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分子系统学的理论、方法及展望被引量：19: 2005年; 随着分子生物学理论的不断完善和技术的发展,系统生物学的一个分支学科———分子系统学也在不断地发展,并已成为进化生物学、古生物学、生态学等众多学科的一个极其重要的研究手段,并在诸多研究领域中取得了许多令人瞩目的成果.然而,相对于一些传统学科而言,它毕竟还是一门年轻的学科,在许多理论和方法的运用上还存在着一些问题.本文尝试对这门学科涉及到的一些问题作一系统评述,以期有助于更好地了解它,并利用它有效地开展相关研究工作.; 王莹赵华斌郝家胜; 关键词：分子系统学分子系统树进化分子钟

苔藓动物的谱系发生位置与早期分歧时间(英文)被引量：2: 2010年; 苔藓动物是后生动物系统进化研究中的关键类群之一。作者基于冠轮动物38个代表种类的LSU和SSU rRNA组合基因序列数据,以二胚层动物为外类群,运用最大简约法、最大似然法和贝叶斯分析法,重建了触手冠担轮动物的系统树;同时,基于分子钟的方法推测了苔藓动物主要类群的起源与分歧时间。分子系统学的分析结果表明:触手冠动物并非都是单种系群;而苔藓动物则为单种系群,并构成触手冠担轮动物的基部类群。尽管苔藓动物的最早化石记录仅发现于奥陶纪特马豆克期地层中,谱系年代分析结果显示:苔藓动物及其主要谱系在新元古代已经分化;其中,苔藓动物祖先类群的起源时间约为634Ma,基部类群(被唇纲)与其它苔藓动物的分歧时间大约为607Ma。这一结果说明,化石记录始于奥陶纪的苔藓动物根植于新元古代的埃迪卡拉纪,早期祖先类群可能缺乏钙化骨骼,因而不易保存为化石。从而支持关于动物主要门类起源于新元古代的谱系年代学研究成果。; 郝家胜孙晓燕石庆会杨群; 关键词：苔藓动物分子古生物学 LSU RRNA SSU RRNA

“寒武纪爆发”事件及其成因述评被引量：2: 2003年; 主要后生动物门类化石在寒武纪初期的突然出现记录了生命史中一个从未有过的快速演化时期,这一事件被称为"寒武纪爆发(Cambrianexplosion)".多年来有关"寒武纪爆发"成因的各种猜测从未间断过.但是,将古生物化石记录看成是生物进化过程中种系形成的真实过程已遭到许多研究者的非议,这主要取决于以下二方面的证据:一是对早期后生动物系统发生关系的重新评估;二是来自于分子系统学和分子钟的研究.现在看来,"寒武纪爆发"事件的产生,一方面归因于化石体积的明显增加及其伴随的骨骼化过程,另一方面可能是其时的进化革新事件所导致.; 郝家胜; 关键词：后生动物古生物化石分子系统学分子钟

基于18S rRNA基因序列分析唇口目苔藓动物主要类群的系统发生关系: 2009年; 对隶属于3亚目、5次目、20科、23属共25个种类的唇口目(裸唇纲)苔藓虫18SrRNA基因部分序列进行了序列测定。结合从GenBank中获得的该类群其它7个种类的18SrRNA基因同源序列,以序列分析软件对其序列组成和变异进行了比较分析;同时,以羽苔虫(被唇纲)和管孔苔虫(窄唇纲)为外类群,以邻接法和最大简约法重建了它们的系统发生树,分析了该目主要类群系统发生关系。序列分析结果显示:经比对后序列长度为884bp,其中保守位点241个,可变位点643个,简约信息位点357个;A,T,C和G4碱基平均含量分别为23.8%、22.8%、24.4%和28.9%。分子系统树表明:本研究所有有囊类构成1个单系群,其中胞次目的几种苔虫位于皮壳次目内部;无囊类形成1个多系群,其中的亚目级(新唇口亚目)和次目级分类阶元(枝室次目、假软壁次目和隐壁次目)也都为多系发生,这些结果与前人的分子系统学研究结果大体一致,而与传统的形态分类体系间存在明显的冲突。; 焦晓霞杨群赵华斌石庆会郝家胜; 关键词：苔藓动物唇口目 RRNA基因

苔藓动物主要类群28SrDNA多变区的分子形态分析及其系统学意义被引量：5: 2006年; 测定了苔藓动物主要代表类群3种苔虫的28S rDNA全序列（3 459～3 613 bp）,结合已公布的相关类群的28S rDNA全序列数据,分析了其一级结构特征,并分别绘制了D2、D3和D8区段的二级结构.比较分析结果显示：各类群的全序列总长均超过3 300 bp,GC含量为41.8%～57.7%;D3和D8区段的二级结构保守性较高,D2区差异显著;各区段的长度变化较大,但是,大多都具有相似的主干结构.基于二级结构多变区分子形态学特征的比较基本和基于一级结构的分子系统学结论相吻合,提示它们同样包含着重要的系统发育信息.; 赵华斌杨群郝家胜; 关键词：苔藓动物 RDNA

唇口目苔藓动物分子系统演化及其主要类群分歧时间的推测被引量：1: 2005年; 对40种唇口目苔藓动物(包括新测的24种)线粒体16SrRNA基因序列进行了比较分析,运用邻接法和最大简约法构建了系统发生树;同时基于适宜的谱系发生关系和确证的化石记录资料,计算了唇口目苔藓动物16SrRNA基因的演化速率,并据此推测了唇口目2大主要类群(无囊类和狭义有囊类)的起源和分歧时间.结果显示,唇口目高级分类单元(超科及以上分类阶元)的系统发生大都和现今形态分类体系间存在明显的分歧;据估算,现生无囊类和狭义有囊类苔藓动物在约263Ma(中二叠纪,瓜德鲁普世)和183Ma(早侏罗纪)之前就已分化出来.; 郝家胜李春香孙晓燕杨群; 关键词：苔藓动物分歧时间唇口目类群线粒体16S 最大简约法

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国家自然科学基金(40202001)