国家自然科学基金(60873184)
- 作品数：12 被引量：32H指数：4
- 相关作者：骆嘉伟陈涛杨华刘红新雷海龙更多>>
- 相关机构：湖南大学福建农林大学河南科技大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金湖南省自然科学基金湖南省科技计划项目更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术医药卫生生物学更多>>
- 基于BW ratio与二进制量子粒子群的基因选择方法
- 2011年
- 信息基因选择在肿瘤识别问题中起着关键作用。本文提出了一种新的组合式的肿瘤信息基因选择方法,首先从单个基因的样本相关性角度出发,采用BW-ratio过滤指标对基因子集进行初选;然后采用二进制量子粒子群算法进一步对信息基因精选,支持向量机(SVM)作为分类器来测试和评估所选出的肿瘤信息基因的分类能力。在二进制量子粒子群算法中,我们给出了一种新的粒子更新的公式。实验是在两个公开的基因表达谱数据集急性白血病(Leukemia)和结肠癌(Colon Tumor)上完成,分别只需5和7个信息基因就能获得了100%和96.77%的10折交叉验证识别准确率。实验结果表明了所提出的信息基因选择方法对于肿瘤的识别问题研究的有效性和可行性。
- 杨华骆嘉伟
- 关键词：基因表达谱支持向量机
- RNA二级结构的2D图形表示及相似性分析
- 2010年
- 结合RNA序列的核苷酸分类提出了一种新的RNA二级结构的2D图形表示法。该图形表示法能够唯一地表示RNA二级结构,而且图形是无退化的,即不存在重叠或交叉现象。把该图形表示法应用于9个病毒RNA二级结构,通过计算这些序列的数字特征和序列之间的相似性,实验表明该图形表示法是可行的。
- 杨卫东骆嘉伟
- 关键词：RNA二级结构
- 基于信息离散度的DNA序列相似性分析被引量：4
- 2009年
- 信息离散性度量方法在生物信息处理领域中获得成功的应用,其基本思想是利用子序列分布差异来表示序列之间的差异,但是子序列长度的变化对结果的影响较大。文中提出了一种新的基于信息离散度的DNA序列相似性分析方法,利用不同距离的碱基对的联合概率分布差异来表示DNA序列之间的差异,并分析了信息集变化对结果的影响。实验结果表明,该方法是分析DNA序列相似性的简单且有效的工具。当信息集变化时,相似度较高的序列间的距离值变化很小。
- 骆嘉伟刘芳杨华
- 关键词：碱基对
- 基于茎区组合的RNA二级结构预测算法被引量：2
- 2010年
- RNA二级结构预测是生物信息学的研究热点和难点,特别是对于含假结的RNA二级结构的预测,已经被证明是NP问题。根据RNA折叠的特点,提出了一种基于茎区组合的智能优化算法来预测RNA的二级结构。该算法以RNA的茎区为基本单元,结合图论思想,通过二元关系的基本理论,依据自由能最小原则获取茎区的最优组合。该算法的时间复杂度为O(n3),空间复杂度为O(n2),而且可以发现假结。实验结果证明了算法的有效性。
- 骆嘉伟陈涛
- 关键词：RNA二级结构茎区
- 基于增强显现模式的癌症分类算法被引量：1
- 2010年
- 针对提取显现模式时在小样本情况下频率近似于概率的缺陷,在衡量分类信息能力熵的计算中引入贝叶斯方法估计概率P(Ci,Sj),提高熵的可靠度,在此基础上提取癌症表达中的增强显现模式,提出2种基于增强显现模式的癌症分类算法。在急性白血病数据集上进行实验,结果表明,该算法能提高癌症检测的正确率。
- 卢新国李丹王海军
- 关键词：癌症分类基因表达模式
- 一种新的RNA二级结构特征序列表示及相似性分析被引量：1
- 2011年
- 针对目前不同的RNA二级结构可能对应相同特征序列的问题,提出了一种新的RNA二级结构特征序列表示法,根据不同的RNA二级结构的子结构类型,分别给出相应的字符表示并由此得到新的特征序列。利用Lempel-Ziv复杂度对两组RNA二级结构进行了相似性分析,实验结果表明了该表示法可以有效地提取RNA二级结构的结构信息,避免了不同RNA二级结构可能对应相同特征序列的问题。
- 梁成骆嘉伟李仁发
- 关键词：RNA二级结构
- 基于YKW图形表达的人类基因短编码序列识别被引量：1
- 2011年
- 针对人类短编码序列的识别问题,根据碱基在密码子三个位置的偏性和碱基自身物理化学性质的分类,提出一种新的图形表示方法——YKW图形,然后在此图形上,提取了9个有效的面积矩阵特征,识别过程中,为了提高识别率利用递增特征选择算法添加4个统计特征,并采用主元分析(PCA)方法对这13个特征降维,最后使用支持向量机(SVM)对人类的短编码序列进行编码区/非编码区识别。实验结果表明,与其他方法相比,该方法使用较少的特征(7个或4个)取得了更好的识别结果。
- 骆嘉伟颜军何海峰
- 关键词：基因序列
- 区域卫生信息化中单点登录系统的设计与实现被引量：3
- 2012年
- 针对区域卫生信息化平台中的多个应用系统的统一认证授权和单一登录,以及基于角色的访问控制模型不能直接应用到单点登录中等问题,提出了一种基于角色组的角色控制策略和JASIG-CAS相结合的统一身份认证系统。中央认证服务(CAS)服务端引用MyBatis技术有效展示了子系统信息,各个应用系统之间采用Axis2来实现用户信息同步,并利用Session存储用户在各个系统中的权限来减少对数据库的频繁访问,从而显著改善了平台的性能。该单点登录系统实现了统一用户管理、统一权限分配、统一平台风格样式等功能。最后,采用专业压力测试工具LoadRunner8.0对平台进行了性能测试和分析,测试结果表明该系统总体性能稳定,平台设计合理。
- 骆嘉伟唐国英
- 关键词：区域卫生信息化单点登录访问控制
- 随机森林方法在致病SNPs检测中的应用被引量：1
- 2012年
- 通过全基因组关联研究发现了大量复杂疾病相关变异,近来关注的焦点又集中在了如何利用单核苷酸多态性数据进行深入分析,期待发现更多复杂疾病的易感基因。随机森林是一种新型的集成分类决策器,可以在对样本分类的同时,计算预测变量的重要性值。该文将随机森林方法应用于全基因组数据,实验结果表明该方法可以作为致病SNPs检测的有效参考方法。
- 姚俊杰骆嘉伟
- 关键词：RANDOMJUNGLE单核苷酸多态性全基因组关联研究
- 融合图像轮廓矩和傅立叶描叙子的手势识别被引量：9
- 2011年
- 针对手势识别中人手是复杂变形体,手部特征描叙容易受到环境因素影响的特点,提出了一种基于混合轮廓特征的手势识别的新方法.首先根据手的颜色信息将手从复杂的背景中分离出来,然后提取出手轮廓的矩不变量和Fourier描叙子特征,然后将2种特征融合构成混合特征,最后将新特征输入BP神经网络进行识别.实验表明:此方法具有较好的鲁棒性和较高的识别率.
- 雷海龙杨胜刘红新
- 关键词：手势识别矩不变量BP神经网络
