江苏省自然科学基金(BK2011107)
- 作品数：19 被引量：97H指数：4
- 相关作者：郭锡熔史春梅季晨博陈玲徐广峰更多>>
- 相关机构：南京医科大学南京医科大学附属南京妇幼保健院中国人民解放军更多>>
- 发文基金：江苏省自然科学基金国家自然科学基金南京市科技发展计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 人miR-1908慢病毒载体构建及在人脂肪前体细胞中的表达验证被引量：1
- 2014年
- 目的构建人miR-1908慢病毒表达载体,包被病毒并检测其在人脂肪前体细胞中过表达效果。方法以人脂肪细胞基因组DNA为模板,PCR高保真扩增包含miR-1908区域上下游各100bp左右的基因组DNA,亚克隆入慢病毒表达载体,与包装质粒共转染HEK-293T细胞,包装病毒,收取病毒上清,纯化后感染人脂肪前体细胞,36h开始观察荧光标记,72h收取细胞,抽提RNA,Realtime PCR检测慢病毒感染下miR-1908的相应表达量。结果成功构建人miR-1908慢病毒表达载体,包装获得的病毒感染人脂肪前体细胞的效率可达到70%以上,miR-1908过表达水平可接近2倍。结论本研究成功构建了人miR-1908慢病毒过表达载体,包被的慢病毒可以在人脂肪前体细胞中实现过表达效果,为后续功能研究奠定了基础。
- 杨蕾季晨博史春梅陈玲庞玲霞夏黎郭锡熔倪毓辉
- 关键词：慢病毒
- 肥胖与微生物被引量：1
- 2013年
- 肥胖是遗传、环境等多种因素共同作用的结果，病因复杂，可对儿童健康造成严重影响。一系列研究表明，病毒感染、肠道微生物在人体的共生等因素与肥胖的发生也有关系，探求这些微生物与肥胖问的关系可为儿童肥胖防治打开新思路。
- 张敏史春梅郭锡熔
- 关键词：肥胖病毒感染肠道微生物
- 关于强化补充叶酸的方案与建议被引量：2
- 2012年
- 叶酸是人体不可缺少的营养元素之一,孕期补充叶酸制剂可以有效防治子代神经管畸形等出生缺陷。但在较发达地区存在过度服用叶酸的情况,存在一定的潜在风险。欧美国家实施强化补充叶酸政策有近二十年的历史,已发现叶酸过度补充可导致某些疾病发生风险的增加。为进一步细化叶酸摄入标准及合理应用叶酸提供依据,从而制定更谨慎的公共卫生政策。本文主要就叶酸过度补充与疾病发生的关系研究进行综述。
- 季晨博郭锡熔
- 关键词：孕期疾病公共卫生政策
- miR-26b慢病毒载体构建及其在人前体脂肪细胞中的表达验证被引量：1
- 2014年
- 目的构建人miR-26b慢病毒表达载体,并检测其在人前体脂肪细胞中过表达效果。方法以人脂肪细胞基因组DNA为模板,PCR扩增包含miR-26b所在区域上下游100bp左右的基因组DNA,克隆慢病毒表达载体,进一步包装成慢病毒并感染人脂肪细胞,荧光定量PCR检测miR-26b表达。结果成功构建miR-26b慢病毒载体,病毒感染效率为75%左右,miR-26b过表达效率达2倍以上。结论成功构建了miR-26b慢病毒表达载体,可用于研究miR-26b在人脂肪细胞中的分子机制。
- 徐广峰赵亚萍史春梅陈玲杨蕾宋桂仙宋雷雷赵超季晨博郭锡熔
- 关键词：慢病毒载体前体脂肪细胞
- 脂肪细胞分化相关miRNA-hsa-miR-378生物信息学分析被引量：3
- 2012年
- 【目的】利用各种生物信息学工具分析hsa-miR-378转录调控、靶基因功能,以期为研究hsa-miR-378在人脂肪细胞分化过程中的功能与调控机制提供线索。【方法】应用UCSC Genome Browser、Promoter scan等在线工具,分析hsa-miR-378在基因组上下游10kb以内的CpG岛分布情况、转录起始位置(TSS)、转录因子结合位置(TFBS)等;选择TargetScan、PicTar、MiRanda三种计算方法预测hsa-miR-378的靶基因,取三个预测结果的交集,并合并DIANA LAB-TarBase 6.0数据库的已验证靶标,对所得靶基因集分别进行GO注释描述、GO富集分析和pathway富集分析。【结果】hsa-miR-378可能具有独立的启动子,可能受C/EBPβ转录因子的调控;其预测靶基因集合富集于转录调控、蛋白质修饰、细胞分化等生物学过程和功能(P<0.01);并显著富集于TGF-β信号通路、Wnt信号通路等4个信号通路,以及甲状腺癌、系统性红斑狼疮等8个疾病通路中(P<0.05)。【结论】通过对hsa-miR-378转录调控元件、靶基因的分析,为hsa-miR-378在人脂肪细胞中的功能与调控机制研究提供了线索和理论依据。
- 徐露莲史春梅陈玲季晨博郭锡熔徐美玉
- 关键词：MICRORNA生物信息学脂肪细胞分化
- miR-26b过表达对不同时间点人脂肪细胞分泌脂因子的影响被引量：2
- 2013年
- 目的探讨miR-26b过表达在人脂肪细胞分化过程中对各种脂因子分泌的影响。方法以miR-26b过表达病毒感染人脂肪前体细胞并诱导分化;收集不同时间点的细胞培养基上清,采用酶联免疫吸附法(ELISA)检测各个时间点的脂因子(白介素-6、瘦素、抵抗素、肿瘤坏死因子-α)分泌量。结果与对照组比较,在miR-26b过表达病毒感染的人脂肪前体细胞分化过程中,白介素-6、瘦素分泌量降低,而抵抗素分泌量升高;两组均未检测到肿瘤坏死因子-α。结论 miR-26b在一定程度上可以改善人脂肪细胞炎症状态及改善胰岛素抵抗,为肥胖治疗提供潜在靶点。
- 史春梅徐广峰季晨博陈玲杨蕾庞玲霞赵亚萍郭锡熔
- 关键词：肥胖
- 生物信息学预测hsa-miR-26b的作用靶标及功能被引量：3
- 2012年
- 目的通过生物信息学预测hsa-miR-26b的靶基因,进一步分析其潜在功能,为其后续功能研究提供理论依据。方法用pubmed、谷歌(google)等工具检索hsa-miR-26b相关文献;用miRbase、NCBI、UCSC Browser和Promoter scan等在线工具分析hsa-miR-26b序列及所在基因组特征;用TargetScan、PicTar及miRanda预测hsa-miR-26b的靶基因;通过功能富集分析(GOanalysis)和信号转导通路富集分析(Pathway analysis),预测所得靶基因和已证实的靶标基因。结果研究证实hsa-miR-26b与神经发育、心肌肥大及各种肿瘤发生、发展有关;hsa-miR-26b位于CTDSP1基因内含子内,但可能具有与该基因不同的启动子;3种方法预测结果取交集获得可能靶标基因33个,合并已知靶标基因14个;hsa-miR-26b靶基因主要参与钠离子转运、溶酶体组织和生物形成、抑制细胞增殖、转运等生物学过程,涉及Notch、氨基糖类代谢、ABC转运子、VEGF及TGF-β等信号转导通路。结论 hsa-miR-26b的功能较为广泛,与发育、代谢等密切相关。
- 徐广峰付海龙史春梅季晨博赵亚萍郭锡熔
- 关键词：微小RNA生物信息学靶基因
- hsa-miR-26b表达沉默对脂肪细胞蛋白分泌的影响被引量：2
- 2014年
- 目的探讨hsa-miR-26b表达沉默对脂肪细胞蛋白分泌的影响。方法将hsa-miR-26b表达沉默组及对照组慢病毒感染人脂肪前体细胞,在诱导分化过程中收集不同时间点的细胞培养基上清液,采用ELISA法检测IL-6和瘦素(leptin)的分泌量。结果在细胞分化过程中,hsa-miR-26b表达沉默组IL-6与leptin表达量均较对照组降低(P<0.01或P<0.05)。结论降低hsa-miR-26b表达在一定程度上可以改善人脂肪细胞炎症状态及胰岛素抵抗,为肥胖治疗提供潜在靶点。
- 杨蕾徐广峰季晨博史春梅陈玲庞玲霞赵亚萍郭锡熔
- 关键词：脂肪细胞肥胖
- 生物信息学分析miRNA-152在非酒精性脂肪肝病中的可能作用被引量：1
- 2012年
- 【目的】总结miR-152已有研究结果,并预测其可能参与的生物学过程,为本研究小组深入研究miR-152在非酒精性脂肪肝病(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)形成和相关的调控机制奠定基础。【方法】PubMed检索miR-152相关文献,生物信息学预测miR-152的靶基因,并对其进行功能富集分析和信号通路富集分析。【结果】miR-152已在多个类型肿瘤、先兆子痫等疾病中有报道,但尚无参与脂肪肝的研究,分析结果显示miR-152靶基因功能集中于器官发育、细胞分化、代谢等多种分子功能和生物学过程;信号通路主要富集于多种肿瘤和细胞骨架蛋白、脂肪细胞因子、胰岛素信号及wnt信号通路中。【结论】miR-152在非酒精性脂肪肝病中尚未见报道,其预测的靶基因集合富集于多个生物学过程,为研究miR-152在非酒精性脂肪肝病中的作用提供了研究思路。
- 冯跃英林胡史春梅季晨博郭锡熔傅君芬
- 关键词：MIRNA生物信息学分析非酒精性脂肪肝病
- hsa-miR-17-92 cluster及其同源体靶基因的生物信息学分析被引量：1
- 2013年
- 目的对hsa-miR-17-92duster及其同源体进行系统的生物信息学分析，预测其可能参与的生物学过程，为深入研究其在脂肪细胞分化、肥胖发生等过程中的功能与机制奠定基础。方法1．应用PubMed、Google等信息搜索工具查找hsa-miR-17-92cluster及其同源体的所有研究，综述已有研究进展；2．应用miRBase获取hsa-miR-17-92cluster及其同源体的各成员序列，并分析其序列特征及保守性；3．应用美国国家生物技术信息中心（NCBI）blast、NCBImapviewer、基因组生物信息学（UCSC）Browser工具分析hsa-miR-17-92 cluster及其同源体所在基因组的序列特征；4．应用TargetScan5．1，PicTar及miRanda预测hsa-miR-17-92cluster及其同源体靶基因，取三者预测结果的交集，进一步进行功能注释和Pathway富集分析。结果1．现有研究提示hsa-miR-17-92 cluster及其同源体在脂肪细胞分化、肿瘤疾病、心脏及肺发育、免疫系统与血管形成等生物学过程中有重要作用；2．hsa-miR-17-92 cluster及其同源体进化上高度保守，根据种子序列同源性可分为4类，且在多物种问非常保守；3．hsa．miR-17-92 cluster及其同源体预测靶基因的功能与细胞周期、细胞黏附、Wnt、TGF-β信号、p53、丝裂原活化蛋白激酶等信号通路有较大的相关性，可能参与了前列腺癌、胰腺癌、结肠癌等多种疾病通路。结论通过对hsa-miR-17-92 cluster及其同源体系统的生物信息学分析，初步阐明了hsa-miR一17-92 cluster及其同源体的基本生物学特征，并为hsa-miR-17-92 cluster后续研究提供了功能与机制的线索。
- 史春梅徐广峰陈玲赵亚萍倪毓辉杨蕾季晨博郭锡熔
- 关键词：CLUSTER生物信息学脂肪细胞
