国家科技基础条件平台建设计划(2005DKA21000-5-43)
- 作品数：2 被引量：13H指数：2
- 相关作者：童和林冯素萍陈业渊孙光明武耀廷更多>>
- 相关机构：中国热带农业科学院琼州大学海南大学更多>>
- 发文基金：国家科技基础条件平台建设计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 菠萝基因组SSR分子标记的开发被引量：4
- 2010年
- 实验采用SAM法,以"台农17号"菠萝作为开发基因组SSR分子标记的植物材料,并对开发获得的SSR标记在16个菠萝品种中进行了验证。利用两对锚定引物和12对接头引物筛选菠萝基因组SAM文库,从中开发得到86条含有SSR位点的序列,对这86条序列用MISA软件搜索后得到94个SSR位点,其中单核苷酸重复3个,二核苷酸重复91个。二核苷酸重复仅有2种重复单元,一种是GA/CT,占二核苷酸重复总数的57.14%(52/91),另一种是AC/GT,占二核苷酸重复总数的42.86%(39/91)。研究未发现三核苷酸及以上的重复单元。36对SSR引物对16个材料的扩增结果显示,24对引物能够扩增出清晰、重复性好且符合预期大小的条带,其中13对引物具有多态性,可成为下一步构建菠萝指纹图谱、遗传多样性分析及基因定位等研究中有用的SSR标记。
- 童和林冯素萍陈友陈业渊孙光明武耀廷
- 关键词：菠萝
- 菠萝微卫星指纹图谱的构建被引量：10
- 2011年
- 初步构建了菠萝种质的SSR指纹图谱,为菠萝种质鉴定提供了依据。从菠萝EST-SSR开发的20对微卫星引物扩增31份不同的菠萝种质,筛选出能够稳定扩增且带型差异明显的SSR引物。挑选5对多态性高、分辨率高、重复性好的SSR引物对,作为标准引物对材料进行扩增。每对引物得到的多态性带数8～15个,平均为11条;引物的多态信息含量(PIC)在0.643 7～0.792 8,平均0.737 3。依据带型特征,建立菠萝DNA分子指纹图谱。
- 童和林冯素萍贺军虎王静毅陈业渊孙光明于飞武耀廷
- 关键词：菠萝SSR指纹图谱
