国家自然科学基金(39770037)
- 作品数：2 被引量：27H指数：2
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- XJ-160病毒为辛德毕斯病毒新亚型被引量：14
- 2000年
- XJ 16 0病毒是我国首次分离的辛德毕斯病毒 ,在对其全基因组核苷酸序列测定的基础上 ,对病毒基因组序列、病毒同源性和病毒系统进化等进行了较为详细的分析 ,结果表明 :XJ 16 0病毒具有典型的甲病毒属辛德毕斯病毒的序列特征。该病毒nsp3蛋白基因中有 11处缺失及两处插入 (45 17～ 5 485 ) ,涉及 90个核苷酸。核苷酸序列的系统进化分析表明 ,XJ 16 0病毒属于辛德毕斯病毒欧洲 /非洲亚组。病毒全基因组核苷酸序列进化分析显示 ,XJ 16 0病毒是一株新的甲病毒或辛德毕斯病毒的新亚型。
- 李蕾梁国栋李富胜周国林付士红何海怀金奇侯云德
- 关键词：辛德毕斯病毒甲病毒新亚型
- 我国首次分离的辛德毕斯病毒(XJ-160病毒株)全基因组核苷酸序列测定被引量：18
- 2000年
- 对我国首次分离的辛德毕斯病毒XJ 16 0病毒株全基因组核苷酸序列进行测定 ,阐明该病毒基因组与国外株的差异 ,了解其分子致病机理。测序结果显示 ,XJ 16 0病毒全基因组除 5′末端帽子结构和 3′末端多聚腺苷酸尾外共 116 2 6个核苷酸 ,编码 3731个氨基酸。非结构基因的编码区长 746 4核苷酸 (6 0nt～ 75 2 3nt) ,编码 2 486氨基酸 ,翻译成四种非结构蛋白 (nonstructuralprotein ,nsp1 4)。结构基因长 3738核苷酸 (75 6 8～ 1130 6 ) ,编码 12 45个氨基酸 ,翻译成三种结构蛋白和两个小分子肽 (capsid ,E1- 3、6k)。病毒基因组 5′末端和 3′末端及结构基因和非结构基因之间分别有 5 9个核苷酸、45个核苷酸和 32 3个核苷酸的非编码区。核苷酸序列分析表明 ,XJ 16 0病毒具备典型的甲病毒属辛德毕斯病毒基因组特征 ,与标准辛德毕斯病毒AR339病毒株相比 ,核苷酸序列存在 18%差异 ,氨基酸差异为 8%。这是我国完成的第一株辛德毕斯病毒全基因组序列测定 ,序列已输入国际基因库 (GenBankAF10 372 8)。
- 李蕾梁国栋周国林李富胜付士红何海怀金奇侯云德
- 关键词：甲病毒基因组核苷酸序列
