湖南省自然科学杰出青年基金(10JJ1005)
- 作品数：14 被引量：40H指数：5
- 相关作者：袁哲明代志军陈渊王志明谭显胜更多>>
- 相关机构：湖南农业大学湖南省作物种质创新与资源利用重点实验室湖南人文科技学院更多>>
- 发文基金：湖南省自然科学杰出青年基金国家教育部博士点基金湖南省高校科技创新团队支持计划更多>>
- 相关领域：生物学理学农业科学自动化与计算机技术更多>>
- 基于支持向量回归的生物测定数据分析被引量：4
- 2010年
- 生物测定是生物学、医学、毒理学的重要内容与基础。常用的定量生物测定数据分析方法时间-剂量-死亡率模型(TDM)不能对复杂生测数据建立统一模型,信息利用不充分。本文基于支持向量回归(SVR),提出了一种能对不同供试因子、不同供试对象和不同环境条件下复杂生测数据统一建模的新方法。14个简单生测数据和2套复杂生测数据的对比分析结果表明,SVR模型拟合与留一法预测精度均优于TDM模型,估计的LD50和LT50等指标更为可信。SVR模型有望作为TDM模型的有益补充,在定量生物测定数据分析中得到广泛应用。
- 王志明谭显胜周玮袁哲明
- 关键词：时间-剂量-死亡率模型支持向量回归生物测定
- 基于均匀设计与支持向量回归的棉铃虫幼虫全纯人工饲料配方优化被引量：6
- 2012年
- 昆虫全纯人工饲料配方是精细研究昆虫营养生理的前提。本研究以棉铃虫Helicoverpa armigera幼虫为供试对象,以本研究室前期发展的多因素多水平配方优化实验设计与分析方法UD-SVR为指导,以略加修改的苹浅褐卷蛾Epiphyas postvittana幼虫全纯人工饲料为初始配方,先优化20种天然氨基酸,再优化蔗糖等其他8种非氨基酸营养组分,经4轮97个处理组合,获得一个棉铃虫幼虫全纯人工饲料满意配方,平均蛹重、化蛹率分别由初始配方的0.160g和10.4%高效增至满意配方的0.255g和97.9%。该全纯人工饲料满意配方的获得,不但再次证实了UD-SVR方法的有效性,同时为进一步深入研究棉铃虫营养需求与营养代谢奠定了基础。
- 周世豪李俊姚润贤张星袁哲明
- 关键词：棉铃虫均匀设计支持向量回归
- 冰核细菌Erwinia ananas 110冰核基因iceA的原核表达及冰核活性分析被引量：1
- 2013年
- 为获得具有高冰核活性的基因工程菌,从冰核细菌Erwinia ananas 110扩增冰核基因iceA,将其克隆到pMD19–T载体上,转化大肠杆菌DH5α,单、双酶切鉴定并测序;阳性克隆目的片段亚克隆到表达载体pET–23a(+)上,转化大肠杆菌DH5α,单、双酶切鉴定重组质粒;阳性重组质粒转化大肠杆菌BL21(DE3)pLysS,并经IPTG诱导表达。SDS–PAGE电泳检测表明,冰核基因iceA能够并以包涵体形式表达,相对分子质量约为180 000。冰核活性测定结果表明,重组菌BL21(DE3)pLysS/pET–ice的冰核活性与野生冰核细菌Erwinia ananas 110在–5、–4、–3、–2℃下无明显差别。
- 姚润贤袁哲明
- 关键词：冰核细菌原核表达
- 混沌时间序列预测模型参数的联合优化被引量：5
- 2011年
- 为了提高混沌时间序列预测模型的预测精度,提出了一种相空间重构和最小二乘支持向量机(LSSVM)参数的联合优化方法.联合优化方法的核心思想是首先采用均匀设计对相空间重构和LSSVM参数进行联合设计,然后采用自调用LSSVM进行参数联合优化,最后利用混沌时间序列对联合优化方法进行验证性测试.实验结果表明,联合优化方法预测精度明显优于其它优化方法,且优化速度更快.
- 向昌盛袁哲明周子英
- 关键词：混沌时间序列相空间重构支持向量机均匀设计
- 改进支持向量分类用于蝶类自动鉴别被引量：3
- 2011年
- 昆虫自动识别是重要的新兴研究领域,其中特征筛选与恰当地将多分类转化为二分类是两个关键步骤。本文基于支持向量分类,提出了一种新的多类昆虫自动鉴别方法:先以初始样本互作转换将多分类转化为二分类,再以可交换核函数消除互作样本中初始样本排列顺序不同的影响,继以非线性筛选去除无关特征与冗余特征并给出各保留特征相对重要性排序,最后以简单投票决策校正独立预测结果。新方法应用于2科7种蝶类自动鉴别,以前翅9个翅脉交叉点距离为初始特征,种、科阶元26、24个随机初始测试样本均获得了100%的准确鉴别。新方法在昆虫自动识别等多分类领域有广泛应用前景。
- 陈渊丰锋袁哲明
- 关键词：支持向量分类蝴蝶自动识别
- 多肽一级结构表征与抗菌肽QSAM建模被引量：5
- 2012年
- 从整体上考虑多肽一级结构,提出了3种仅基于多肽氨基酸序列、计算简便、适于不等长肽和可捕获多肽上下文关联特征的多肽新描述子,即地统计学关联(GS-AA531)描述子、多尺度组分与关联(MSCC)描述子和地统计学关联与多尺度组分(GS-AA531-MSC)描述子.将其应用于2个抗菌肽体系(等长肽与不等长肽)的结构表征,并以支持向量回归建立QSAM模型.模型的拟合、留一法及独立测试结果表明,结合特征筛选的新描述子GS-AA531与GS-AA531-MSC的预测精度明显稳定且优于其它参比描述子,在多肽QSAM研究中具有广泛应用前景.
- 苏满秀王立峰代志军袁哲明柏连阳
- 关键词：抗菌肽支持向量回归
- 基于支持向量机的高维特征非线性快速筛选与肽QSAR建模被引量：9
- 2011年
- 以氨基酸的531个物理化学性质参数直接表征肽的结构,基于支持向量回归发展了一种新的高维特征非线性快速筛选方法,将其应用于苦味二肽和血管紧张素转化酶抑制剂2个肽体系的定量序效关系(QSAR)建模,各筛选获得10个意义明确的保留描述子.以保留描述子建立支持向量回归模型,其拟合精度、留一法交叉测试精度和外部预测精度较文献报道结果均有较大幅度提升,优势明显;对所建模型进行了非线性回归显著性测验、单因子相对重要性显著性测验和单因子效应分析,增强了模型的可解释性.新方法在肽、蛋白质QSAR建模等高维数据回归预测领域有广泛应用前景.
- 代志军周玮袁哲明
- 一种新的氨基酸描述子及其在抗菌肽QSAR中的应用
- 基于氨基酸的531个理化性质(AA531)和地统计学半变异函数,提出了一种新的氨基酸描述子—氨基酸理化性质的地统计学关联特征描述子(GS-AA531)。并以其表征101个CAMEL-s抗菌肽,运用基于支持向量回归(SVR...
- 丰峰苏满秀袁哲明
- 关键词：氨基酸抗菌肽定量构效关系地统计学
- 文献传递
- 基于支持向量回归的棉铃虫蛹发育历期估测
- 2011年
- 温度与发育速率关系模拟是昆虫学研究的一个重要内容,传统基于经验风险最小的非线性参数模型(Logan模型、Lactin模型和王氏模型)存在诸多弊端。本文基于结构风险最小的改进支持向量回归(SVR)研究温度与棉铃虫Helicoverpa armigera蛹发育历期关系。结果表明:与传统非线性模型相比,SVR模型性能优异;基于全部92个样本,SVR模型拟合和留一法预测的决定系数R^2分别为0.998和0.996,估测的蛹期三基点温度更可信。从全部样本中依温度均匀选取部分样本实施独立预测,当训练集为20个样本时,SVR模型独立预测的R^2为0.981,优于传统非线性模型中独立预测最佳的Lactin模型(R^2=0.958);当训练集进一步减少到12个样本时,SVR模型的R^2仅降低到0.964,而传统非线性模型均已不适用。结果提示SVR模型在小样本情况下较传统非线性模型优势明显,在昆虫发育历期估测建模中有应用前景。
- 谭显胜王志明李兰芝袁哲明
- 关键词：棉铃虫支持向量回归蛹期温度发育历期非线性模型
- 支持向量回归应用于新烟碱类杀虫剂QSAR的研究
- 为深入认识新烟碱类杀虫剂活性与其结构的关系,从32种新烟碱类化合物的疏水性参数等24个描述符出发,以基于支持向量回归(sVR)的"多轮末尾淘汰法"对描述符进行汰选,并分析所保留的6个描述符重要性,得出因子重要性排序如下:...
- 向科军李金良袁哲明
- 关键词：新烟碱类杀虫剂定量构效关系支持向量回归
- 文献传递
