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国家自然科学基金(81072988)

作品数:9 被引量:67H指数:7
相关作者:刘春生刘颖陈宏昊许巧仙王学勇更多>>
相关机构:北京中医药大学更多>>
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相关领域:医药卫生生物学农业科学更多>>

文献类型

  • 9篇中文期刊文章

领域

  • 7篇医药卫生
  • 1篇生物学
  • 1篇农业科学

主题

  • 7篇甘草
  • 4篇多态
  • 4篇多态性
  • 4篇基因
  • 4篇HMGR
  • 3篇基因多态性
  • 1篇道地
  • 1篇道地性
  • 1篇序列多态性
  • 1篇选择性剪接
  • 1篇洋参
  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学
  • 1篇酸含量
  • 1篇逆转
  • 1篇逆转录
  • 1篇缺失多态性
  • 1篇人参
  • 1篇转录
  • 1篇鲨烯

机构

  • 8篇北京中医药大...

作者

  • 8篇刘春生
  • 7篇刘颖
  • 5篇陈宏昊
  • 3篇许巧仙
  • 3篇王学勇
  • 2篇席培宇
  • 1篇张宁
  • 1篇詹鑫婕
  • 1篇田程
  • 1篇文浩
  • 1篇刘东吉
  • 1篇张媛

传媒

  • 5篇中国中药杂志
  • 1篇中国实验方剂...
  • 1篇药学学报
  • 1篇中药材
  • 1篇Acta P...

年份

  • 1篇2014
  • 2篇2013
  • 6篇2012
9 条 记 录,以下是 1-9
排序方式:
甘草HMGR,SQS1,β-AS合酶基因CNVs检测体系的建立被引量:7
2012年
目的:建立可用于甘草HMGR,SQS1,β-AS合酶基因CNVs测定的稳定可靠的检测体系。方法:利用Real timePCR方法对甘草HMGR,SQS1,β-AS合酶基因CNVs进行测定。结果:在HMGR,SQS1,β-AS合酶基因以及内标基因lectin的定量检测实验中,其定量反应的Ct值分别在25.82~25.88,29.01~29.08,15.52~15.56,19.06~19.08变化,SD分别是0.033,0.032,0.024,0.011,其CV分别是0.12%,0.22%,0.16%,0.06%。结论:所建立的Real time PCR体系重复性好,检测系统工作稳定可靠,可用于甘草HMGR,SQS1,β-AS基因的CNVs筛选。
刘颖刘东吉刘春生
关键词:甘草HMGRREALTIME
基于β-AS基因的甘草道地性形成机制研究被引量:9
2013年
目的:对甘草道地性形成机制进行探索。方法:在GenBank中检索β-香树酯醇合成酶(β-AS)基因,进行序列比对并找出序列保守区,用primer premier 5.0软件设计引物,对3个不同产地甘草材料的β-AS基因进行扩增、测序,用MegAlign软件进行序列分析并构建系统树。在表达差异实验中,对来自3个产地的9份甘草材料进行总RNA提取,逆转录得到cDNA,以甘草18S基因为内参,PCR扩增后进行相对表达量分析。结果:在序列多态性实验中,9个样品的β-AS序列经比对分析共发现108处变异位点,内含子变异位点数高于外显子变异位点数两倍。在表达差异实验中内蒙组、甘肃组和宁夏组的甘草β-AS基因平均相对表达量有显著性差异。结论:不同产地甘草β-AS基因多态性的差异以及表达量的差异,可能是导致甘草道地性形成的原因之一。
席培宇刘颖陈宏昊刘春生
关键词:甘草序列多态性道地性
Enhancing production of ergosterol in Pichia pastoris GS115 by over-expression of 3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA reductase from Glycyrrhiza uralensis被引量:7
2014年
The rate-limiting enzyme in the mevalonic acid(MVA)pathway which can lead to triterpenoid saponin glycyrrhizic acid(GA)is 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase(HMGR).In order to reveal the effect of copy number variation in the HMGR gene on the MVA pathway,the HMGR gene from Glycyrrhiza uralensis Fisch.(GuHMGR)was cloned and over-expressed in Pichia pastoris GS115.Six recombinant P.pastoris strains containing different copy numbers of the GuHMGR gene were obtained and the content of ergosterol was analyzed by HPLC.The results showed that all the recombinant P.pastoris strains contained more ergosterol than the negative control and the strains with 8 and 44 copies contained significantly more ergosterol than the other strains.However,as the copy number increased,the content of ergosterol showed an increasing–decreasing–increasing pattern.This study provides a rationale for increasing the content of GA through over-expressing the GuHMGR gene in cultivars of G.uralensis.
Ying LiuXiaoqing ZhuWendong LiHao WenYa GaoYong LiuChunsheng Liu
关键词:OVER-EXPRESSION
甘草HMGR基因cDNA的克隆及功能鉴定(英文)被引量:17
2013年
甘草为常用中药材,具有补脾益气、清热解毒、祛痰止咳、缓急止痛和调和诸药等作用。甘草酸是甘草中的主要活性成分,其生物合成途径受到许多酶的调控,其中3-羟基-3-甲基戊二酰CoA还原酶(3-hydroxy-3-methylglutary CoA reductase,HMGR)催化3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A(3-hydroxy-3-methylglutary CoA,HMG-CoA)生成甲羟戊酸(MVA),是该途径中的第一个限速酶。本文克隆了甘草HMGR基因cDNA序列,对其进行序列分析,并与其他物种进行序列比对。构建了原核表达载体,诱导其外源表达及酶促反应,并利用TLC及GC-MS对产物进行检测。结果表明本文克隆得到的HMGR序列能很好的完成特定的酶促反应任务。由于HMGR基因在甘草酸生物合成途径中的重要作用,因此本实验的研究结果对于在分子水平上揭示高品质甘草的形成机制具有一定的意义。
刘颖许巧仙席培宇陈宏昊刘春生
关键词:甘草HMGRCDNAGCMS
基于ITS2条形码SNPs的人参和西洋参PCR-SSCP分子鉴别研究被引量:21
2012年
目的:依据人参和西洋参ITS2条形码的专属性SNP鉴别位点,建立利用PCR-SSCP技术鉴别人参和西洋参的方法。方法:查找GenBank上已收录的人参和西洋参ITS2序列,进行比对分析,筛选人参和西洋参ITS2序列的专属性SNP鉴别位点,据此设计引物,采用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)方法对11个人参样品和10个西洋参样品进行分析,对PCR产物进行测序验证。结果:人参和西洋参样品的PCR-SSCP谱带与各自的对照药材谱带一致,人参和西洋参的PCR-SSCP谱带有显著差异;PCR-SSCP鉴别结果和经测序鉴别结果一致。结论:和测序法相比,PCR-SSCP方法快速、准确,可用于人参和西洋参药材的鉴定。
詹鑫婕田程张媛刘春生
关键词:人参西洋参ITS序列
甘草鲨烯合酶基因多态性对其编码酶催化效率影响的研究被引量:7
2012年
目的:分析甘草鲨烯合酶(squalene synthase,SQS)基因多态性及其对编码酶催化效率的影响,为揭示优质甘草形成的分子机制奠定基础。方法:提取甘草总RNA;PCR扩增其SQS基因编码序列;测序后分析SQS序列的多态性;将具有明显差异的4个甘草SQS序列(SQS1C,SQS1F,SQS2A,SQS2B)连入表达载体pET-32a(+),转化大肠杆菌BL21;IPTG诱导蛋白表达,纯化后用于体外酶促反应;GC-MS鉴定产物并比较相对含量。结果:甘草SQS1基因存在单核苷酸多态性(single nuclearpolymorphisms,SNPs)、插入与缺失多态性(InDel)、选择性剪接(AS)多态性;SQS2基因只存在SNPs。氨基酸序列分析显示,SQS1非保守替换占53.94%,结构域中有2个位点突变;SQS2非保守替换占60%,结构域中有1个位点突变。在4种编码酶的体外酶促反应中,利用GC-MS均能检测到产物生成;SQS1F编码酶积累鲨烯的能力高于其他序列。结论:甘草SQS基因具有丰富的多态性,其编码酶催化效率差异显著,这可能是优质甘草形成的分子基础。
刘颖张宁王学勇刘春生陈宏昊文浩
关键词:甘草基因多态性选择性剪接鲨烯
甘草3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶基因多态性对其编码酶催化效率的影响被引量:6
2012年
目的:利用GC-MS方法分析甘草不同3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)基因型表达蛋白的催化效率,为揭示甘草HMGR多态性在优质甘草药材形成中的作用奠定基础。方法:以从甘草中克隆的4种HMGR基因突变型构建表达载体,转化Escherichia coli BL21,进行诱导表达、检测、纯化及体外酶促反应,采用TLC及GC-MS对反应产物进行定性及定量分析。结果:L/V型突变(-HSL,-HSV)催化活性近似,GA插入型突变(GALLV,GALSV)催化活性近似,但插入型突变的催化活性显著高于前者,是前者的2倍左右。结论:甘草功能基因HMGR基因多态性可能是甘草优质药材形成的分子基础。
刘颖许巧仙王学勇刘春生陈宏昊
关键词:甘草基因多态性MVA
甘草3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶基因多态性与甘草酸含量的相关性分析被引量:7
2012年
目的:揭示甘草3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)基因的多态性,并阐述HMGR基因多态性与甘草酸含量的相关性。方法:以甘草酸含量差异显著的甘草个体为材料,通过RT-PCR法扩增其HMGR基因编码区;与载体pMD19-T连接后克隆测序;通过多重比对进行HMGR基因多态性分析,及与甘草酸含量之间的关联分析。结果:HMGR基因编码区多态性包括整码突变、碱基置换突变、拷贝数多态性及等位基因杂合;HMGR编码氨基酸序列中存在以下4种类型变异,即-HSL,-HSV,GALLV,GALSV,其中-HSV型为甘草中普遍存在类型,-HSL型为甘草酸低含量甘草的特有类型,GALSV型为甘草酸高含量甘草特有类型。结论:甘草HMGR基因编码区具有丰富的多态性,和甘草酸含量之间具有相关性。
刘颖许巧仙王学勇刘春生陈宏昊
关键词:甘草基因多态性逆转录生物信息学
甘草β-AS基因时空表达模式研究被引量:5
2012年
目的:揭示甘草β-AS基因表达的时间特异性及空间特异性。方法:通过PCR扩增获得不同时间、不同部位甘草β-AS基因的cDNA序列,琼脂糖凝胶电泳后用Gel-Pro分析软件对电泳条带进行光密度分析,计算其相对表达量。结果:空间特异性实验显示β-AS基因在甘草的地上部分没有表达,地下组织中,新陈代谢最旺盛的根尖部分表达量高于根茎。时间特异性实验显示甘草β-AS基因在全年中的表达水平可分为4个阶段。12月至2月,β-AS基因表达低于检测水平;3月至5月,β-AS基因开始表达,表达量逐渐上升;5、6及8、9月,β-AS基因表达量保持较高水平;10、11月表达量开始下降。结论:在研究甘草β-AS基因时,应该选取转录水平较高的5、6及8、9月份;选取转录水平较高的根尖作为提取总RNA的部位。
刘颖刘春生
关键词:甘草
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