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中央高校基本科研业务费专项资金(201012200124)
作品数:
2
被引量:2
H指数:1
相关作者:
李敏
武学鸿
潘毅
费耀平
王建新
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相关机构:
中南大学
佐治亚州立大学
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发文基金:
中央高校基本科研业务费专项资金
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相关领域:
生物学
自动化与计算机技术
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李敏
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2篇
2012
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蛋白质网络聚类算法分析平台的设计与实现
被引量:1
2012年
蛋白质网络聚类是识别功能模块的重要手段,不仅有利于理解生物系统的组织结构,对预测蛋白质功能也具有重要的意义。针对目前蛋白质网络聚类算法缺乏有效分析软件的事实,本文设计并实现了一个新的蛋白质网络聚类算法分析平台ClusterE。该平台实现了查全率、查准率、敏感性、特异性、功能富集分析等聚类评估方法,并且集成了FAG-EC、Dpclus、Monet、IPC-MCE、IPCA等聚类算法,不仅可以对蛋白质网络聚类分析结果进行可视化,并且可以在不同聚类分析指标下对多个聚类算法进行可视化比较与分析。该平台具有良好的扩展性,其中聚类算法以及聚类评估方法都是以插件形式集成到系统中。
武学鸿
费耀平
李敏
关键词:
聚类算法
蛋白质网络
蛋白质相互作用网络分析的图聚类方法研究进展
被引量:1
2012年
随着可获得的大规模蛋白质相互作用数据的迅速增长,从系统水平上对细胞机制的基本组件和结构的理解成为了一种可能。如今所面临的最大挑战是如何通过分析此类复杂的相互作用数据来反映细胞组织、进程以及功能的规律。基于图理论的聚类方法是分析蛋白质相互作用数据的有效手段。本文将从蛋白质相互作用网络(PPI网络)的图模型、聚类算法、评估方法及应用几个方面描述PPI网络聚类分析的最新研究进展。最后,讨论该方向研究所面临的挑战及进一步的研究方向。
李敏
武学鸿
王建新
潘毅
关键词:
系统生物学
蛋白质相互作用网络
蛋白质复合物
蛋白质功能
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