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天津市卫生局科技基金(2011KZ87)
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卷曲蛋白6基因多态性与中国北方汉族儿童神经管缺陷的相关性
2013年
目的研究中国北方汉族儿童卷曲蛋白6基因编码区单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs)与神经管缺陷(neuraltubedefects,NTDs)发生的相关性。方法采用PCR扩增和测序的方法对135例NTDs患儿和135例对照者卷曲蛋白6基因编码区3个错义单核苷酸多态位点(rs827528,rs3808553,rsl2549394)进行基因分型及统计学分析。结果rs3808553等位基因T和基因型TT在病例组中的频率显著高于对照组,T等位基因和.TT基因型儿童发生NTDs的危险性分别是G等位基因和GG基因型的1.575倍(OR=1.575,95%凹1.112~2.230,P=0.010)和2.811倍(OR=2.811,95%CI1.325~5.967,P=0.023);其余2个多态位点在两组间等位基因与基因型分布差异不具有统计学意义。3个SNPs位点问的单体型A—G—C在病例一对照组问分布具有统计学意义(OR=0.560,95%C/0.378—0.830,P=0.004),而单体型A—T—c在病例一对照组间分布也具有统计学意义(OR=1.670,95%C/1.126~2.475,P=0.011)。结论中国北方汉族儿童中卷曲蛋白6基因rs3808553位点多态性与NTDs发生具有明显相关性,基因型TT使NTDs发生的危险度增加,而rs827528和rs12549394位点多态性与NTDs发生无明显相关性。
蔡春泉
石鸥燕
沈永明
马骁
关键词:
神经管缺损
多态性
单核苷酸
中国北方汉族人群VANGL1、FZD3和FZD6基因交互作用与神经管缺陷的关系
2014年
目的探讨VANGL1、FZD3和FZD6基因单核苷酸多态性(SNPs)位点间的交互作用对中国北方汉族人群神经管缺陷(NTDs)患病风险的影响。方法选取VANGLI基因2个SNPs(rs4839469和rs34059106),FZD3基因2个SNPs(rs2241802和rs28639533)以及FZD6基因3个SNPs(rs827528、rs3808553和rs12549394),采用PCR扩增和测序的方法对135例NTDs患者和135例正常对照者进行基因分型,使用多因子降维法软件(MDR)分析基因-基因交互作用。结果VANGLI基因rs4839469位点基因型分布在病例组与对照组之间有差异(P〈0.05),FZD6基因rs3808553位点基因型分布在病例组与对照组之间有差异(P〈0.05);MDR分析结果显示VANGLI、FZD3和FZD6基因交互作用存在于两位点模型(rs4839469-rs3808553)(OR=3.18,95%CI:1.85~5.44;X^2=18.39,P〈0.0001),3位点模型(rs4839469-rs2241802-rs3808553)(DR=4.17,95%CI:2.43-7.14;X2=28.5,P〈0.0001)以及4位点模型(rs4839469-rs2241802-rs827528-rs3808553)(OR=7.34,95%CI:3.98~13.54;X2=45.3,P〈0.0001)。结论VANGL1、FZD3和FZD6基因存在交互作用,并可能增加NTDs的发病风险。
石鸥燕
蔡春泉
黎小沛
孙伟
沈永明
关键词:
神经管缺陷
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