四川省教育厅资助科研项目(08ZB054)
- 作品数：3 被引量：3H指数：1
- 相关作者：胡建平唐典勇刘嵬张智锦常珊更多>>
- 相关机构：乐山师范学院成都大学华南农业大学更多>>
- 发文基金：四川省教育厅资助科研项目更多>>
- 相关领域：生物学理学更多>>
- 用分子模拟方法研究大戟科抗HIV病毒蛋白与腺嘌呤的识别及其运动性
- 2011年
- 大戟科抗HIV病毒蛋白(GAP31)能有效地抑制HIV-1整合酶的整合功能,是一种潜在的抗AIDS药物。作者对GAP31蛋白与其底物腺嘌呤(adenine,ADE)的复合物进行了5 ns的分子动力学模拟,从能量和氢键两个角度详细分析了GAP31与ADE识别中的关键残基。结果表明,ADE主要结合在GAP31的T71～V80、G111～K120、I161～F170及F87所构成的口袋中,模拟结果与实验吻合。最后,分子整体运动性结果说明,分子的构象变化更多地与糖基化相关,与其抑制整合酶的活性关系不大。
- 胡建平刘嵬张智锦范晶唐典勇
- 关键词：腺嘌呤构象
- HIV-1整合酶结构的研究进展
- 2011年
- 完整而确定的HIV-1整合酶结构在基于受体的抗AIDS药物设计中起着重要的作用。概述了HIV-1整合酶的结构和功能,并从片段结构、模建的全长聚集体以及同源体系3个方面综述了整合酶结构的研究进展。给出了各个代表性体系的应用价值。旨在对HIV-1整合酶抑制剂药物设计及筛选平台的建立提供一定的参考。
- 张智锦胡建平
- 关键词：HIV-1整合酶药物设计
- HIV-1整合酶与L708,906抑制剂结合模式及运动性的研究被引量：3
- 2011年
- 前期工作已用分子对接方法获得了HIV-1整合酶与L708,906抑制剂分子的复合物模型(IN_L708,906),现从距离、能量和氢键三个方面详细地分析了IN_L708,906模型中的关键残基.结果表明,复合物模型与蛋白质晶体库中整合酶(IN)与5CITEP的结合模式相近.用主成分分析和动力学交叉相关图方法分别研究了IN_L708,906复合物模型和IN单体的运动模式及相关性差异.计算结果显示,L708,906抑制剂的结合使得IN功能loop区残基柔性下降、分子规律性运动的丧失及集团运动相关性的无序增加,这些可能是酶活性下降的主要因素.模拟结果将有利于基于芳香二酮酸类的抗HIV药物设计.
- 胡建平刘嵬唐典勇张元勤常珊
- 关键词：整合酶药物设计
