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中央高校基本科研业务费专项资金(2012QJ024)

作品数：1 被引量：4H指数：1
相关作者：段红霞李冬玲王珊珊陈文雅彭炜更多>>
相关机构：中国农业大学更多>>
发文基金：中央高校基本科研业务费专项资金国家基础科学人才培养基金更多>>
相关领域：理学更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇理学

主题

  • 1篇三维定量构效...
  • 1篇气味结合蛋白
  • 1篇酰基
  • 1篇构效
  • 1篇构效关系
  • 1篇分子对接

机构

  • 1篇中国农业大学

作者

  • 1篇彭炜
  • 1篇陈文雅
  • 1篇王珊珊
  • 1篇李冬玲
  • 1篇段红霞

传媒

  • 1篇高等学校化学...

年份

  • 1篇2013
共 1 条 记 录，以下是 1-1
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排序方式：
基于昆虫气味结合蛋白的新型酰基哌啶类化合物的构效关系被引量：4
2013年
利用Sybyl7．3软件对29个具有驱避活性的新型酰基哌啶类化合物与气味结合蛋白AgamOBPl的结合模式进行研究，发现二者之间的结合以疏水作用和水桥作用为主．其中酰基哌啶类化合物末端的疏水片段可与AgamOBPl结合腔内狭长的疏水通道产生相互作用．同时，其关键药效基团——酰基氧可通过HOHl53与AgamOBPl中的关键残基Twll4和Gly92或Cys95形成多重氢键作用．利用比较分子力场分析法（CoMFA）和比较分子相似性指数分析法（CoMSIA）构建了新型酰基哌啶类化合物的三维定量构效关系（3D—QSAR）模型，其交叉验证系数r：。分别为0．650和0．587．研究表明，在CoMSIA模型中，疏水场、静电场和立体场组合所得的三维构效关系模型最佳，其中尤以疏水场对这类酰基哌啶类化合物的驱避活性最为重要．基于AgamOBPl靶标结合口袋特征和酰基哌啶类化合物的3D—QSAR模型得出具有驱避活性的酰基哌啶类化合物的构效关系如下：在酰基C上引入一定碳链长度的疏水基团可使化合物表现出驱避活性，其中又以含9～10个C的化合物的驱避活性最佳，这与AgamOBPl结合口袋的疏水性质密不可分；当酰基端碳链长度一定时，在哌啶环上不宜引入立体效应过大的取代基，这是由AgamOBPl结合口袋的大小决定的；与哌啶N相连的酰基作为氢键受体基团，对于化合物识别与结合AgamOBPl蛋白至关重要．
陈文雅王珊珊李冬玲彭炜赵静馥段红霞
关键词：气味结合蛋白分子对接三维定量构效关系
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