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中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2009YD02)
作品数:
2
被引量:18
H指数:2
相关作者:
柳明
喻达辉
黄桂菊
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相关机构:
上海海洋大学
中国水产科学研究院南海水产研究所
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发文基金:
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中央级公益性科研院所基本科研业务费专项
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相关领域:
农业科学
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基因克隆
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基因组
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基因组序列
1篇
Α-淀粉
机构
4篇
中国水产科学...
4篇
上海海洋大学
作者
4篇
黄桂菊
2篇
喻达辉
2篇
柳明
1篇
潘俐玲
1篇
王晓宁
传媒
1篇
海洋科学
1篇
南方水产科学
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3篇
2011
1篇
2010
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中国海南三亚大珠母贝不同年代种群的遗传变异研究
被引量:7
2011年
利用10个多态微卫星标记对中国海南三亚海域大珠母贝(Pinctada maxima)3个不同年代(2007、2009和2010)群体的遗传变异进行了分析,每个群体30个样品。10个位点共扩增出60个等位基因,平均每个位点6(2—8)个,3个群体分别丢失了1、2和4个稀有等位基因。平均期望杂合度(Hc)、平均多态信息含量(PIC)、平均Shannon多样性指数均呈下降趋势。各群体均存在一定程度的杂合子缺失。30个数据中(3个种群×10个位点)有18个偏离了Hardy—Weinberg平衡。两两群体间的平均近交系数(FIS)介于0.2273~0.2601之间,平均遗传分化指数(FST)介于0.0204~0.0462,遗传分化显著(P〈0.01)。结果表明,3个年代群体遗传多样性水平已经出现了逐渐降低的趋势,遗传结构存在显著差异,近交程度增加,因此,人工繁育工作中应注意避免近亲繁殖和遗传多样性的降低。
柳明
喻达辉
黄桂菊
卢传亮
关键词:
大珠母贝
微卫星
大珠母贝prismalin-14基因与基因组序列克隆及SNP位点分析
<正>prismalin-14是调控贝类棱柱层形成的重要基因之一,对于贝壳棱柱层的沉积速度有着重要的影响。本研究利用大珠母贝为材料通过聚合酶链式反应(PCR)扩增得到大珠母贝prismalin.14的cDNA序列(Gen...
王晓宁
黄桂菊
潘俐玲
成书营
喻达辉
关键词:
大珠母贝
基因组序列
文献传递
大珠母贝微卫星DNA标记的分离与筛选
被引量:11
2010年
采用生物素标记的(CA)15探针和磁珠富集法构建了大珠母贝(Pinctada maxima)微卫星DNA文库,随机挑选1200个菌落,经PCR筛选得到298个候选克隆,成功测序246个,分析获得251个微卫星序列,其中完美型、非完美型和混合型分别占63%、32%和5%。除探针中使用的CA重复外,还得到AT、GT、TC、AG、GC、TAA、CAA、AGG、GATA、GACA、GTGC、CGTC、GACG、CTGT等重复序列。设计引物90对,挑选其中30对合成并筛选出21对能在大珠母贝基因组有效扩增的引物。种群PCR扩增后利用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳法进行检测,获得了10个多态位点,共检测出59个等位基因,片段长度范围为133~444bp。各位点等位基因数2~8个,平均等位基因数5.9个;有效等位基因数为1.3423-6.0000,平均为4.1240;多态性信息含量(CPI)为0.2225-0.8118,平均0.7179;期望杂合度(Hc)为0.2593-0.8475,平均0.7179;观测杂合度(H0)为0.3000-0.8000,平均0.5333。这些微卫星多态性标记的获得,为进一步开展大珠母贝遗传育种、保护生物学和种群遗传多样性等研究奠定了一定基础。
柳明
喻达辉
黄桂菊
关键词:
磁珠富集法
微卫星
大珠母贝(Pinctada maxima)α-淀粉酶基因克隆及其内含子分析
α-淀粉酶广泛分布于动物、植物和微生物中,是贝类软体动物主要的消化酶,对贝类生长有重要影响。本文首次获得大珠母贝α-淀粉酶基因(命名为pmAMY,GenBank注册号:HtM989014),其cDNA全长1,732 bp...
潘俐玲
黄桂菊
成书营
王晓宁
喻达辉
关键词:
大珠母贝
Α-淀粉酶基因
外显子
内含子
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