河北省自然科学基金(C2012204009)
- 作品数：5 被引量：0H指数：0
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- 不同物种干细胞因子基因编码区生物信息学分析
- 2014年
- 为了解不同物种干细胞因子(stem cell factor,SCF)基因编码区(CDS)的遗传变异,本研究采用生物信息学方法比较分析了山羊、绵羊、牛、白犀、野猪、虎鲸、马、雪貂、人、鼩鼱、裸鼢鼠、褐家鼠、长尾毛丝鼠、小家鼠和智利八齿鼠SCF基因编码区的遗传多样性,并对该基因的氨基酸序列、跨膜结构域、导肽、信号肽和二级结构特征进行了预测和分析。结果发现,在15个物种55条基因序列中共检测到294个多态位点,生成36种单倍型,SCF基因序列编码区在物种间存在丰富的遗传多样性;理论等电点分布广泛,多数肽链呈酸性,亲水;N端具信号肽、无导肽,可溶型蛋白无跨膜结构域,跨膜型蛋白有1个长23个氨基酸的跨膜结构域;这些蛋白二级结构主要为α-螺旋、无序卷曲、伸展链及β-转角。
- 锡建中周荣艳张军杰李祥龙李兰会李楠张振红
- 关键词：物种生物信息学分析
- c-KIT在不同毛色山羊皮肤中的表达
- 2016年
- 为了研究c-KIT在不同毛色山羊皮肤组织中的表达与定位并探索c-KIT在毛色形成中的作用机制,以黑山羊、白山羊为研究对象,利用实时定量PCR技术分析其相对表达量,并采用免疫组织化学技术进行c-KIT表达定位分析。结果表明,在山羊皮肤组织中,c-KIT主要分布在皮肤上皮部、汗腺、皮脂腺、毛囊漏斗部以及内外根鞘。c-KIT在黑山羊、白山羊毛色皮肤组织中表达部位、表达水平无显著差异,表明c-KIT的表达量、表达部位不是造成黑山羊、白山羊色差异的主要因素。
- 魏彦辉周荣艳张军杰李祥龙锡建中李兰会陈辉张振红
- 关键词：C-KIT山羊免疫组织化学皮肤毛色
- 不同类型山羊干细胞因子(SCF)结构及抗原表位预测
- 2014年
- 为了探讨不同类型山羊干细胞因子的结构特征和抗原表位分布,研究利用生物信息学软件和在线程序对山羊皮肤组织中可能存在的不同类型山羊干细胞因子氨基酸序列的二级结构、跨膜区域、亲水性、柔韧性、抗原指数及表面可及性特征进行预测,并针对共有区段建立结构模型。结果表明:在各型SCF蛋白潜在的抗原表位中,KSSKSPEPR为各型蛋白共有表位;KDSRVSVT为分泌型SCF蛋白及其前体共有表位,SSSSNRKAS为分泌型SCF蛋白前体特有表位;KGKASNSIED为跨膜型SCF蛋白特有表位;KGKTYKHS为分泌型SCF蛋白前体特有表位;KKKQPNL为分泌型SCF蛋白前体和跨膜型SCF蛋白的共有表位。
- 张军杰周荣艳锡建中李兰会李祥龙张振红李楠
- 关键词：山羊干细胞因子分泌型跨膜型抗原表位
- 山羊可溶型干细胞因子mRNA在不同毛色皮肤组织中的表达水平
- 2014年
- 为探讨可溶性干细胞因子(stem cell factor,SCF)基因表达水平与山羊毛色间的相关性,本试验利用实时荧光定量PCR(QRT-PCR)技术研究了SCF基因mRNA在黑色和白色山羊皮肤中的表达量,并对结果进行统计分析。经内参基因校正后,黑色山羊皮肤中可溶型SCF的相对表达量是白色山羊相对表达量的0.27倍(P>0.05)。可溶型SCF mRNA表达量可能与山羊毛色表型不存在相关性。
- 张军杰周荣艳锡建中李祥龙李兰会
- 关键词：干细胞因子可溶型山羊毛色皮肤
- 山羊皮肤组织SCF基因的克隆与序列分析
- 2014年
- 对山羊SCF基因的结构与序列进行了分析,参考山羊和绵羊SCF基因序列设计引物,利用PCR克隆获得了山羊SCF基因的两个剪接体序列,同时对其进行了生物信息学分析。结果表明,山羊SCF基因分泌型和跨膜型编码区长度分别为825 bp和741 bp,长度差异主要是由外显子6缺失/插入引起的,与绵羊和牛的同源性分别为98%和97%。13个物种的SCF基因的系统发育聚类与动物分类学基本一致。
- 张军杰锡建中周荣艳李祥龙李兰会陈辉张振红赵驻军
- 关键词：山羊分泌型跨膜型
