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江西省自然科学基金(20114BAB204002)

作品数：1 被引量：2H指数：1
相关作者：张志燕杨斌李杰杨竹青李平华更多>>
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相关领域：农业科学更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇农业科学

主题

  • 1篇情期
  • 1篇全基因
  • 1篇全基因组
  • 1篇全基因组关联...
  • 1篇连锁不平衡分...
  • 1篇母猪
  • 1篇基因
  • 1篇基因组
  • 1篇初情期

机构

  • 1篇江西农业大学

作者

  • 1篇陈从英
  • 1篇李平华
  • 1篇杨竹青
  • 1篇李杰
  • 1篇杨斌
  • 1篇张志燕

传媒

  • 1篇中国农业科学

年份

  • 1篇2012
共 1 条 记 录，以下是 1-1
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排序方式：
母猪初情期全基因组关联分析和位置候选基因研究被引量：2
2012年
【目的】分离影响母猪初情期的主效基因或分子标记。【方法】以白色杜洛克×二花脸资源群体F2代母猪为研究材料,利用Illumina猪60K SNP芯片分别对F0和F1及316头有初情期表型记录的F2代母猪进行基因型判定,通过单标记全基因组关联分析(GWAS)和连锁-连锁不平衡(LDLA)分析检测与母猪初情期显著关联的SNP位点或单倍型。采用标准关联分析、标记辅助关联分析和F值下降检验分析lin-28同源B基因(LIN28B)和跨膜蛋白38B基因(TMEM38B)3个SNP位点与母猪初情期的关联性。【结果】①与母猪初情期关联性最强的SNP为ASGA0032316,位于7号染色体(SSC7)33.07 Mb处RAB23基因内含子中,同时在1、6、12、15和17号染色体也检测到与母猪初情期显著关联的SNP;②达基因组显著水平的单倍型均位于SSC7,其中关联性最强的单倍型位于SSC7的38.39-38.47 Mb处F1RVR7和ZFAND3基因之间的基因间隔区;③LIN28B和TMEM38B基因的3个SNP与母猪初情期均未达到显著相关(P>0.05)。【结论】在白色杜洛克×二花脸资源群体中,与母猪初情期关联性最强的SNP位点和单倍型均定位于7号染色体,1、6、12、15和17号染色体也定位到与母猪初情期显著关联的SNP,LIN28B和TMEM38B基因不是1号染色体QTL区间内的因果基因或需要搜寻更多的SNP进行分析验证。
李平华李杰杨竹青张志燕杨斌陈从英
关键词：全基因组关联分析
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共1页<1>
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