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杂种优势的进化意义探析——以适合度对随机交配群体遗传多样性的贡献为依据被引量：3: 2009年; 从群体遗传的角度将杂种优势与近交衰退的定义进行类比,认为杂种优势应该用适合度来综合衡量。建立数学模型,推导出随机交配群体3种基因型RR、Rr、rr在不同适合度下的平衡状态,揭示杂种优势是群体中复等位基因存在的先决条件。发现杂种优势通过提高杂合个体的适合度,避免淘汰不同类型的基因,从而保护群体的遗传多样性,使群体具有较强的自我调节和进化潜力;让个体意义上的适应与群体层次的适应协调一致,深化了达尔文的个体选择思想。; 李大林陈奇林建国蔡润; 关键词：适合度杂种优势平衡状态进化

VIGS:植物功能基因组学研究的革命被引量：12: 2009年; 病毒诱导基因沉默(virus induced gene silencing,VIGS)技术是一种RNA介导的抗病毒防御反应机制,目前在植物反向遗传学领域已经表现出巨大的潜力。VIGS技术不仅优于传统的植物转基因技术,方法简便,高效耐用,而且具有高通量特性。在功能基因组学领域的研究中,这些优越性已经使VIGS技术成为最具吸引力的首选技术手段。目前,VIGS体系应用最成功的植物是病毒学家常用的模式植物-本氏烟草(Nicotiana benthamiana),与此同时,也在努力改良VIGS技术,使其能够在包括单子叶植物在内的其它物种中得到广泛应用。我们讨论的重点是针对利用VIGS技术来确定基因功能,该技术已经在抗病性,逆境胁迫,细胞信号传导以及次生代谢生物合成途径研究中显示出相关基因功能的多样性,并随之构建出一系列新的相关模型。; 姚丹青张微微原丽华潘俊松何欢乐蔡润; 关键词：VIGS 病毒载体基因沉默功能基因组学

多性状群体信息熵混杂递增链与混杂指数的应用: 2008年; 从信息熵的角度出发,推导出反映群体混杂程度的递增链,论证信息熵描述群体混杂程度的可行性。提出混杂指数的概念,发现混杂指数比多个性状的标准差更便于描述群体的混杂程度,并用实例验证混杂指数的可操作性。; 李大林陈一帆蔡润; 关键词：信息熵

杂种优势的进化意义探析——以适合度对随机交配群体遗传多样性的贡献为依据(英文)被引量：1: 2009年; 学术界是从生产的角度出发理解杂种优势的，认为杂种优势就是指杂种F．代个体性状表现优于纯合基因型的情形。这实际上只是看到了杂种优势的现象，进一步分析会发现，杂种优势性状的共同点是有利于自然选择，即提高杂合子的适合度，这才是其本质。也即杂合子在穗长、穗粗、健壮等方面的优势只是适合度在性状上的表现，适合度才是基因型在自然选择中显示其生存优势的指标。该研究模型基于这一界定，使其可用数学表述，并以之为逻辑起点，; 李大林陈奇林建国蔡润; 关键词：杂种优势群体遗传多样性适合度随机交配进化性状表现

随机交配群体隐性致死纯合基因型出现的平方Logistic模型(英文): 2008年; From the random mating population of maize, the relationship between heterosis and albino seedling was analyzed by means of mathematical theory, further the square logistic model for the appearance of lethal recessive homozygous genotype was deduced. The model shows that heterosis can determine the genetic structure and proportion of population. It approves, that the proportion of aa in each generation of maize seedlings shows a similar Logistic curve in growth process till equilibrium, so long as Aa containins lethal gene a from mutation presents heterosis. The ratio of equilibrium state of aa is determined by the ratio of AA-Aa fitness. Heterosis is helpful for the keeping of genetic diversity of population.; 韦文惠王子平林建国蔡润李大林; 关键词：FITNESS RECESSIVE LETHAL HETEROSIS MATING EQUILIBRIUM

随机交配群体隐性致死纯合基因型出现的平方Logistic模型被引量：13: 2008年; 从玉米的随机交配特点出发,借助数学理论分析杂种优势和白化苗之间的关系,推导出隐性纯合致死基因型出现的平方Logistic模型。该模型显示,杂种优势能确定群体的遗传结构及比例;认为突变产生的致死基因a,只要Aa存在杂种优势,aa在各代玉米苗期的比例呈现一个类似Logistic曲线的增长过程,直至平衡。aa在平衡状态的比例由AA与Aa的适合度之比决定。杂种优势能使群体的遗传多样性得以长久保持。; 韦文惠王子平林建国蔡润李大林; 关键词：适合度杂种优势随机交配

黄瓜(Cucumis sativus L.)BAC文库的构建及连锁群特异克隆的分离被引量：3: 2008年; 利用中国华北类型的黄瓜自交系S94构建一个BAC文库,该文库包含约19200个克隆,平均插入片段为105kb,大约覆盖黄瓜基因组的5倍.为了使黄瓜的遗传连锁群锚定其染色体,从黄瓜的7个连锁群共选择了22个标记,其中15个SCAR标记和7个SSR标记.利用这些标记用PCR的方法筛选BAC文库的DNA池,15个标记筛选到至少2个克隆,共筛选到60个BAC克隆,最后确定了22个BAC克隆作为连锁群特异克隆,这个BAC文库的构建为今后黄瓜基因组研究奠定了基础.; 关媛陈琪潘俊松李征何欢乐吴爱忠宋任涛蔡润; 关键词：黄瓜细菌人工染色体文库

黄瓜异戊烯基转移酶基因的克隆及序列分析被引量：2: 2010年; 根据GenBank拟南芥ATIPTs基因序列设计特异性引物,采用PCR方法从黄瓜S94基因组DNA中克隆出异戊烯基转移酶基因保守区片段;再通过对黄瓜基因组BAC文库的筛选,获得基因的全长序列,命名为cs-ipt,GenBank登录号HQ326777。经序列测定及分析表明,该基因编码序列全长1 005 bp,编码334个氨基酸,氨基酸序列中包含有ATP/GTP结合位点GATGTGKS。同源比对表明该基因的核苷酸序列和推导的氨基酸序列与其他植物的ipt基因都有较高的同源性,其中与杨树的同源性最高为65%。; 张微微潘俊松刘淳中何欢乐蔡润; 关键词：黄瓜 IPT PCR BAC

基于自交率的基因型信息熵变规律与自花传粉机制的进化意义被引量：12: 2008年; 用离散线性系统研究多对独立杂合基因在兼有自花与异花传粉群体中的基因型信息熵逐代演变规律,推导出极限平衡状态基因型信息熵是自交率的凸函数,当a=0.5时其值最大。在趋向极限平衡进程中,基因型信息熵曲线当a>0.5时先升后降,当a≤0.5时单调上升,当a→0+时以Hardy-Weinberg平衡熵为极限。在某一世代,群体基因型信息熵与独立杂合基因对数成正比。发现群体中存在一定比例的自交,能提高变异程度,甚至超过随机交配群体的变异,认为这是自花传粉机制的进化意义。; 李大林陈奇; 关键词：信息熵自交离散线性系统

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国家自然科学基金(30671111)