国家重点基础研究发展计划(2011CB111501)
- 作品数：7 被引量：22H指数：4
- 相关作者：甘尚权王新华沈敏刘守仁张伟更多>>
- 相关机构：新疆农垦科学院石河子大学新疆农业职业技术学院更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金兵团博士基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 绵羊7号染色体46 818 598位点在脂臀阿勒泰羊群体中的多态检测及分析被引量：2
- 2014年
- 为了研究影响阿勒泰羊臀脂沉积的分子标记,研究以国外新近报道的7号染色体一处可能与尾脂性状关联的单核苷酸多态性(SNP)为研究对象,采用PCR-SSCP的方法检测该位点在我国脂臀型阿勒泰羊群体中的多态性,并分析该位点与脂臀性状的关联性。结果表明:绵羊7号染色体46 818 598位点SNP的各基因型在我国脂臀型阿勒泰羊群体中符合孟德尔分离定律,且等位基因比值接近1.0,该位点在阿勒泰羊群体中的分布没有差异。说明绵羊7号染色体46 818 598位点不能作为影响我国阿勒泰羊臀脂沉积性状的分子标记。
- 甘尚权杨武张伟张伟沈敏刘守仁
- 关键词：多态性分子标记绵羊
- 绵羊X染色体59194976位点多态分析及其与尾(臀)脂性状相关性研究被引量：6
- 2013年
- 尾脂沉积能力在脂尾型绵羊和瘦尾型绵羊间存在很大的差异,但其沉积脂肪的遗传特性与分子机制仍不明晰。为此,本研究选择尾型极端差异的阿勒泰羊(巨型脂臀)、湖羊(短脂尾)和黑萨福克羊(长瘦尾),采用PCR-RFLP方法检测绵羊X染色体59194976位点多态性,分析其与尾(臀)脂沉积能力的相关性。结果表明:在阿勒泰羊群体中G等位基因属优势等位基因,其两等位基因比值(G/A)分别是湖羊和黑萨福克羊的6倍和68倍,且G等位基因在阿勒泰羊中趋于纯合。卡方检验结果表明,阿勒泰羊在该位点均处于HardyWeinberg平衡状态(p>0.05),而湖羊和黑萨福克羊在该位点均处于Hardy-Weinberg极不平衡状态(p<0.01)。以上结果提示,绵羊X染色体59194976位点SNP可作为理想的分子标记应用于高、低脂绵羊品种选育。
- 王世银张伟张伟张伟沈敏李欢梁耀伟杨井泉高磊
- 关键词：等位基因基因型分子标记
- 绵羊X染色体59578440位点多态分析及其与尾(臀)脂性状相关性研究被引量：2
- 2013年
- 【目的】检测绵羊X染色体59578440位点在尾型极端差异的阿勒泰羊、湖羊和中国美利奴细毛羊群体中的多态性,并验证该位点是否可作为一个有效的分子标记应用于低脂绵羊新品种培育。【方法】采用PCR-RFLP方法进行SNP分型,并使用卡方检验的方法验证各基因型在群体中的Hardy-Weinberg平衡性。【结果】扩增出了含绵羊X染色体59578440位点SNP的296 bp片段,经AatⅡ核酸内切酶酶切分型后鉴定出了三种基因型(CC、TT和TC)。C/T等位基因的比值显示阿勒泰羊群体中C等位基因属优势等位基因。【结论】X染色体59578440位点SNP可作为阿勒泰羊选育的一个实用性分子标记。
- 甘尚权张伟张伟沈敏李欢梁耀伟杨井泉高磊刘守仁
- 关键词：等位基因基因型分子标记
- X染色体一处新发现的SNP位点在脂尾(臀)、瘦尾绵羊群体中的多态检测及分析被引量：9
- 2013年
- 脂尾(臀)性状是绵羊逆境生存之需的必要性状,其在尾臀部位大量囤积脂肪的分子机理亟待解析。为此,本研究以国外新近报道的X染色体一处可能与尾脂性状相关的SNP为研究对象,检测该位点在我国巨臀脂型阿勒泰羊、短脂尾型湖羊以及瘦尾萨福克羊群体中的多态性,并验证该位点是否可作为一个有效的分子标记应用于高、低脂绵羊新品种培育。本研究成功地扩增出了含绵羊X染色体59257971位点SNP的170 bp片段,并采用PCR-RFLP方法进行SNP分型。研究结果表明我国脂臀型阿勒泰羊、短脂尾型湖羊和瘦尾萨福克羊在X染色体59257971位点均以AA基因型为主要基因型,3个群体中均没有发现GG基因型,说明脂臀(尾)与瘦尾绵羊品种间、臀尾异常丰满的阿勒泰羊与尾脂较为丰满的湖羊群体间等位基因并无明显差异,暗示该位点不能作为选育我国高、低脂绵羊品种的有效分子标记。
- 甘尚权张伟张伟宋天增沈敏梁耀伟杨井泉高磊刘守仁
- 关键词：等位基因分子标记
- TCF7基因增强子区域一处SNP在三尾型极端差异的绵羊群体中的多态分析被引量：2
- 2015年
- 【目的】检测尾型极端差异的阿勒泰羊、湖羊和藏羊三群体中TCF7基因增强子一处SNP是否存在分化现象,从而确定该SNP是否可作为一个有效地筛选脂尾与瘦尾性状的分子标记。【方法】对三品种绵羊286份基因组进行目标SNP片段的扩增,并采用PCR-RFLP方法对以上样本扩增片段进行酶切分型,最后采用卡方检验的方法验证各基因型在各群体中的Hardy-Weinberg平衡性。【结果】高效扩增出所有样本含该SNP DNA扩增,经Mfe I酶切分型后共鉴定出了三种基因型(CC、TT和CT),其中CC基因型在瘦尾藏羊群体中的百分比高达80.3%,是脂尾型阿勒泰羊与湖羊的两倍以上。C/T等位基因的比率显示藏羊群体中这一比值分别为其他两种脂尾型绵羊品种的8倍,提示T等位基因可能与脂尾性状相关。【结论】该SNP可作为脂、瘦尾羊选育的一个分子标记。
- 杨井泉宋天增张伟张伟高磊刘守仁甘尚权
- 关键词：等位基因分子标记
- X染色体60149273位点在脂尾(臀)和瘦尾绵羊品种中的多态性及其基因定位被引量：13
- 2013年
- 【目的】研究绵羊X染色体60149273位点在不同沉脂尾型绵羊品种中的多态性,为解析绵羊尾脂沉积性状的遗传机制提供基础数据。【方法】首先,采用PCR-SSCP分型方法检测X染色体60149273位点在不同脂尾类型绵羊品种的多态性,并借助PCR产物直接测序的方法确认各基因型相应序列,利用卡方检验的方法检测各基因型分布在不同品种中的平衡性。其次,利用生物信息方法将该SNP定位与绵羊androgen receptor(AR),并使用电子克隆的方法克隆出绵羊AR全长编码序列。同时以阿勒泰羊臀部脂肪RNA为材料,采用RT-PCR的方克隆绵羊AR第3—8外显子序列,利用生物信息学方法分析序列同源性以及序列的物种进化保守性。【结果】①PCR-SSCP结果显示,在脂尾(臀)型绵羊品种阿勒泰羊和湖羊群体中X染色体60149273位点未检出多态性,GG基因型占100%;而瘦尾(臀)型绵羊品种中国美利奴和萨福克羊群体中则出现了多态性,GG基因型分别下降至10%和21%。②利用比较基因组学首次电子克隆出该SNP所属基因AR的全长编码区,并从阿勒泰羊臀脂mRNA中成功扩增羊源AR第3—8外显子片段,测序结果与电子克隆序列完全一致。③物种同源性比对进一步显示,AR在哺乳类动物中高度保守,哺乳动物各物种间同源性高达90%;进化树分析结果显示,牛、绵羊、海豚和猪等哺乳动物亲缘较近。【结论】首次发现绵羊AR第3内含子一处SNP在脂尾(臀)与瘦尾绵羊品种中存在较大差异,该SNP将可作为一个分子标记运用于低脂绵羊新品种的培育,同时该SNP所属AR也可作为一个重要候选功能基因应用于绵羊尾(臀)脂沉积分子机制的相关研究。
- 甘尚权沈敏李欢梁耀伟杨井泉高磊刘守仁王新华
- 关键词：阿勒泰羊多态性标记基因
- 绵羊7号染色体46843356位点多态性与尾脂沉积相关性研究被引量：5
- 2014年
- 为探讨绵羊7号染色体上46843356位点多态性与绵羊尾脂沉积的关系,以尾型极端差异的阿勒泰羊、小尾寒羊、中国美利奴细毛羊以及萨福克羊为研究对象,利用PCR-RFLP检测该位点在群体中的多态性。结果表明:46843356位点在尾脂沉积能力较差的中国美利奴细毛羊和萨福克羊群体以AA基因型为主,而尾脂沉积能力强的阿勒泰羊群体则以GG和GA基因型为主,阿勒泰羊和小尾寒羊G/A等位基因频率比值为2.48和4.22,分别是萨福克羊的83倍和141倍。卡方检验结果表明,阿勒泰羊和小尾寒羊在该位点上处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),而中国美利奴细毛羊和萨福克羊在该位点上处于Hardy-Weinberg极度不平衡状态(P<0.01)。以上结果提示,绵羊7号染色体上46843356SNP位点在脂尾(臀)与瘦尾绵羊群体中存在较大差异,可作为理想的分子标记应用于高、低脂绵羊品种选育。
- 张伟张伟张伟赵伟利沈敏赵伟利许瑞霞宋广超刘守仁
- 关键词：阿勒泰羊多态性基因型
