艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项(2008ZX10001-004)
- 作品数：6 被引量：21H指数：3
- 相关作者：廖玲洁邢辉钟平赵全壁王允琮更多>>
- 相关机构：中国疾病预防控制中心上海市疾病预防控制中心安徽省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项上海市浦江人才计划项目中国全球基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 中国2007-2009年HIV-1耐药基因型检测质量评估结果被引量：3
- 2012年
- 目的对2007-2009年统一发放至各省,针对艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)蛋白酶和反转录酶基因的耐药突变基因型外部质控品的检测结果,进行分析和检测技术能力评价。方法对3年共5次由各省提交的,应用实验室自建方法(In house)、Viroseq(雅培公司,Abbott)和TruGene(西门子公司,Siemens)检测系统获得的耐药基因型数据进行综合分析。质控盘由6份血浆(HIV-1B及B/C重组毒株)组成,覆盖病毒的蛋白酶和反转录酶基因区的野生型和耐药突变型。每份序列与共享序列比较,使用扣分制对各实验室的结果进行评价。结果除3家核心实验室外,累计有19个省23家省市级疾病预防控制中心(CDC)或医院自愿参加,共提交了95份结果,其中3家实验室使用ViroSeq检测系统;提交了9份结果;1家使用TruGene检测系统;提交了1份结果;其余85份使用in-house检测系统。考核品总的序列阳性率(获得合格序列率)为97.7%,其中的低载量(1 000拷贝/mL)样本均得到阳性结果;根据累计提交的序列结果看,耐药位点判读的完全一致率为78.9%(75/95),序列编辑分析的一致率也有76.8%(73/95)。参加能力验证的省市级实验室由2007年的15家增加到2009年下半年的23家,合格率(001PT)由73.3%上升到(004PT)95.2%,3次以上优秀的实验室有13家。结论目前的检测方法均可成功扩增中国主要亚型流行毒株。所有检测结果在各实验室间的一致性均较高,因此基因型耐药检测技术是可靠的,但各实验室检测能力也存在差异。我国具备耐药基因型检测能力的实验室数量不断增加,检测水平逐年提高。
- 邢辉廖玲洁钟平李敬云尚红康来仪杨娟陈彬全宇赵全璧汪宁邵一鸣
- 关键词：基因型耐药
- HIV耐药对低病毒载量的AIDS病人治疗预后的影响被引量：3
- 2012年
- 目的探索艾滋病病毒(Human immunodeficiency virus,HIV)病毒载量<1 000拷贝/mL的病人的耐药情况,以及耐药对后期治疗效果的影响。方法从安徽、河南等7个地区选取97例病毒载量大于检测限,同时<1 000拷贝/mL的血浆样本,采用实验室自制(in house)方法扩增pol区的蛋白酶和反转录酶基因区,片段长度1.3kb,测得序列并经编辑后,提交至Stanford HIV Drug Resistance Database(http://hivdb.Stanford.edu),分析耐药位点与耐药程度。结果在耐药毒株出现的初期,非核苷类反转录酶抑制剂是主要耐药药物,特别是对其中奈韦拉平(Nevirapine,NVP)的耐药是导致病人耐药的主要因素。在病毒载量>150拷贝/mL<1 000拷贝/mL的病人中,随着治疗时间延长,其耐药位点增加,耐药谱扩大(耐受药物种类与>1 000拷贝/mL的治疗失败病人相似)。结论在条件允许的情况下,应关注病毒反弹早期还处于低病毒载量的病人,其耐药检测结果可以有效预测后期的治疗失败和耐药发生。
- 王允琮邢辉廖玲洁马鹏飞赵全壁崔卫国苏斌阮玉华邵一鸣
- 我国主要HIV-1流行株耐药基因型检测方法的研究被引量：2
- 2012年
- 目的研究针对中国主要HIV-1流行株优化的实验室自建耐药基因型实验室自建检测方法（in—house）的扩增效果及检测敏感度。方法选取中国主要流行亚型的B、CRF07-BC、CRF01-AE亚型各10份样本，这些样本为2007—2009年本实验室采集采自河南、新疆、湖南三地已接受抗病毒治疗患者的样本，并已确定亚型。选用生物梅里埃公司的NuclisensEasyQ方法对选取的30份样本的病毒载量平行进行3次病毒载量检测，取平均值作为载量数值。对每份样本用HIV阴性血浆进行5个浓度的梯度稀释，稀释为〉1000、401～1000、101～400、50～100和〈50拷贝／ml5个浓度梯度。提取核酸后，进行RT—PCR和巢式PCR扩增，对扩增结果进行统计扩增结果，确定每种亚型的扩增效果和最低检测限。随机选取12份样本的初浓度和最低浓度进行测序，对测序结果进行耐药结果分析和序列一致性分析。结果所选样本的病毒载量介于2．03×102～5．92×104拷贝／ml之间。自建的In—house法对载量50—1000拷贝／ml范围的样本仍可达到较高的扩增效果（86％）。样本稀释前后耐药位点相似，序列一致性在97％以上，在低病毒载量时优势病毒株的检测则更敏感。结论自建的实验室方法的灵敏度较高，对低病毒载量水平的样本仍有较高的扩增效果。
- 牛建丽邢辉廖玲洁钟平马鹏飞王允琮赵全壁邵一鸣
- 关键词：抗病毒治疗病毒载量基因型聚合酶链反应
- 艾滋病病毒亚型及其影响被引量：12
- 2011年
- 根据联合国艾滋病规划署（UNAIDS）2010年最新估计[1],2009年全球新近感染艾滋病病毒者约为260万人,有180万人死于艾滋病;目前存活的HIV感染者约有3 330万,已有3 000万人死于艾滋病,尽管全球艾滋病的发病率总体呈现下降趋势,
- 程华钟平
- 关键词：艾滋病病毒流行病学
- 一组分离自男男性行为人群HIV-1毒株的近似全长序列分析
- 2011年
- 目的对5名北京市男男性行为者体内人类免疫缺陷病毒-1(HIV-1)全基因组特征进行全面分析。方法采用淋巴细胞共培养法分离出病毒,并采用RT-PCR法扩增出其近似全长基因组,测序后对其基因序列特征进行深入分析。结果经系统进化和重组分析,分离出的5株病毒分属CRF07_BC、CRF01_AE和B亚型。病毒虽然分属不同亚型,但膜区糖基化位点的数目和分布位置都趋于保守,V3环顶端序列存在GPGR和GWGR两种形式,嗜性预测皆为M嗜性。结论男男性行为人群中HIV-1流行毒株存在CRF01_AE、CRF07_BC和B亚型。本研究获得的全长序列将为研究HIV-1各亚型在男男性行为人群中的传播和进化提供理论依据。
- 王铮庄道民刘思扬陈立力李林刘永健李韩平鲍作义王晓林李天一李敬云
- 关键词：HIV-1男男性行为人群
- 一种HIV-1耐药基因型检测方法的一致性分析被引量：1
- 2011年
- 目的评价一种实验室自建(in-house)HIV-1耐药基因型检测方法的可重复性。方法从2008-2010年已进行HIV-1耐药基因型检测(in-house法)的样品中抽取204份再次进行基因型检测,包括核酸的提取、扩增、测序和序列分析,对两次的耐药结果进行比较。结果 204份样品中,对群体耐药发生的判断上一致性很高,可达98.5%(201/204),在每种抗病毒药物是否发生耐药的判断上[92.2%(188/204)]具有一致性,对每种抗病毒药物的耐药程度判断一致性为81.9%(167/204),84份样品中共有159个位点在两次检测中出现耐药突变位点上不一致的情况,其中不完全一致的位点有149个,蛋白酶区第71位(13/204,6.4%)和逆转录酶区第103位分别出现最多(12/204,5.9%),完全不一致的位点有10个,出现在蛋白酶区第71位,核苷类逆转录酶抑制剂(NRTI)耐药相关突变位点第67、69、70、215、219位,以及与非核苷类逆转录酶抑制剂(NNR-TI)耐药相关突变位点第90、181、221位。结论 in-house方法双重检测对耐药发生及耐药程度的判断上总体具有良好的一致性。但在方法学尤其是混合碱基的判读上需进一步标化以达到更好的可重复性。由于混合碱基的判读会影响耐药突变位点的确定,加强对检测人员的培训,使他们更加严格地执行混合碱基的判断标准和控制序列的质量是非常重要的。
- 周茜廖玲洁陈彬苏俊琪刘宏伟王哲苏斌董永慧陈曦杨绍敏邵一鸣邢辉
- 关键词：人类免疫缺陷病毒1型IN-HOUSE耐药
