广东省自然科学基金(10451063201005247)
- 作品数：7 被引量：2H指数：1
- 相关作者：孙雪松王南杰王红翠阳小燕李慧更多>>
- 相关机构：暨南大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 孵育时间在二氧化钛选择性富集磷酸化肽中的影响
- 2012年
- 目的:旨在探索孵育时间在二氧化钛选择性富集磷酸化肽中的影响。方法:以大肠杆菌BL21(DE3)为材料,预实验确定二氧化钛磁珠与肽段之间的最适比例,之后在此比例下继续探究不同孵育时间条件下的富集效果,以观察孵育时间在二氧化钛富集体系中的影响。结果:预实验确定磁珠与肽段之间最适比例为3∶1,在此比例下发现随着孵育时间的增加其富集效率会逐渐降低,最后确定大肠杆菌中最适孵育时间为5min。结论:孵育时间在大肠杆菌二氧化钛富集体系中对富集效果有明显的影响,并且呈负相关。推测不同样品的最佳孵育时间与样品种属有关。
- 詹胜银兴峰李慧李楠阳小燕孙雪松
- 关键词：二氧化钛磷酸化孵育时间大肠杆菌
- 应用差异蛋白质组学的方法分析左氧氟沙星对肺炎链球菌D39的作用被引量：1
- 2011年
- 应用差异蛋白质组学的方法,对肺炎链球菌D39在左氧氟沙星作用下蛋白质表达水平的变化进行了研究,利用质谱技术共鉴定到23个差异蛋白质。这些蛋白质主要参与DNA的复制、转录以及蛋白质的翻译过程,为深入了解抗生素的作用机理以及细菌的耐药机制提供重要理论基础。
- 孙正华阳小燕贺翔孙雪松
- 关键词：差异蛋白质组学肺炎链球菌左氧氟沙星
- 肺炎链球菌去信号肽脂蛋白PsaA锌离子结合特性的初步表征
- 2011年
- 肺炎链球菌是细菌性肺炎的主要病原体。PsaA是各种肺炎链球菌共有的遗传保守的特异性表面金属结合脂蛋白。通过PCR扩增肺炎链球菌D39不含信号肽的PsaA基因片段,将其通过T4连接酶连接至含6His标签的表达载体PBAD/HisA中,转化表达宿主大肠杆菌Top-10后用L(+)-阿拉伯糖诱导重组蛋白的表达。重组蛋白经亲和镍柱纯化以后,用外切酶-重组肠激酶(REK)去除6His标签。感应偶合电浆质谱(ICP-MS)测得纯化的PsaA蛋白以1∶1比例结合金属锌离子。进而,通过圆二色谱法分析金属离子的结合对蛋白二级结构中α-螺旋和β-片层含量的影响,荧光光谱研究蛋白结合锌离子的解离常数及结合当量,为进一步研究该蛋白在体外的金属结合特性及细菌的金属运输及毒力机制提供理论基础。
- 李楠王南杰王红翠李慧詹胜阳小燕孙雪松
- 关键词：肺炎链球菌PSAAICP-MS
- 化脓链球菌中铁结合蛋白MtsA二级结构的研究被引量：1
- 2012年
- 化脓性链球菌是一种革兰氏阳性人类致病菌,其生长和感染离不开铁离子。MtsA是化脓链球菌中直接结合铁离子的一个脂蛋白。通过PCR扩增化脓性链球菌MGAS5005中的MtsA基因,构建高效表达质粒pGEX-MtsA,将其转化到大肠杆菌BL21中并用IPTG进行诱导表达。利用亲和层析方法纯化表达产物。通过多序列比对分析了MtsA铁结合中心的保守性,利用定点突变技术将MtsA的结合配体单位点及多位点进行突变,结合圆二色谱分析这些氨基酸突变后蛋白二级结构的变化。多序列比对结果表明MtsA结合铁离子的氨基酸位点是保守的,4个关键氨基酸位点处于蛋白空间的凹陷处。通过比较空载及饱和铁离子的野生型蛋白以及突变体蛋白的圆二色吸收光谱,发现野生型MtsA结合铁离子后结构更加紧密,H68A,E206A和D281A则比野生型的二级结构松散,而H140A的二级结构和野生型的几乎没有差别。对MtsA 4个结合配体突变后其二级结构变化的研究,为进一步研究细菌中的铁转运机理及开发疫苗候选药物和药靶奠定了一定的理论依据。
- 王红翠张静徐倩许丽娜王南杰孙雪松
- 关键词：多序列比对
- 应用蛋白质组学的方法分析缺铁培养对化脓性链球菌MGAS5005的影响被引量：1
- 2012年
- 【目的】研究铁缺失对化脓性链球菌的影响,并寻找摄铁系统中的关键蛋白。【方法】以化脓链球菌为模型,利用含Fe和不含Fe的培养基对细菌进行培养,收集全细胞蛋白进行双向电泳,定量软件分析电泳图谱,质谱鉴定差异蛋白,进而通过生物信息学分析蛋白上下游关系,从中找到关键蛋白。【结果】鉴定出20个差异蛋白,并用Cytoscape软件对差异蛋白相互关系网络进行节点分析找到其中5个瓶颈分子。【结论】在培养基中的Fe3+缺乏时,细菌的生物合成和含氮化合物、生物大分子等重要代谢受到很大影响,这为进一步阐明细菌铁代谢机制奠定了基础。
- 吕洁余光创孙正华王南杰朱颖王红翠孙雪松
- 关键词：化脓性链球菌金属蛋白铁蛋白质组学
- 化脓性链球菌脂蛋白FtsB的基因克隆、表达、纯化与功能研究被引量：1
- 2011年
- 体外克隆化脓性链球菌5005的ftsb基因,表达并纯化FtsB蛋白,并对其铁色素结合特性进行初步研究。首先通过PCR方法从基因组中扩增ftsb基因,将其连接到pGEX4T-1载体上,转入大肠杆菌DH5α中大量扩增,将测序正确的重组载体转化到表达宿主大肠杆菌BL21进行表达,优化诱导表达条件。利用亲和层析方法纯化表达产物,并对FtsB的铁色素结合特性进行研究,同时通过DEPC封闭组氨酸实验对其结合位点进行初步研究。成功构建原核表达载体pGEX-ftsb,获得分子量约33 kD的野生型FtsB蛋白,产率为30 mg/L。紫外-可见光谱研究表明FtsB和铁色素结合后在450 nm处出现紫外吸收峰,DEPC封闭组氨酸实验证明FtsB中组氨酸不参与铁色素的结合。对FtsB蛋白进行铁色素结合特性和结合位点进行研究,为进一步研究细菌中的铁色素转运机理及开发疫苗候选物和药靶奠定一定的理论基础。
- 李慧吕洁王红翠王南杰李楠詹胜阳小燕孙雪松
- 关键词：化脓性链球菌
- 化脓链球菌中野生型和突变体FtsB蛋白的铁色素结合特性
- 2015年
- 目的:进一步比较化脓链球菌中野生型和Y137A、W204A突变型FtsB蛋白的铁色素结合特性,确定铁色素结合位点。方法:制备野生型和Y137A、W204A突变型FtsB蛋白,采用ICP-MS和ITC比较其铁色素结合能力;Na2SO4还原实验比较铁色素的还原速率;CD热变性和盐酸胍化学变性实验比较其铁色素结合稳定性。结果:Y137A、W204A突变型FtsB蛋白的铁色素结合能力和结合稳定性均低于野生型蛋白,铁色素的还原速率均高于野生型蛋白,可见Tyr137和Trp204是FtsB蛋白重要的铁色素结合位点。结论:进一步确定了Tyr137和Trp204氨基酸残基在FtsB与铁色素结合中的重要作用,为深入研究细菌中的铁色素转运机理及开发疫苗候选物奠定了一定的理论基础。
- 李慧薛巍孙雪松
