目的探究整合酶的分子耐药机制。方法研究采用Discovery Studio 2.5软件模块的分子对接程序,构建整合酶药物雷特格韦(Raltegravir,RAL)与整合酶核心区蛋白晶体结构(1BL3)的复合物模型,并结合已知的整合酶耐药突变位点Q148H、N155H、Y143C和其他野生型残基突变(T97A、A128T、E138K、E157Q、G163R),构建一系列整合酶蛋白耐药基因突变体。以此进一步计算艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)整合酶蛋白发生氨基酸残基突变后,与雷特格韦之间分子自由能的改变,并分析雷特格韦与不同整合酶蛋白耐药基因突变体之间的结合自由能。结果主要突变Q148H、N155H、Y143C均位于RAL与整合酶的活性中心,均可明显改变雷特格韦与核心区晶体之间的结合自由能,以N155H改变最为明显,其次为Q148H、Y143C。此外,野生型基因突变也造成一定程度的自由能改变,具有一定的耐药性意义。结论证实耐药位点突变导致整合酶蛋白与雷特格韦之间结合自由能增大,影响药物与整合酶的结合。
目的利用已建立的整合酶晶体结构与整合酶抑制剂雷特格韦的分子对接模型,计算HIV-1整合酶突变蛋白体与雷特格韦之间分子自由能的改变,以此评估整合酶基因突变是否会造成针对雷特格韦的耐药性。方法本研究采用Discovery Studio 2.5软件模块的分子对接程序构建整合酶药物雷特格韦与整合酶核心区蛋白晶体结构(1BL3)的复合物模型,采用氨基酸突变的方式进入整合酶野生型蛋白突变体,计算整合酶蛋白与雷特格韦分子间结合自由能。结果与1BL3整合酶蛋白结构相比,分别携带K14R、V31I、V54I,I72V、I84M,T112V、T124A、T125A、G134N、I135V、K136R、D167E、G193E、V201I、L203I氨基酸突变的整合酶蛋白与雷特格韦之间未见明显分子间结合自由能改变。引入已知耐药基因突变N155H,Q148H,Y143C的整合酶结构可造成彼此间分子自由能的明显提高。结论分子模拟技术建立雷特格韦与整合酶蛋白耐药性预测模型,完成了整合酶野生型蛋白结构与雷特格韦之间结合自由能计算和耐药性分析。我国HIV-1整合酶流行株对雷特格韦敏感,不存在耐药性。
