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大豆GmDAO1基因的功能预测及表达分析被引量：3: 2017年; 本研究通过在大豆基因组数据库中检索拟南芥AtDAO1在大豆中的同源基因,获得了GmDAO1基因序列。通过对GmDAO1基因编码的氨基酸序列及启动子序列进行生物信息学分析,我们发现GmDAO1基因CDS序列全长951bp,编码316个氨基酸。GmDAO1编码的蛋白为亲水性蛋白,具有1个N-糖基化位点、3个激酶磷酸化位点与1个豆蔻酰化位点。结构域分析表明GmDAO1含有双加氧酶与2OG-Fe(II)加氧酶结构域,是2-酮戊二酸依赖性双加氧酶基因(2-ODD)家族的成员。GmDAO1预测的启动子区域含有与激素、胁迫、光应答、生物钟调控和转录因子结合相关的顺式作用元件。系统进化分析结果表明DAO1在豆科植物进化过程中比较保守。组织特异性表达分析结果显示GmDAO1在叶片中表达量最低,在根中表达量最高。因此我们推测其可能参与生长素的代谢途径。; 李冬梅张宇航李永光李文滨; 关键词：大豆生长素生物信息学

大豆miR172家族成员序列及表达模式初步分析被引量：8: 2015年; Micro RNAs(miRNAs)在植物的生长发育以及植物对环境的适应方面发挥了重要的作用,成为近几年研究的热点。mi R172家族是一个保守的mi RNA家族,之前的研究表明mi R172的作用涉及生长期过渡、闭花受精、花器官发育、开花时间调控等方面。但是到目前为止,人们对大豆mi R172家族的了解还不是很清楚。本实验通过mi RBase、PLACE数据库及DNAman软件对gma-mi R172家族成员的前体序列、成熟序列、启动子序列进行比较分析,发现gma-mi R172家族成员成熟序列虽然高度保守,但前体序列具有一定的差异,这可能导致了各成员的功能差异;启动子分析显示其启动子含有光反应原件和多种非生物胁迫响应元件,推测其可能参与大豆的开花调控和逆境胁迫响应。通过实时定量PCR分析了大豆mi R172成员的组织特异性表达情况。利用PMRD数据库对gma-mi R172的靶基因进行了生物信息学分析,获得了7个AP2-like类转录因子,参与花器官发育、开花时间调控及非生物胁迫响应的方面。上述结果初步分析了大豆mi R172家族的功能与靶基因,对今后进一步分析研究大豆mi R172家族及其靶基因打下了基础。; 王涛李永光李文滨; 关键词：大豆靶基因

大豆GmNFYB1基因功能预测及表达分析被引量：7: 2015年; 本研究对大豆Gm NFYB1(Glyma02g17310)进行基因功能和表达分析,利用Plant CARE分析启动子元件发现,在基因启动子序列中含有多个与ABA、抗旱、光反应相关的元件。在The Bio-Analytic Resource for Plant Biology数据库中分析了Gm NFYB1的同源基因At NFYB5在不同逆境胁迫和不同激素处理时的基因表达情况,表明该基因表达具有组织表达特异性,参与盐胁迫、渗透胁迫等反应。Gm NFYB1在大豆的q RT-PCR结果表明,该基因受ABA、Na Cl、PEG诱导上调表达,参与大豆抗逆反应。; 王涛李永光王英琪薄蕾李真李文滨; 关键词：大豆脱落酸干旱胁迫盐胁迫

大豆木质素相关基因Glyma06g28890基因功能预测及表达分析被引量：1: 2016年; 拟南芥At PRXs基因家族属于过氧化物酶类,在植物木质素形成过程中发挥了重要的作用。本研究对ATPRX在大豆中的同源基因Glyma06g28890进行基因结构功能预测和表达分析,发现了Glyma06g28890和At PRXs相同,具有一个保守的Plant peroxidase结构域,并且与ATPRX25具有最高的相似度;通过启动子顺式作用元件统计,发现在基因启动子序列中含有厌氧诱导调节、激素响应、分生组织表达以及植物防御相关的元件。Glyma06g28890在大豆的组织特异性表达分析结果表明,它在植物内木质素广泛分布的组织内,如根和茎内都有较高水平的表达。; 李冬梅王涛李永光李文滨; 关键词：大豆木质素植物防御

转GmHAP3-17基因大豆的抗旱性分析被引量：3: 2015年; Gm HAP3-17基因是一个与At HAP3-1同源的转录因子,本研究利用超表达Gm HAP3-17大豆,在模拟干旱条件下以及田间干旱试验下进行了转基因大豆的抗旱性分析。结果显示:在大棚盆栽模拟干旱胁迫条件下,转基因大豆H16、H18、H26比野生型大豆WT根系发达,主根长且侧根较多,植株生长状态比对照好,叶片枯萎发生较迟、程度较轻。转基因大豆与野生型相比,MDA含量低,叶片伤害度较轻,叶片含水量较高。进一步研究表明,在田间自然干旱胁迫下,转基因大豆同样表现出较好的生长状况,较低的叶片伤害度和较高的叶片含水量。在自然干旱条件下,与野生型大豆相比,转Gm HAP3-17基因大豆表现为根系发达、扎根深、侧根多,增加了株高、主茎节数、有效分枝数。H26株系的有效荚数、单株粒数、单株粒重、百粒重均比野生型提高明显,表现出了显著的产量优势。上述结果表明:GmHAP3-17基因具有正调控干旱的功能,因而该基因将成为培育抗旱转基因作物的一个有效的基因资源。; 王鼎慧李永光李真李文滨; 关键词：GM 大豆抗旱性基因功能分析

大豆Glyma03g24460基因功能预测及表达分析被引量：5: 2016年; 大豆Glyma03g24460基因,与拟南芥ECERIFERUM1(CER1)基因具有高度的同源性,是一种植物角质层蜡质基因,参与植物角质层蜡质的合成。本研究对其进行基因功能预测和表达分析,利用Plant CARE分析启动子元件发现在基因启动子序列中含有黄酮合成、激素响应、生物和非生物胁迫相关的元件。氨基酸序列比对发现Glyma03g24460与其他物种的脂肪醛脱羧酶基因家族成员有很高的相似度。Glyma03g24460在大豆的q RT-PCR结果表明,它主要在植物的地上器官表达,并且可以受到ABA及干旱等非生物胁迫的诱导表达。; 李冬梅王涛陈薇李悦李永光李文滨; 关键词：大豆角质层蜡质脱落酸非生物胁迫

转GmGI基因烟草T3株系的鉴定及其农艺性状的统计分析被引量：1: 2016年; 本研究将大豆中调控光周期途径的关键基因Gm GI转入Havana 425烟草中,以非转基因Havana425烟草为对照,对获得的转Gm GI基因T3代烟草的4个株系的花期、产量以及其它农艺性状统计分析。结果表明,与非转基因烟草对照相比,除GI6株系外,其余3个株系株高与单株粒重提升明显,花期平均提前了31.5 d。上述结果表明:Gm GI基因使植物的花期提前的同时提高了植物的产量,因而该基因对于改良植物的光敏感特性,打破品种种植的地域限制、选育高产的优良品种是一个重要的基因资源。; 姜敏景雅张宇航李涵哲孙铭阳陈薇李悦李永光李文滨; 关键词：转基因烟草农艺性状早花

大豆GmPLP1启动子的克隆及功能分析被引量：1: 2014年; 本研究利用染色体步移法从大豆栽培品种东农L13基因组中分离得到了GmPLP1基因1.5 kb的启动子片段,利用PLACE和PlantCARE在线启动子预测工具发现了107个调控元件。将该片段定向替换载体pBI121的CaMV35S组成型启动子,构建表达载体pBI121-pGmPLP1,驱动下游报告基因GUS基因表达,并通过组织化学染色和GUS定量分析对预测结果进行验证,结果显示GmPLP1受黑暗、蓝光、低温、GA3和ABA诱导表达。; 李永光张宇航罗秋兰谷翰卿李文滨; 关键词：GUS基因组织化学染色顺式调控元件

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国家自然科学基金(31201228)