福建省自然科学基金(B0520002)
- 作品数：7 被引量：49H指数：2
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- 相关机构：福建农林大学中国农业科学院福建中医学院更多>>
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- 全基因组预测稻瘟病菌的分泌蛋白
- ＜正＞分泌蛋白多为病原微生物与植物受体蛋白起作用的激发子和其他致病因子,深入研究分泌蛋白将有助于明确植物与病原微生物互作的分子机制。利用稻瘟病菌基因组学研究成果, 结合计算机技术和生物信息学的方法,分析其分泌蛋白组学,将...
- 陈继圣郑士琴郑武周洁鲁国东王宗华
- 文献传递
- 全基因组预测稻瘟菌的分泌蛋白被引量：43
- 2006年
- 目的分泌蛋白多为病原微生物与植物受体蛋白起作用的激发子和其它致病因子,深入研究分泌蛋白将有助于明确植物与病原微生物互作的分子机制。利用稻瘟菌基因组学研究成果,结合计算机技术和生物信息学的方法,分析其分泌蛋白组学,将有助于全面掌握其致病因子的结构与功能。方法利用SignalP对稻瘟菌基因库中所有ORF的N-端信号肽存在与否进行预测,再依次通过Protcomp、TMHMM、big-PIPredictor和TargetP预测程序进行验证,寻找出所有可编码信号肽的基因。结果对11108个稻瘟菌的ORF进行分析,最终预测出共有1235个ORF可编码分泌蛋白。结论经验证此预测方法之可靠性较高,这为深入研究分泌蛋白组学奠定了基础。
- 陈继圣郑士琴郑武周洁鲁国东王宗华
- 关键词：稻瘟菌分泌蛋白信号肽
- 稻瘟菌若干T-DNA插入突变体初步分析
- 2007年
- 为揭示稻瘟菌致病分子机制,创建了该菌T-DNA插入突变体库．部分突变体经表型分析,获得3个生长发育及致病性同时发生变异,5个生长发育正常但致病性变异及2个生长发育变异但致病性正常的突变体；以TAIL-PCR方法获得了这些突变体T-DNA插入位点及其边界序列,并用生物信息方法对被T-DNA标签的基因进行了分析,为进一步研究这些基因的功能提供了重要信息．
- 魏艺聪潘初沂李宏宇鲁国东雷财林王宗华
- 关键词：稻瘟菌生物信息
- 稻瘟病菌两个假定GPCR基因的功能分析
- ＜正＞稻瘟病菌（Magnaporthe grisea）是研究丝状真菌的重要模式生物,也是引起水稻重要病害稻瘟病的病原菌。该菌侵染循环过程经历了分生孢子萌发、附着胞分化、侵入栓的形成以及侵染生长,这一过程涉及复杂的细胞分化...
- 刘淑集韩雁琳陈庆河鲁国东王宗华许金荣
- 文献传递
- 稻瘟病菌一个假定的漆酶基因功能分析
- 2008年
- 漆酶可能是病原真菌毒力因子之一。稻瘟病菌基因组共有16个假定的漆酶类基因,对其中的Mgg_00551.5进行了生物信息学和分子遗传学分析,以明确其功能。生物信息学分析表明该漆酶是具有3个多铜氧化酶结构域、可以分泌到胞外的蛋白。经基因敲除表明,Mgg_00551.5功能缺失突变体ΔMG0551-13的漆酶活性比野生型菌株稍低,但是其生长速度、产孢能力、致病性等方面与野生型菌株相比均无明显差异,可能是功能冗余所致。进一步的双突变或多突变可能是明确漆酶功能的重要方法。
- 刘文德陈新赵传志刘淑集Minoo Razee鲁国东王宗华
- 关键词：稻瘟病菌漆酶基因敲除功能分析
- 稻瘟病菌Subtilases家族生物信息学分析及其中一蛋白的分泌性检验被引量：1
- 2009年
- 根据已有的研究结果推测稻瘟病菌Subtilases家族基因可能在其致病过程中具有重要的功能,本研究以进化理论为基础,结合一些生物信息学的软件对稻瘟病菌基因组中Subtilases家族基因进行了比较基因组、进化分析及功能域分析,分析了Subtilases家族对稻瘟病菌致病性的重要性,并推测家族中不同基因的结构、功能及参与的生理过程可能的异同之处,以基因MGG_07965.6为例,分析其可能具有的生物学功能,并通过实验的方法证实了其基因表达产物确是分泌蛋白。
- 魏艺聪王宗华鲁国东
- 关键词：稻瘟病菌分泌蛋白比较基因组进化分析
- 稻瘟病菌丝氨酸蛋白酶基因MGSP3的功能分析
- ＜正＞植物与病原菌相互作用的过程中,涉及双方许多信号分子的识别与传导。在病原菌方面,这些信号分子往往就是与植物受体蛋白起作用的激发子和其他致病因子。分泌蛋白因其分泌到体外的特性,最有可能是病原菌分泌到细胞外与寄主受体蛋白...
- 魏艺聪周洁王宗华鲁国东
- 文献传递
- 稻瘟病菌Rab族蛋白的结构及演化分析被引量：1
- 2009年
- 运用生物信息学方法,进行稻瘟病菌基因组中假定的Rab蛋白结构分析、建立系统进化树、预测Rab蛋白可能的组织和时空表达特点。结果表明,稻瘟病菌基因组共有11个假定的Rab蛋白成员,这些蛋白均含Ras超家族典型的结构域,但具有可以区别于Cdc42等Rho家族小GTP酶的特征,部分Rab成员表现出组织与时空表达的特异性;进一步系统进化分析表明,23种真菌Rab蛋白在进化树上聚成8个分枝,并显示出Rab蛋白的分化可能早于真菌种类的分化。
- 张冬梅方坤海石振华王爱荣鲁国东王宗华
- 关键词：稻瘟病菌RAB蛋白系统进化
- 稻瘟菌T-DNA插入所致Pi9致病突变体的获得被引量：1
- 2006年
- 利用自建稻瘟菌菌株FJ95054B T-DNA插入突变体库,筛选获得2个对水稻品种P i9致病的突变体P i9-2-8T940017401和P i9-1-2 T940032801.以T-DNA侧翼序列为探针筛选该菌株的BAC文库,得到阳性BAC克隆.
- 林艳潘初沂李宏宇陈丽华鲁国东王宗华
- 关键词：稻瘟病菌T-DNA插入突变
