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国家高技术研究发展计划(2012AA10A401)

作品数:11 被引量:31H指数:4
相关作者:孙金生刘逸尘张亦陈刘莉李晨更多>>
相关机构:天津师范大学天津市水生动物疫病预防控制中心中国海洋大学更多>>
发文基金:国家高技术研究发展计划国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
相关领域:农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 11篇中文期刊文章

领域

  • 10篇农业科学
  • 6篇生物学

主题

  • 5篇对虾
  • 4篇凡纳滨对虾
  • 3篇克隆
  • 3篇基因
  • 2篇中华绒螯
  • 2篇中华绒螯蟹
  • 2篇绒螯蟹
  • 1篇信号
  • 1篇信号通路
  • 1篇性基因
  • 1篇许氏平鲉
  • 1篇芽孢
  • 1篇芽孢杆菌
  • 1篇养殖
  • 1篇药性分析
  • 1篇抑菌
  • 1篇抑菌活性
  • 1篇益生菌
  • 1篇扇贝
  • 1篇生物信息

机构

  • 6篇天津师范大学
  • 5篇天津市水生动...
  • 3篇中国海洋大学
  • 1篇中国水产科学...
  • 1篇山东省海洋水...

作者

  • 3篇刘逸尘
  • 3篇孙金生
  • 2篇张亦陈
  • 1篇周晓苏
  • 1篇孙妍
  • 1篇宫磊
  • 1篇于海洋
  • 1篇王旭波
  • 1篇茅云翔
  • 1篇张铃
  • 1篇张全启
  • 1篇王志刚
  • 1篇王艳华
  • 1篇李杰
  • 1篇姜海滨
  • 1篇齐洁
  • 1篇莫照兰
  • 1篇李贵阳
  • 1篇耿绪云
  • 1篇韩晓娟

传媒

  • 6篇水产学报
  • 1篇安徽农业科学
  • 1篇Chines...
  • 1篇中国海洋大学...
  • 1篇Journa...
  • 1篇生物技术世界

年份

  • 3篇2018
  • 3篇2015
  • 1篇2014
  • 3篇2013
  • 1篇2012
11 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
凡纳滨对虾信号转导及转录激活因子(Lv-STAT)基因的克隆及表达特征分析被引量:2
2013年
信号传导及转录激活因子(STAT)是生物体内重要信号通路JAK/STAT的关键组分,在机体免疫、生长、发育等方面起到重要作用。实验从凡纳滨对虾血细胞中克隆获得了STAT基因的全长cDNA序列(Lv-STAT,GenBank accession number:KC779541),其ORF区全长2 373 bp,编码790个氨基酸,预测的分子量为90.68 ku,等电点为5.91。利用SMART在线软件分析表明,该基因编码的蛋白主要结构域由STAT_int、STAT-α、STAT-β和SH2 domain 4部分组成,但不具有信号肽结构。将Lv-STAT与来源于其它物种的STAT进行氨基酸多序列比对后发现,该基因家族中的关键位点在Lv-STAT中同样保守。系统发生分析结果显示,Lv-STAT与斑节对虾、中国明对虾的STAT亲缘关系最近。在组织表达模式分析基础上进一步研究了该基因应答WSSV感染的表达变化特征,发现在感染后早期(0.5、1和3 h),该基因在血细胞中均呈显著上调表达趋势,上述研究表明该基因在一定程度上参与了凡纳滨对虾体内由WSSV引发的先天免疫应答过程。
张铃刘逸尘张亦陈孙妍耿绪云孙金生
关键词:凡纳滨对虾STAT先天免疫
天津市周边地区养殖凡纳滨对虾肠道菌株的分离鉴定及耐药性分析被引量:3
2018年
随着抗生素在水产养殖业中的普遍应用,细菌耐药性成为环境和食品安全的主要问题。本文旨在通过对天津地区养殖凡纳滨对虾体内细菌的耐药信息进行分析统计,为凡纳滨对虾养殖业的疾病控制和提高水产品安全性提供理论指导。本研究对天津市津南区、汉沽区及西青区等对虾养殖基地取样的凡纳滨对虾进行肠道微生物的分离培养,抗生素药敏实验以及抗生素抗性基因的检测。共获得菌株1 219株,选取其中有代表性的215株菌株进行鉴定,结果显示,所鉴定菌株属于56种不同种属,主要以芽孢杆菌、副溶血性弧菌、葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、席罗弧菌、溶藻弧菌、格氏乳球菌、希瓦氏菌、霍氏肠杆菌、库特氏菌、施氏假单胞菌、荚膜红细菌、液化沙雷氏菌、不动杆菌、假单胞菌、假交替单胞菌及霍乱弧菌等为主。所鉴定菌株的抗生素药敏实验分析结果发现,凡纳滨对虾肠道微生物普遍存在抗生素抗性,其中β-内酰胺类的氨苄西林、糖肽类的杆菌肽、喹诺酮类的罗美沙星和磺胺类的磺胺抗药性最为明显。因此本文进一步对其中耐药种类较多且耐药性较强的82株细菌对四大类抗生素(链霉素类、磺胺类、四环素类和青霉素类)的抗性基因(str A-str B,sul II,sul II,sul III,tet A,tet C,tet G,blao XA-1,bla PSE-1,bla TEM)以及整合子(in T1和in T2)携带情况进行检测。研究结果表明,所检测耐药菌株均携带抗性基因,其中磺胺类抗性基因的检出率最高,可达63%,其次是青霉素类抗性基因,检出率为61.4%,整合子基因平均检出率为42.1%,四环素类相对较少为35.4%,且四环素类只检测出tet A抗性基因,其中67.1%的菌株存在多种耐药基因。
左志晗李艳红邵迎春耿绪云董学旺孙金生
关键词:凡纳滨对虾肠道微生物抗性基因
中华绒螯蟹蜕皮激素受体基因(Ers-EcR)的克隆和组织表达分析被引量:4
2014年
蜕皮激素受体(ecdysteroid receptor,EcR)介导调控甲壳动物蜕皮生长、附肢再生等重要生命活动。为了解EcR在人工控制甲壳动物的繁殖和生长中的作用,采用RACE方法结合同源克隆技术,首次从中华绒螯蟹Y-器官中克隆得到蜕皮激素受体基因全长cDNA序列(Ers-EcR,登录号:KF736985),并进行了结构解析和组织表达分析。结果发现,Ers-EcR编码基因全长2 176 bp,开放阅读框为1 638 bp,编码545个氨基酸,具有DNA结合域(DBD)和配体结合域(LBD)等典型的核受体超家族结构域,但不具有信号肽结构。其中,DBD含有8个保守的Cys残基,可以形成2个锌指结构(C156-C159-C173-C176、C192-C198-C208-C211),是典型的DBD特征。多重序列比对分析表明,Ers-EcR氨基酸序列与拳手招潮蟹同源性最高,达到91%。荧光定量PCR结果显示成体中华绒螯蟹ErsEcR基因在Y-器官和肌肉组织中表达量最高,在血液、肠道、卵巢、眼柄、心脏和肝胰腺中有一定表达,在鳃、胸神经节和精巢表达量较低。这表明Ers-EcR基因在中华绒螯蟹各组织器官中的表达不具有典型的特异性,提示Ers-EcR基因可能参与体内多种生命活动的调控。
宫磊张亦陈孙妍刘逸尘耿绪云孙金生
关键词:中华绒螯蟹克隆
中华绒螯蟹高血糖激素基因的克隆和分子结构解析被引量:4
2013年
为深入研究中华绒螯蟹高血糖激素(crustacean hyperglycemic hormone,CHH)基因的结构与功能,首次从中华绒螯蟹眼柄中克隆得到高血糖激素基因的全长cDNA序列(Ers-CHH,GenBank登录号:JX485664)。序列及分子结构分析结果显示:Ers-CHH基因全长585 bp,ORF区为453 bp,编码150个氨基酸,N端30个氨基酸为预测的信号肽区域,其后为42个氨基酸的前体相关肽和78个氨基酸的成熟肽。其成熟肽区具有典型的CHH家族结构域,包括3个二硫键C7-C43、C23-C39、C26-C52和4个α螺旋(alpha-helix),但不具有β折叠结构(beta-sheet)。Ers-CHH成熟肽氨基酸序列与溪蟹相比有92%的相似性;其三维结构与其它物种CHH三维结构比较结果显示,4个α螺旋所处的位置及所含氨基酸的相似性较高。与中华绒螯蟹MIH相比,CHH序列前段缺少一个螺旋,但其4个α螺旋的位置及氨基酸数目与MIH的α2-α5螺旋高度一致,空间结构也基本相同,这可能是两种激素功能部分重叠的分子基础。上述结果为进一步研究CHH在中华绒螯蟹生长发育及能量代谢过程中的调节机制和人工控制甲壳动物生长代谢提供了重要信息。
王艳华张亦陈孙妍刘逸尘耿绪云孙金生
关键词:中华绒螯蟹克隆分子结构
许氏平鲉三种促性腺激素释放激素基因的启动子克隆及生物信息学分析被引量:2
2012年
促性腺激素释放激素(GnRH)是1种在下丘脑-垂体-性腺轴(Hypothalamus-pituitary-gonad,HPG)的活动中发挥关键作用的神经激素。研究采用染色体步移方法,从许氏平鲉的肌肉组织中克隆得到GnRH1、GnRH2和GnRH3共3个基因的启动子序列,长度分别为4,3.5和2.5kb。利用在线生物信息学软件对这3个GnRH基因的启动子进行预测分析,结果表明,3个基因均存在Sp1,Oct-1,C/EBP,CREB,Pit-1,NF-1,Brn,GATA-1,USF和MyoD等转录因子的结合位点,以及糖皮质激素受体(GR),雄激素受体(AR),雌激素受体(ER),黄体酮受体(PR),视黄酸受体(RAR)和视黄醇受体(RXR)等核受体的结合位点,推测其对GnRH的调控起到关键作用。但是甲状腺激素受体(TR)和嗅觉相关的Olf-1的结合位点只在GnRH1和GnRH2基因启动子中发现,而在GnRH3中没有预测出。本研究结果表明许氏平鮋不同类型的GnRH是受不同的机制调控的,从而在生理过程中发挥着不同的作用。
周晓苏王旭波宋华玉王志刚于海洋齐洁姜海滨张全启
关键词:许氏平鲉促性腺激素释放激素启动子生物信息学分析
Changes in Global DNA Methylation Intensity and DNMT1 Transcription During the Aging Process of Scallop Chlamys farreri
2015年
DNA methylation is an important epigenetic regulatory mechanism that influences genomic stability, gene activation, X-chromosome inactivation and other factors. A change in DNA methylation is usually associated with aging and cellular senescence. DNA methyltransferase 1(DNMT1) is the most abundant DNA methyltransferase, and it plays an important role in maintaining the established methylation pattern during DNA replication in vertebrates. Although the effect of aging on DNA methylation has been well studied in vertebrates, little research has been conducted in invertebrates, especially in marine bivalves. In this study, we examined global DNA methylation levels in four groups of adult Zhikong scallop Chlamys farreri at different ages. The results showed that both the age and tissue type had a strong effect on the DNA methylation. In addition, a significant decrease in DNA methylation with aging(1–4 years) can be detected in mantle, kidney and hepatopancreas. We further measured the change in DNMT1 transcript abundance using quantitative reverse transcription PCR(q RT-PCR), which revealed that DNMT1 transcription significantly decreased with aging in mantle and hepatopancreas and strongly correlated with DNA methylation(R = 0.72). Our data provided greater insight into the aging-related decline of DNA methylation, which could aid in gaining a better understanding of the relationship between DNA methylation and the aging process in bivalve mollusks.
LIAN ShanshanHE YanLI XueZHAO BosongHOU RuiHU XiaoliZHANG LinglingBAO Zhenmin
关键词:栉孔扇贝DNA甲基转移酶X染色体失活
一株引起坛紫菜绿斑病病原的分离鉴定及致病性研究被引量:4
2015年
为了明确引起坛紫菜绿斑病的病原,对2012年发生在福建省莆田养殖海区坛紫菜叶状体绿斑病开展了病原的分离鉴定和致病性研究。利用2216E海水培养基平板,从患病藻体分离得到一株优势细菌X5;在实验室条件下将X5进行回接感染实验,在显微镜下观察到坛紫菜叶状体发生组织病理变化,出现绿斑病症状:感染初期出现黄绿色小斑点,病斑逐渐扩大出现空洞,最后导致紫菜叶片流失;用浓度为104~108cfu/m L的X5感染坛紫菜时,在7 d内引起紫菜出现10%~100%病斑面积,这些结果表明X5为坛紫菜绿斑病的病原。利用生理生化和多基因序列分析方法对X5进行鉴定,结果显示该菌为革兰氏阴性菌,大小为0.6μm×0.4μm^1.0μm×0.4μm,无鞭毛,在温度4~42℃、盐度50~150、p H 6~10范围内生长,最适生长温度为16℃,最适生长盐度为50,最适p H为7,对甲硝唑、林可霉素和青霉素耐药,对25种抗生素敏感,Biolog和API ID-32E细菌鉴定系统的结果显示X5为弧菌属细菌(Vibrio sp.);基于多基因序列(16S rRNA,rpo A,recA,pyr H)构建的系统进化树分析显示,X5与V.casei、V.litoralis、V.rumoiensis聚为一支,进化距离为0.095~0.108,这些结果说明X5为弧菌属的一个新种或是V.casei、V.litoralis、V.rumoiensis之一的一个新亚种。本研究报道了弧菌X5能够引起坛紫菜绿斑病,为紫菜流行病学及疾病防治提供了理论支撑。
韩晓娟茅云翔李杰李贵阳李晨刘莉莫照兰
关键词:坛紫菜绿斑病弧菌
凡纳滨对虾肠道益生菌的分离·筛选·鉴定被引量:1
2018年
[目的]获得具有拮抗常见病原菌活性、消化酶活性且具有安全性的凡纳滨对虾肠道内源性益生菌。[方法]从健康凡纳滨对虾肠道中经过初步分离与纯化得到1 220株细菌,对分离的菌株进行拮抗试验,并对产蛋白酶、淀粉酶和脂肪酶能力进行定量和定性研究。对筛选的13株细菌进行了溶血试验和药敏试验,以评价其生物安全性。[结果]共筛选出13株抑菌活性强、产酶能力强且产酶种类多的菌株,最终确定了2株候选益生菌。菌株的16 S rDNA分子鉴定及Biolog系统鉴定结果表明,细菌3号与霍氏肠杆菌(Enterobacter hormaechei strain WW2,JN993998.1)相似性达到98%,细菌6号与乳酸菌(Lactic acid bacterium ZJGS0109,KC748440.1)相似性达100%。[结论]研究结果为今后益生菌制剂的开发和应用奠定了基础。
邵迎春左志晗尚碧娇耿绪云董学旺
关键词:凡纳滨对虾益生菌肠道抑菌活性消化酶活性
高通量测序法分析两株益生菌对凡纳滨对虾肠道菌群结构的影响被引量:8
2018年
为分析荚膜红细菌和蜡样芽孢杆菌2株益生菌对凡纳滨对虾肠道菌群结构的影响,本实验对凡纳滨对虾进行为期30 d的养殖饲喂实验,饲喂后期利用高通量测序凡纳滨对虾肠道微生物的16S rDNA V4区,来分析不同益生菌饲喂后凡纳滨对虾肠道菌群的结构特征,并结合对虾体质量增加率和攻毒后累计死亡率的宏观指标来进行分析。结果显示:(1)空白组(CK)、荚膜红细菌组(Rc)和蜡样芽孢杆菌组(Bc)样品OTU范围为374~506,其中CK组对虾肠道菌群OTU数量最低,饲喂益生菌后的2组对虾肠道菌群中OTU数量相对较高;(2)在门分类水平上,3组的变形菌门数均为最多,CK组主要为变形菌门和少量拟杆菌门,Bc组主要有变形菌门、拟杆菌门、无壁细菌门、厚壁细菌门和假单胞菌,Rc组主要是变形菌门、拟杆菌门、厚壁菌门、酸杆菌门、放线细菌、梭杆菌门和蓝细菌;(3)稀释曲线和Shannon指数结果可见,CK组样品物种丰度和复杂度最低,且Bc组样品丰度和复杂度相对较高;(4)PCA分析发现,Rc组和CK组样品微生物组成较为接近,结合宏观对虾体质量增加率和攻毒后累计死亡率的结果分析,可见相较于荚膜红细菌,蜡样芽孢杆菌对凡纳滨对虾肠道微生物菌群影响更显著,且益生效果更佳。研究表明,饲喂益生菌可以扩增对虾肠道微生物菌群丰度,并能抑制弧菌属等有害菌群的生长,提高对虾体质量增加率并降低死亡率,从而达到益生效果,其中以饲喂蜡样芽孢杆菌菌株效果更佳。
尚碧娇左志晗窦春萌李文悦孙金生
关键词:凡纳滨对虾荚膜红细菌蜡样芽孢杆菌高通量测序
A cadmium metallothionein gene of ridgetail white prawn Exopalaemon carinicauda(Holthuis,1950) and its expression被引量:2
2013年
Metallothioneins(MTs) are a group of low molecular weight cysteine-rich proteins capable of binding heavy metal ions.A cadmium metallothionein(EcMT-Cd) cDNA with a 189 bp open reading frame(ORF) that encoded a 62 amino acid protein was obtained from Exopalaemon carinicauda.Seventeen cysteines were in the deduced amino acid sequence,and the cysteine(Cys)-rich characteristic was revealed in different metallothioneins in other species.In addition,the deduced amino acid sequence did not contain any aromatic amino acid residues,such as tyrosine(Tyr),tryptophan(Trp),and phenylalanine(Phe).EcMTCd mRNA was expressed in all tested tissues(the ovary,muscle,stomach,and hepatopancreas),and its expression profiles in the hepatopancreas were very different when shrimps were exposed to seawater containing either 50μmol/L CuSO4or 2.5μmol/L CdCl2.The expression of EcMT-Cd was significantly up-regulated in shrimp exposed to CuSO4for 12 h and down-regulated in shrimps exposed to CdCl2for 12 h.After 24 h exposure to both metals,its expression was down-regulated.By contrast,at 48 h the EcMT-Cd was up-regulated in test shrimps exposed to CdCl2.The transcript of EcMT-Cd was very low or even absent before the zoea stage,and the expression of EcMT-Cd was detected from mysis larvae-I,then its expression began to rise.In conclusion,a cadmium MT exists in E.carinicauda that is expressed in different tissues and during different developmental stages,and responds to the challenge with heavy metal ions,which provides a clue to understanding the function of cadmium MT.
张继泉王婧相建海
关键词:金属硫蛋白基因脊尾白虾白对虾开放阅读框
共2页<12>
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