安徽省自然科学基金(1208085MC36)
- 作品数：3 被引量：15H指数：2
- 相关作者：庄丹甘德芳丁飞吴娇梁丹迪更多>>
- 相关机构：安徽农业大学更多>>
- 发文基金：安徽省自然科学基金安徽省高校省级自然科学研究项目安徽省高等学校优秀青年人才基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 黄瓜全基因组转录因子MADS-box家族基因的序列特征分析被引量：11
- 2012年
- MADS-box家族基因是一类编码转录因子的基因,因其在调控植物生长发育方面的重要功能而成为作物遗传育种研究的热点。采用生物信息学方法,对黄瓜全基因组MADS-box基因进行序列特征分析,包括CsMADS基因的数量、染色体定位、保守基序的分布及系统进化树分析。结果表明,黄瓜基因组中共有41个CsMADSs基因,除7个分布于Scaffold外,其他34个CsMADSs基因分布于黄瓜7条染色体上,但在染色体上的分布不是均匀的;41个CsMADSs都具有保守的MADS结构域,分布于9个MADS亚家族,而且大部分的CsMADSs基因属于SEP和MEF2-like分支。该研究结果不仅有助于MADS-box转录因子信号转导途径的解析,而且可为进一步研究该家族基因的功能提供信息参考。
- 甘德芳丁飞庄丹梁丹迪
- 关键词：黄瓜转录因子生物信息学
- 黄瓜AP1-FUL类MADS-box基因的克隆及表达分析被引量：5
- 2014年
- MADS-box基因在植物生长发育过程中起着非常重要的作用。利用生物信息学方法,获得黄瓜AP1-FUL类CsMADSs基因;半定量RT-PCR检测CsMADSs在黄瓜不同生长发育阶段及不同器官中的表达情况。结果表明,本研究克隆得到三个CsMADSs基因,长度分别为636bp、747和648bp。CsMADS08和CsMADS10在黄瓜不同时期的不同器官中均能表达,其中,CsMADS08在茎和叶中的表达量较高,而CsMADS10在顶芽中表达量较高;CsMADS21基因除了在1叶和5叶期的各器官中都能表达外,在其他器官只是部分表达,且表达量都比较低。另外,CsMADS08和CsMADS10几乎在7叶期黄瓜的所有器官中都表达,而CsMADS21只在少数器官中表达,以幼果中表达量较高,而在根、茎及较大的卷须中都不表达。该研究结果不仅能够明确黄瓜CsMADSs基因的时空表达模式,而且为进一步研究CsMADSs基因的功能提供理论依据。
- 甘德芳吴娇庄丹梁丹笛占梦丹郝福玲
- 关键词：黄瓜MADS-BOX卷须克隆转录因子
- 6-BA诱导黄瓜CsaIAAs基因的表达研究被引量：1
- 2014年
- Aux/IAA基因是一类典型的能被生长素诱导表达的基因家族,可以被生长素、细胞分裂素、盐及干旱胁迫等诱导表达。采用Trizol法提取黄瓜幼苗的根、茎、叶、花及卷须的总RNA,经反转录成cDNA,再利用CsaIAAs基因特异性引物进行半定量RT-PCR扩增,琼脂糖凝胶电泳检测CsaIAAs基因的表达情况。结果表明,黄瓜29个CsaIAAs基因中,除了CsaIAA25、CsaIAA26几乎在所有器官中都不表达外,CsaIAA07、CsaIAA09、CsaIAA16和CsaIAA20只在个别器官中表达,如CsaIAAs20只在茎中弱表达,CsaIAA29只在卷须中有弱的表达。而绝大部分的CsaIAAs基因(CsaIAA02、CsaIAA03、CsaIAA04、CsaIAA05、CsaIAA06、CsaIAA08、CsaIAA10、CsaIAA11、CsaIAA13、CsaIAA15、CsaIAA16和CsaIAA19等)在大多数器官中都可以被6-BA诱导表达,尤其是以根、茎、叶和卷须中表达量高。探讨CsaIAAs基因在黄瓜根、茎、叶、花及卷须中的表达情况,可为黄瓜CsaIAAs基因的功能研究提供重要的理论参考。
- 庄丹丁飞吴娇甘德芳
- 关键词：黄瓜细胞分裂素AUX
