素方差分析和Dunnett’s多重比较,分析单片段代换系与受体亲本之间结实率(SSR)的差异,从而对代换片段上的结实率相关QTLs进行定位。结果表明:以P≤0.001为阈值,共检测到9个结实率QTLs,分布于水稻12条染色体中的7条染色体上,除第1、3染色体上检测到2个结实率QTLs之外,其余每条染色体上各有1个结实率QTLs;在2个环境下均检测到的QTLs有5个,另外4个只在一个环境下检测到;其加性效应值的变化范围为-7.47^-24.72,加性效应百分率的变化范围为-7.98%^-25.67%,这些QTLs的加性效应均表现为负值,说明来源于日本晴的位点对水稻结实率均有减效作用。
- 周勇缪军陶亚军朱金燕王军王中德梁国华
- 关键词：水稻数量性状位点结实率
- 利用染色体单片段代换系定位水稻结实率QTL被引量：2
- 2014年
- 结实率是评价水稻品种应用价值的重要农艺性状之一，是产量重要的构成因素，易受到高温、低温、干旱等环境因素的影响，对结实率QTL进行定位并研究其遗传效益在水稻育种中至关重要，为进一步精细定位及克隆相应QTL和开展水稻结实率分子育种奠定基础。以籼稻品种扬稻6号为受体、粳稻品种日本晴为供体构建的一套染色体片段代换系为材料，利用多元回归分析方法，结合Bin图谱，对代换系上的结实率QTL进行鉴定，结果表明，在水培条件下共定位14个控制水稻结实率性状的QTL，分别位于3-11染色体上，其中，2010年定位2个，2011年定位5个，2012年定位7个；贡献率大于20％的QTL共有9个，分别是qSSR5．1、qSSR7．1、qSSR9．1、qSSRll．1、qSSR3．2、qSSR3．3、qSSR4．1、qSSR8．2和qSSR9．2WTBZ1，其中，贡献率最大的QTL为qSSR5．1，贡献率为49．76％，被定位在第5染色体上731482bp区间内。
- 高云陶亚军王立广于小凤陈达董桂春梁国华
- 关键词：水稻数量性状结实率
- 基于染色体单片段代换系的水稻糙米率QTL的定位被引量：4
- 2013年
- 以广陆矮4号为受体,日本晴为供体的119个染色体单片段代换系为材料,通过单因素方差分析和Dunnett’s多重比较,分析染色体单片段代换系与受体亲本之间糙米率的差异,对代换片段上的糙米率相关QTL进行鉴定。以P≤0.001为阈值共检测到2个糙米率QTL,利用代换作图法将其分别定位在第6染色体和第9染色体上,2个QTL均表现为增效作用,增效位点来自于粳稻亲本日本晴,其加性效应值分别为1.49%和1.32%,加性效应百分率分别为1.89%和1.68%。该研究对进一步发掘和利用新的水稻糙米率QTL具有重要意义,同时对提高水稻糙米率、增加稻米的实际产量具有十分重要的经济价值。
- 周勇高云朱松松朱金燕王军裔传灯仲维功梁国华
- 关键词：水稻糙米率数量性状位点
- 利用染色体单片段代换系定位水稻粒重 QTL被引量：2
- 2013年
- 粒重是决定水稻产量的三要素之一,是由多基因控制的数量性状。以广陆矮4号为受体,日本晴为供体的119个染色体单片段代换系群体为试验材料,利用SPSS软件分析了粒重与粒形性状之间的相关性,通过单因素方差分析和Dunnett's多重比较,测验单片段代换系与受体亲本广陆矮4号之间粒重的差异,以2年都能检测到的显著差异位点作为稳定表达的QTL。结果表明:千粒质量与粒长、长宽比呈极显著正相关,与粒宽、粒厚相关性不显著;以P≤0.001为阈值,2年都能检测到的千粒质量相关QTL 19个,分布在除第10,12染色体以外的10条染色体上。其中,10个QTL的加性效应表现为增效作用,其加性效应值的变化为0.49～2.74 g,加性效应百分率的变化为2.00%～11.05%;9个QTL加性效应表现为减效,加性效应值的变化为0.60～2.35 g,加性效应百分率的变化为2.40%～9.48%。这些QTL的鉴定,为进一步精细定位或克隆相应QTL奠定了基础。
- 王军王军杨杰杨杰朱金燕范方军李文奇仲维功
- 关键词：水稻单片段代换系数量性状千粒质量
- 稻瘟病抗病基因Pi-k^h功能标记的开发及江苏粳稻品种中Pi-k^h的变异被引量：23
- 2014年
- 稻瘟病抗病基因Pi-kh是对稻瘟病菌具有广谱抗性的一个重要基因。根据Pi-kh感病基因和抗病基因序列存在143bp插入的特征,设计了InDel标记FM143。Tetep具有抗病基因Pi-kh,分子标记FM143PCR扩增带型为非插入带型,而不携带Pi-kh的材料的带型为插入带型。利用该标记对Tetep与宁9108的F2群体进行分析,结果表明该标记能准确区分Pi-kh、Pi-kh纯合及杂合基因型,标记基因型符合1∶2∶1比例,没有发生偏分离现象。利用该标记对65份江苏省历年来大面积推广的粳稻品种和64份粳稻品系进行检测,筛选出具有非插入带型的粳稻品种19份、粳稻品系22份。进一步对江苏省粳稻品种中Pi-kh位点进行测序,发现江苏粳稻品种(系)Pi-kh基因座位与Tetep和已经登录的Pi-kh序列相比在102bp处存在一个单碱基的变异(由G突变为C),使得谷氨酸变异为天门冬氨酸,且该变异高度保守。将江苏省粳稻品种中发现的Pi-kh位点的等位基因暂定名为Pi-khJSJ。
- 王军杨杰朱金燕范方军李文奇王芳权黄转运仲维功
- 关键词：水稻稻瘟病
- 基于染色体单片段代换系的水稻粒形QTL定位被引量：29
- 2013年
- 水稻的粒形是影响水稻产量和品质的重要因子之一,是由多基因控制的数量性状。染色体单片段代换系由于减少了个体间遗传背景的干扰,已经成为鉴定复杂性状QTL的新型遗传材料。本研究以广陆矮4号为受体,日本晴为供体的119个染色体单片段代换系群体为试验材料,通过单因素方差分析和Dunnett’s多重比较,测验单片段代换系与受体亲本之间粒形的差异,鉴定了代换片段上粒形相关的QTL。以P≤0.001为阈值,共检测到39个粒形相关的QTL。其中,粒长相关的19个,其加性效应值为0.18～1.06mm,加性效应百分率为2.40%～14.13%;粒宽相关的14个,其加性效应值为0.09～0.31mm,加性效应百分率为2.71%～9.15%;粒厚相关的6个,其加性效应值为0.05～0.10mm,加性效应百分率为2.14%～4.46%。这些QTL的鉴定为进一步精细定位并克隆相应QTL和高产、优质水稻新品种的分子标记辅助选择奠定了基础。
- 王军朱金燕周勇杨杰范方军李文奇梁国华仲维功
- 关键词：水稻单片段代换系数量性状粒形
- 水稻中脉缺陷突变体dl-6的遗传分析与精细定位被引量：1
- 2014年
- 为了克隆DL-6基因,以dl-6与9311配制正反杂交组合进行性状分析发现,dl-6突变性状受1对隐性核基因控制,利用SSR分子标记将控制dl-6性状的基因DL-6初步定位在水稻第3染色体的短臂上,进一步利用新发展的In Del标记将DL-6基因精细定位在I3-5和I3-8之间85 kb的物理距离内。对该区段内存在的开放阅读框(ORF)进行分析,发现其中ORF9编码的YABBY基因是一个与叶脉发育相关的基因,对突变体dl-6和野生型中YABBY基因进行测序,将测序结果与数据中日本晴序列进行比对发现,突变体dl-6中YABBY基因的第1个外显子存在1个单碱基突变,该突变导致野生型中编码的半胱氨酸突变为突变体中的精氨酸;同时突变体dl-6在YABBY基因的3'端还存在8个碱基的缺失。这2个突变位点哪个是导致dl-6突变的功能区目前还不确定,有待进一步研究。
- 王军王婧杨杰赵祥强朱金燕范方军李文奇王芳权仲维功
- 关键词：水稻基因定位
- 水稻稻瘟病广谱抗病新等位基因pi21t的鉴定及其抗性应用被引量：7
- 2014年
- 为不断发掘和鉴定新的抗性基因,从而克隆和利用广谱持久抗性基因,选育水稻广谱抗稻瘟病新品种,解决稻瘟病危害。根据已克隆的水稻稻瘟病广谱抗病隐性等位基因pi21的序列设计分子标记Pi21-1,对育种上高频率使用的广亲和品种02428进行PCR扩增,测序比较分析发现了新的等位基因类型,同时对广亲和品种02428进行田间稻瘟病接种鉴定,苗期鉴定结果为免疫,从而鉴定了一个广谱抗稻瘟病的新等位基因pi21t,为水稻广谱抗稻瘟病育种提供了新的有利资源。通过分子标记辅助选择,能够快速明确目标品种中所携带目标基因的等位基因型,从而加快水稻广谱抗稻瘟病育种的进程,提高抗病效率。
- 朱金燕王军范方军李文奇王芳权仲维功杨杰
- 关键词：水稻稻瘟病等位基因型
- 水稻千粒重基因TGW6功能标记的开发与利用被引量：13
- 2014年
- 水稻粒重是影响产量及品质的重要性状之一,TGW6是能显著增加千粒重同时不影响稻米品质的粒重基因。为提高千粒重基因TGW6在育种中的选择效率,在前人克隆的基础上,根据TGW6与其等位基因tgw6在功能区域存在的单碱基缺失,设计和筛选出TGW6基因的功能标记CAPs6-1,对CAPs6-1扩增的PCR产物测序验证,说明CAPs6-1可以准确鉴定出TGW6的不同基因型。利用该标记对不同来源的43份籼稻资源、江苏2007-2013年审定的65份粳稻品种和太湖流域179份粳稻地方资源进行了TGW6基因型检测,筛选到携带TGW6基因的籼稻资源14份,244份粳型资源均不携带TGW6基因,这也说明TGW6主要分布在籼型水稻资源中,在粳型资源中几乎不存在。
- 王军杨杰徐祥朱金燕范方军李文奇王芳权仲维功
- 关键词：水稻千粒重
- 基于染色体单片段代换系的水稻芒性QTL定位被引量：4
- 2013年
- 水稻的芒性是一个与驯化相关的重要性状,是由多基因控制的数量性状,遗传基础复杂,且易受环境因素影响。染色体单片段代换系由于减少了个体间遗传背景的干扰,已经成为鉴定复杂性状QTL的新型遗传材料。以籼稻品种广陆矮4号为受体和粳稻品种日本晴为供体构建而成的119个染色体单片段代换系为材料,对芒长性状进行了调查分析。结合2011,2012年的调查结果,通过代换作图共鉴定出15个与芒性相关的QTL,这些QTL分布在除1,10,12外的9条染色体上,第3染色体上检测到的QTL最多为3个。15个QTL中效应最大的QTL是qAN4-1,2年平均芒长为4.7 cm;效应最小的QTL是qAN11-2,2年平均芒长为0.7 cm。这些QTL的定位,为进一步克隆芒性相关基因以及研究芒性的分子机理提供了重要的依据。
- 王军朱金燕周勇杨杰范方军李文奇梁国华仲维功
- 关键词：水稻单片段代换系数量性状
