广东省中医药管理局基金(2010430)
- 作品数：1 被引量：4H指数：1
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- 用权重基因共表达网络分析识别心脏重构关键节点基因被引量：4
- 2011年
- 目的采用权重基因共表达网络分析方法(WGCNA)挖掘心肌梗死后心脏重构的关键节点基因,并研究其与ACE1和ACE2的关系。方法从NCBI的GEO下载2个心肌梗死后心脏重构的全基因组表达数据GSE7487和GSE738;数据初处理后,用WGCNA构建基因共表达网络,识别与心脏重构相关的模块与关键节点基因,分析关键节点基因与ACE1和ACE2的关联性;并在心肌梗死后心脏重构大鼠模型中验证它们的关系。结果分析发现在GSE7487,17个模块中有6个模块与心脏重构相关,模块基因富集于16条KEGG信号通路。在GSE738,5个模块与心脏重构相关,模块基因富集于15条KEGG信号通路,其中有10条信号通路与第一组数据结果相同,这些信号通路涉及心肌肥厚病理、氧化磷酸化、代谢等。进一步利用模块内连通性和基因重要性找到了一些心脏重构的关键调控基因,如钙依赖磷酸酶调节子(RCAN1)。RCAN1表达与ACE1表达高度相关,但与ACE2不相关。在动物模型中验证结果与上述结果一致。结论权重基因共表达网络分析方法是一个高效的系统生物学方法,应用本方法发现了心脏重构的关键节点基因,其中RCAN1可能影响ACE1-ACE2在肾素血管紧张素系统中的平衡。
- 钟诗龙伍虹杨敏刘晓颖郑志伟林秋雄符永恒麦丽萍周志凌余细勇
- 关键词：心脏重构血管紧张素转换酶2
- 用权重基因共表达网络分析识别心脏重构关键节点基因
- 目的:心肌梗死后的心脏重构是是发生慢性心力衰竭的主要病理基础,而ACE1和ACE2平衡在慢性心力衰竭的发病机制及其治疗中扮有极其重要作用,然而它们的上游调控机制还不清楚。本课题在采用权重基因共表达网络分析方法(WGCNA...
- 钟诗龙伍虹杨敏刘晓颖郑志伟林秋雄符永恒麦丽萍周志凌余细勇
- 关键词：心脏重构
- 文献传递
