山西省青年科技研究基金(2013021024-6)
- 作品数：2 被引量：3H指数：1
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- 辣椒疫霉漆酶基因Pclac3克隆表达被引量：1
- 2014年
- 辣椒疫霉是一种侵染性植物病原,能引起多种茄科及葫芦科植物的病害。利用同源克隆法从辣椒疫霉基因组内克隆了漆酶基因Pclac3,该基因全长1 881个核苷酸,编码626个氨基酸,与已知的真菌漆酶基因具有较高的同源性,并且具备漆酶基因的保守区域。利用PCR将该基因克隆于pPIC9K载体,并转化于毕赤酵母GS115,经过1%甲醇诱导表达获得其异源表达产物。将表达产物进行SDS-PAGE检测,获得分子量大约为90 kDa的特异蛋白。利用ABTS法对Pclac3的表达产物粗酶液进行酶活性分析发现,其活性在第11天时最大,达到45 U/mL。这为研究辣椒疫霉漆酶基因家族及探索卵菌漆酶生物活性及其潜在的应用提供了理论依据。
- 冯宝珍李培谦刘丽华
- 关键词：漆酶克隆异源表达辣椒疫霉
- 辣椒疫霉NPP效应子基因家族生物信息学分析被引量：2
- 2014年
- NPP（necrosis—inducingPhytophthoraprotein）是一类效应子，在卵菌疫霉属病原菌中普遍存在，该类蛋白能够激发植物的防御反应，如引起植物细胞死亡、促使寄主防御基因表达及产生乙烯。利用生物信息学方法对辣椒疫霉（Phytophthoracapswi）基因组内的NPP基因家族存在状况进行分析，并对其氨基酸序列组成、基本理化性质、蛋白质三级结构等进行预测分析，旨在了解其结构特征，进而发掘辣椒疫霉的致病相关基因。结果表明：NPP基因家族有25个成员，其中大部分成员存在多个拷贝。对25个NPP氨基酸序列进行分析发现，其分子量在12．45—88．9ku之间；对其中15个NPP蛋白进行三级结构预测发现，它们的三维结构类似，其主要的结构元件为“一螺旋和β-片层；构建了25个NPP蛋白的进化树，进行了分子进化分析。
- 冯宝珍李培谦成娟丽刘缙
- 关键词：辣椒疫霉生物信息学
