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新疆特殊环境微生物重点实验室开放课题(XJYS0203-2009-06)

作品数:2 被引量:10H指数:2
相关作者:胡雯牟文婷张涛徐赢华娄恺更多>>
相关机构:石河子大学新疆农业科学院新疆大学更多>>
发文基金:新疆特殊环境微生物重点实验室开放课题更多>>
相关领域:生物学更多>>

文献类型

  • 2篇中文期刊文章

领域

  • 2篇生物学

主题

  • 1篇多样性
  • 1篇水体
  • 1篇古菌
  • 1篇古菌多样性
  • 1篇RRNA基因
  • 1篇T-RFLP

机构

  • 1篇新疆大学
  • 1篇新疆农业科学...
  • 1篇石河子大学

作者

  • 1篇吴尊凤
  • 1篇张煜星
  • 1篇曾军
  • 1篇邓丽娟
  • 1篇孙建
  • 1篇娄恺
  • 1篇徐赢华
  • 1篇张涛
  • 1篇牟文婷
  • 1篇胡雯

传媒

  • 1篇生态学报
  • 1篇微生物学报

年份

  • 2篇2012
2 条 记 录,以下是 1-2
排序方式:
新疆两典型微咸水湖水体免培养古菌多样性被引量:5
2012年
微咸水湖是湖泊演化过程中的一个重要中间状态,以新疆两典型微咸水湖-赛里木湖和柴窝堡湖水为研究对象,采用微孔滤膜收集菌体,SDS-酚-氯仿抽提法直接提取湖水总DNA,利用古菌16S rRNA基因通用引物进行PCR扩增,分别构建两湖古菌16S rRNA基因克隆文库。用限制性内切酶HaeⅢ对随机挑选的阳性克隆子进行酶切分型,分别得到7个和8个可操作分类单元(Operational Taxonomic Units,OTUs),两文库覆盖率均大于98%。BLAST比对和系统发育分析表明赛里木湖全部克隆子归属于泉古菌门(Crenarchaeota),97%的克隆子与不同环境免培养氨氧化泉古菌有较高的序列相似性(>97%)。柴窝堡湖水古菌归为3个门:Thaumarchaeota(81.2%)、广古菌门(Euryarchaeota)(13%)和泉古菌门(Crenarchaeota)(5.8%),81.2%的克隆子与具有氮代谢功能的氨氧化古菌纯培养物具有较高的序列相似性(97%—98%),13%的克隆子与已分离到的产甲烷古菌序列同源性大于97%。研究发现新疆微咸水湖可能存有大量新划分的古菌Thaumarchaeota门类群、可培养氨氧化及产甲烷古菌类群,两典型微咸水湖泊中古菌类群多样性较低且群落组成差异大。
邓丽娟娄恺曾军徐赢华史应武张煜星
关键词:古菌RRNA基因
新疆特殊生境岩石内生细菌末端限制性片段长度多态性技术分析被引量:5
2012年
【目的】了解新疆特殊生境不同类型岩石内生细菌的组成及多样性。【方法】采用末端限制性片段长度多态性技术(Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism,T-RFLP),分析新疆乌苏花岗岩(1号样)、一号冰川和木垒变质岩(2,3号样)、裕民和托克逊岩石漆(4,5号样)内生细菌群落。【结果】样品间多样性指数变化不大;聚类分析表明岩石类型相同,其相似性较高,2号样和3号样聚为一支并与1号样再聚为一支,4号样与5号样聚为一支;各样品共有种群为厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes),1号样存在酸杆菌门(Acidobacteria),2号样存在浮霉菌门(Planctomycetes);除5号样优势类群为放线菌门(29.3%),其它4个样品均为变形菌门,只是所占比例略有不同。【结论】生境不同的同类型岩石的内生细菌群落组成存在差异,各类岩石中可能存在大量未知细菌新种。
牟文婷张涛孙建曾军徐赢华吴尊凤胡雯娄恺
关键词:T-RFLP多样性
共1页<1>
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