国家高技术研究发展计划(2002AA2Z1001-06)
- 作品数:2 被引量:164H指数:2
- 相关作者:万建民李强翟虎渠江玲赵志刚更多>>
- 相关机构:南京农业大学中国农业科学院更多>>
- 发文基金:国家高技术研究发展计划国家转基因植物研究与产业化专项引进国际先进农业科技计划更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术农业科学更多>>
- SSRHunter,一个本地化的SSR位点搜索软件的开发被引量:116
- 2005年
- 基因组研究的发展,使得利用生物信息学方法在一个相对狭小的基因组区段内开发新的SSR标记成为可能。要实现这一点,首先面临的任务就是潜在的SSR位点的搜索。已有的方法或多或少存在这样或那样的缺陷。文章介绍了利用Visual Basic语言开发本地化的SSR位点搜索软件的尝试。所编制的SSRHunter软件能够较出色地完成这一任务。此外,SSRHunter还提供了自动序列预处理,常规的序列整理和序列变换功能以及方便的结果输出方式。
- 李强万建民
- 关键词:SSRVB生物信息学
- 水稻孕穗期耐热性QTLs分析被引量:48
- 2006年
- 以USSR5(粳稻)/广解9号(籼稻)//USSR5回交群体为供试材料,构建了相应的分子连锁图谱,分别以高温处理下直接小穗育性及小穗育性热敏感指数为指标,对水稻孕穗期高温耐热性及其相对耐热性进行数量性状位点(QTLs)分析.结果表明,在第2、4和5染色体上检测到孕穗期耐热性相关的QTL各1个,对表型变异的解释率为6.4%~15.8%;在第4、8染色体上分别检测到与孕穗期相对耐热性相关的QTL,即qhts-4和qhts-8,LOD值分别为3.81和2.86,对表型变异的解释率分别为16.8%和9.9%.对其进一步的上位性分析表明,有8条染色体的4对位点存在基因间互作,小穗育性耐热性除受主效QTL控制外,还受基因间互作及修饰基因的影响.
- 赵志刚江玲肖应辉张文伟翟虎渠万建民
- 关键词:水稻高温胁迫数量性状位点