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辽宁省教育厅高等学校科学研究项目(2008643)

作品数:3 被引量:13H指数:2
相关作者:李喜升刘彦群王欢李玉萍夏润玺更多>>
相关机构:辽宁省蚕业科学研究所沈阳农业大学西南大学更多>>
发文基金:辽宁省教育厅高等学校科学研究项目国家现代农业产业技术体系建设项目公益性行业(农业)科研专项更多>>
相关领域:生物学农业科学更多>>

文献类型

  • 3篇中文期刊文章

领域

  • 2篇生物学
  • 2篇农业科学

主题

  • 2篇柞蚕
  • 1篇蛋白结构
  • 1篇序列标签
  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学
  • 1篇生物信息学分...
  • 1篇全长
  • 1篇柞蚕蛹
  • 1篇樗蚕
  • 1篇系统进化
  • 1篇系统进化分析
  • 1篇进化
  • 1篇进化分析
  • 1篇克隆与序列分...
  • 1篇氨基酸
  • 1篇氨基酸序列
  • 1篇蓖麻蚕
  • 1篇CDNA文库
  • 1篇CDNA序列
  • 1篇COI基因

机构

  • 3篇沈阳农业大学
  • 3篇辽宁省蚕业科...
  • 1篇西南大学

作者

  • 3篇夏润玺
  • 3篇李玉萍
  • 3篇王欢
  • 3篇刘彦群
  • 3篇李喜升
  • 2篇秦利
  • 2篇姜德富
  • 2篇武松
  • 1篇王振东
  • 1篇鲁成
  • 1篇石生林

传媒

  • 3篇蚕业科学

年份

  • 3篇2009
3 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
柞蚕蛹全长cDNA文库的构建和随机EST测序被引量:6
2009年
采用RNA转录5′末端转换(SMART)技术构建了柞蚕(Antheraea pernyi)蛹的全长cDNA文库。所构建cDNA文库的容量为5×10^5个独立克隆,插入片段长800-2500 bp,且90%的插入片段大于1 kb。随机挑取288个克隆进行表达序列标签(EST)测序,有效序列为250条,根据EST测序结果计算文库重组率达95%。经序列拼接得到175个unigenes,通过序列比对发现其中97个unigenes与GenBank中的已知基因高度同源,且有88条全长序列,基因的完整性比率达90%。在随机EST测序中获得了具有5′端和3′端非编码区的延伸因子-1α基因(Gen-Bank登录号:FJ788508),该基因cDNA全长1743 bp,有一个1392 bp的开放阅读框,编码含463个氨基酸残基的蛋白,蛋白的理论分子质量为50.4 kD,等电点8.96。EST测序分析表明,柞蚕蛹cDNA文库符合构建基因文库的质量要求,该文库的构建将有助于柞蚕功能基因的克隆和研究。
夏润玺李玉萍王欢李喜升刘彦群秦利姜德富鲁成
关键词:柞蚕CDNA文库表达序列标签
樗蚕和蓖麻蚕的DNA条形编码与系统进化分析被引量:6
2009年
樗蚕(Philosamia cynthia cynthia)与蓖麻蚕(Philosamia cynthia ricini)均是鳞翅目大蚕蛾科吐丝营茧的昆虫,二者的血缘关系很近,成虫的外形也极其相似。为了获得用于樗蚕与蓖麻蚕分子鉴定的DNA条形编码,测定了二者的线粒体细胞色素酶C亚基I基因(COI)574 bp的DNA片段序列(GenBank登录号:FJ788507,FJ772004),对序列特征及与同科其它绢丝昆虫同源序列的系统进化关系进行了分析。在大蚕蛾科绢丝昆虫中,樗蚕与蓖麻蚕COI序列表现出最强的碱基T偏好性(ATskew=-0.194),二者的COI序列之间具有明显差异,共鉴定出25个变异位点,表明所测定COI序列可以作为各自的DNA条形编码。樗蚕与蓖麻蚕之间基于Kimura-2-Parameter的遗传距离为0.041,而与同科其它绢丝昆虫之间的遗传距离则在0.076~0.159之间,二者与惜古比天蚕(Hyalophora ce-cropia)之间的亲缘关系较近。
武松李玉萍夏润玺王欢石生林李喜升王振东刘彦群
关键词:樗蚕蓖麻蚕COI基因系统进化
柞蚕腺苷酸转移酶基因的克隆与序列分析被引量:2
2009年
腺苷酸转移酶(adenine nucleotide translocase,ANT)是线粒体内膜上的转运蛋白家族成员。从柞蚕(An-theraea pernyi)蛹全长cDNA文库中获得了柞蚕腺苷酸转移酶基因(ApANT)的cDNA序列(GenBank登录号FJ788509)。对该基因进行生物信息学分析表明:ApANTcDNA全长1 282 bp,含有1个903 bp的开放阅读框(ORF)序列,编码300个氨基酸;ApANT与烟草天蛾(Manduca sexta)等鳞翅目昆虫的ANT基因在核苷酸和氨基酸序列水平分别具有80%和90%以上的同源性,说明ANT蛋白在这些昆虫中是高度保守的;与其它已知鳞翅目昆虫的ANT蛋白一样,ApANT蛋白含有3个线粒体穿膜结构域,并且这3个保守结构域之间也显示出较高的相似性。
李玉萍王欢武松夏润玺刘彦群秦利李喜升姜德富
关键词:柞蚕生物信息学分析CDNA序列氨基酸序列蛋白结构
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