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国家重点基础研究发展计划(G19990160000)

作品数：1 被引量：5H指数：1
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文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇农业科学

主题

  • 1篇杉木
  • 1篇文库构建
  • 1篇CDNA文库
  • 1篇CDNA文库...
  • 1篇EST
  • 1篇EST分析

机构

  • 1篇南京林业大学

作者

  • 1篇王桂凤
  • 1篇施季森
  • 1篇洑香香
  • 1篇杨立伟

传媒

  • 1篇分子植物育种

年份

  • 1篇2008
共 1 条 记 录，以下是 1-1
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排序方式：
杉木茎段皮层cDNA文库构建及EST分析被引量：5
2008年
在利用ZAP Express cDNA试剂盒构建杉木茎段皮层cDNA文库,随机测序共获得1119条有效序列。利用Sequencher 2.0 Demo软件对EST进行聚类分析与拼接,共获得354个非重复序列(UniGenes),其中包括129个重叠群(contigs)(占36.44%)和225个独立ESTs(singletons)(占63.56%)。BlastX比对发现仅有16.4%UniGenes和数据库中至少1条序列是高度相似、19.8%为中度相似、14.1%低度相似,而有近50%在数据库中无匹配序列。基因注释发现文库中表达量较高的特征基因有ARP(auxin-repressed protein)、金属硫因蛋白(metallothionein-like protein,MT)、bZIP转录因子。其中ARP(auxin-repressed protein)是值得关注的基因片段,它可能与杉木分枝及茎的伸长有关。
洑香香杨立伟施季森王桂凤
关键词：杉木CDNA文库构建EST
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