艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项(2012ZX10001-002)
- 作品数：9 被引量：36H指数：4
- 相关作者：邢辉廖玲洁阮玉华王允琮赵全壁更多>>
- 相关机构：中国疾病预防控制中心安徽省疾病预防控制中心河南省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 2010-2013年新疆HIV亚型和耐药传播研究被引量：11
- 2015年
- 目的 通过对新疆艾滋病病毒（HIV）感染者的病毒基因序列分析,了解2010-2013年新疆HIV亚型和耐药传播情况。方法 采集当年新报告的16~25岁未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者的血浆样本,提取病毒核糖核酸（RNA）,通过扩增HIV-1 pol区片段,进行测序和耐药基因变异分析。结果 4年共获得pol区序列150条,主要以CRF07_BC为主（96.7%,145/150）,共有3例出现耐药,分别针对非核苷类抑制剂（NNRTIs）和核苷类抑制剂（NRTIs）。耐药株主要出现在性传播人群中。结论 各传播途径中仍主要流行CRF07_BC,新疆HIV-1耐药传播目前处于低度传播水平,但仍需进一步加强对感染者的耐药监测和病人的治疗管理。
- 董永慧王莉何翠佐合拉·吐尔地王凤英廖玲洁关晓霞刘伟赵杰邢辉
- 关键词：艾滋病病毒基因序列耐药毒株
- 应用二代测序技术研究HIV准种进化的相关进展被引量：2
- 2015年
- 近十年二代测序技术快速发展,与一代测序技术相比具有通量高、速度快、灵敏度高、准确率高等优点,主要以454焦磷酸测序、Illumina测序、Ion Torrent测序和SOLiD测序为代表。二代测序技术在HIV领域的研究已经越来越广泛,本文介绍了上述四种二代测序技术在HIV准种进化方面的应用。
- 张晶邢辉
- 关键词：HIV准种
- 中国2007-2009年HIV-1耐药基因型检测质量评估结果被引量：3
- 2012年
- 目的对2007-2009年统一发放至各省,针对艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)蛋白酶和反转录酶基因的耐药突变基因型外部质控品的检测结果,进行分析和检测技术能力评价。方法对3年共5次由各省提交的,应用实验室自建方法(In house)、Viroseq(雅培公司,Abbott)和TruGene(西门子公司,Siemens)检测系统获得的耐药基因型数据进行综合分析。质控盘由6份血浆(HIV-1B及B/C重组毒株)组成,覆盖病毒的蛋白酶和反转录酶基因区的野生型和耐药突变型。每份序列与共享序列比较,使用扣分制对各实验室的结果进行评价。结果除3家核心实验室外,累计有19个省23家省市级疾病预防控制中心(CDC)或医院自愿参加,共提交了95份结果,其中3家实验室使用ViroSeq检测系统;提交了9份结果;1家使用TruGene检测系统;提交了1份结果;其余85份使用in-house检测系统。考核品总的序列阳性率(获得合格序列率)为97.7%,其中的低载量(1 000拷贝/mL)样本均得到阳性结果;根据累计提交的序列结果看,耐药位点判读的完全一致率为78.9%(75/95),序列编辑分析的一致率也有76.8%(73/95)。参加能力验证的省市级实验室由2007年的15家增加到2009年下半年的23家,合格率(001PT)由73.3%上升到(004PT)95.2%,3次以上优秀的实验室有13家。结论目前的检测方法均可成功扩增中国主要亚型流行毒株。所有检测结果在各实验室间的一致性均较高,因此基因型耐药检测技术是可靠的,但各实验室检测能力也存在差异。我国具备耐药基因型检测能力的实验室数量不断增加,检测水平逐年提高。
- 邢辉廖玲洁钟平李敬云尚红康来仪杨娟陈彬全宇赵全璧汪宁邵一鸣
- 关键词：基因型耐药
- HIV耐药对低病毒载量的AIDS病人治疗预后的影响被引量：3
- 2012年
- 目的探索艾滋病病毒(Human immunodeficiency virus,HIV)病毒载量<1 000拷贝/mL的病人的耐药情况,以及耐药对后期治疗效果的影响。方法从安徽、河南等7个地区选取97例病毒载量大于检测限,同时<1 000拷贝/mL的血浆样本,采用实验室自制(in house)方法扩增pol区的蛋白酶和反转录酶基因区,片段长度1.3kb,测得序列并经编辑后,提交至Stanford HIV Drug Resistance Database(http://hivdb.Stanford.edu),分析耐药位点与耐药程度。结果在耐药毒株出现的初期,非核苷类反转录酶抑制剂是主要耐药药物,特别是对其中奈韦拉平(Nevirapine,NVP)的耐药是导致病人耐药的主要因素。在病毒载量>150拷贝/mL<1 000拷贝/mL的病人中,随着治疗时间延长,其耐药位点增加,耐药谱扩大(耐受药物种类与>1 000拷贝/mL的治疗失败病人相似)。结论在条件允许的情况下,应关注病毒反弹早期还处于低病毒载量的病人,其耐药检测结果可以有效预测后期的治疗失败和耐药发生。
- 王允琮邢辉廖玲洁马鹏飞赵全壁崔卫国苏斌阮玉华邵一鸣
- 我国主要HIV-1流行株耐药基因型检测方法的研究被引量：2
- 2012年
- 目的研究针对中国主要HIV-1流行株优化的实验室自建耐药基因型实验室自建检测方法（in—house）的扩增效果及检测敏感度。方法选取中国主要流行亚型的B、CRF07-BC、CRF01-AE亚型各10份样本，这些样本为2007—2009年本实验室采集采自河南、新疆、湖南三地已接受抗病毒治疗患者的样本，并已确定亚型。选用生物梅里埃公司的NuclisensEasyQ方法对选取的30份样本的病毒载量平行进行3次病毒载量检测，取平均值作为载量数值。对每份样本用HIV阴性血浆进行5个浓度的梯度稀释，稀释为〉1000、401～1000、101～400、50～100和〈50拷贝／ml5个浓度梯度。提取核酸后，进行RT—PCR和巢式PCR扩增，对扩增结果进行统计扩增结果，确定每种亚型的扩增效果和最低检测限。随机选取12份样本的初浓度和最低浓度进行测序，对测序结果进行耐药结果分析和序列一致性分析。结果所选样本的病毒载量介于2．03×102～5．92×104拷贝／ml之间。自建的In—house法对载量50—1000拷贝／ml范围的样本仍可达到较高的扩增效果（86％）。样本稀释前后耐药位点相似，序列一致性在97％以上，在低病毒载量时优势病毒株的检测则更敏感。结论自建的实验室方法的灵敏度较高，对低病毒载量水平的样本仍有较高的扩增效果。
- 牛建丽邢辉廖玲洁钟平马鹏飞王允琮赵全壁邵一鸣
- 关键词：抗病毒治疗病毒载量基因型聚合酶链反应
- 长期ART的AIDS病人更换二线药物的效果及耐药情况被引量：7
- 2013年
- 目的分析接受一线抗病毒治疗(ART)时间较长的艾滋病(AIDS)病人,更换二线药物后的治疗效果及相关耐药位点的变化。方法在河南和安徽采用随访观察的方法,比较更换二线药物前和换药10个月左右,AIDS病人病毒及免疫学指标的变化情况。结果共调查68名AIDS病人,更换抗病毒药物前治疗时间中位数为77个月。病毒载量(VL)≥1 000拷贝/mL组,在换药后病毒抑制率为79.1%(34/43),换药前后的耐药率分别为76.7%和9.3%(P<0.05);CD+4T淋巴细胞中位数分别为186个/μL和320个/μL(P<0.05)。耐药组换药后的耐药率为11.4%(4/35),换药后病毒抑制率由换药前的5.7%上升到82.9%(P<0.05);换药前后CD+4T淋巴细胞中位数分别为187个/μL和325个/μL(P<0.05)。换药前常见的耐药位点包括K103N、Y181C、TAMs、M184V和69位插入复合体,而换药后的蛋白酶抑制剂(PIs)突变位点为M46I。结论对于长期接受一线ART且病毒载量≥1 000拷贝/mL或耐药的病人,更换二线药物后可取得较好的临床效果;而对于病毒载量<1 000拷贝/mL或非耐药的病人,如何换药仍需进一步研究。
- 王晶刘佳吴建军廖玲洁崔为国王允琮苏斌赵全璧王霞阮玉华邵一鸣邢辉
- 关键词：艾滋病病毒耐药突变
- 抗HIV-1药物的研发特点及进展
- 2016年
- 目前高效抗逆转录病毒联合疗法在HIV的治疗中取得了很好的疗效,在国内外得到广泛应用。目前已有6类30余种抗逆转录病毒药物应用于抗病毒治疗,主要包括核苷类逆转录酶抑制剂、非核苷类逆转录酶抑制剂、蛋白酶抑制剂、整合酶抑制剂、膜融合抑制剂和CCR5辅助受体拮抗剂,分别作用于HIV复制的不同环节。此外,还有许多其他新型药物正处于研发和临床试验阶段。
- 常帅庄道民李林刘思扬李韩平刘永健鲍作义李敬云刘杰
- 关键词：HIV抗逆转录病毒药物耐药性
- 一种国产HIV核酸定量试剂与进口试剂的对比研究被引量：4
- 2017年
- 目的对比研究国产1型艾滋病病毒(HIV-1)核酸定量试剂与两个进口试剂的相关性和差异,以期应用国产核酸定量试剂评价中国抗病毒治疗患者病毒学效果的可行性。方法应用美国国家卫生研究院病毒学质量评价项目(VQA)发放的HIV-1核糖核酸(RNA)血清样品,比较一种国产核酸定量试剂与国内市场常规使用的两个进口试剂,在测定病毒载量上的相关性和一致性。对国产和进口核酸定量试剂检测HIV-1病毒载量的结果进行配对t检验,线性回归分析和Bland-Altman分析。结果国产试剂和两个进口试剂的检测结果的线性相关系数R2分别为0.94、0.93(P<0.000 1);Bland-Altman分析三种试剂病毒载量的结果具有较高的一致性,国产试剂定量值与VQA病毒载量值线性相关系数R2=0.97,P<0.000 1,定量单位转换系数为1IU/mL=0.79拷贝/mL。结论国产HIV-1核酸定量试剂与进口试剂在定量检测结果上有较好的相关性和一致性,而且国产试剂在价格上具有优势,在一定范围内可以应用于抗病毒治疗效果的评价。
- 赵全壁赵志超宋畅许巍廖玲洁邢辉邵一鸣
- 关键词：病毒载量一致性
- 广西柳州16～25岁HIV-1感染者中流行毒株亚型及耐药分析被引量：6
- 2015年
- 目的通过对广西壮族自治区柳州市,2011-2013年艾滋病病毒Ⅰ型（HIV-1）新近感染者毒株基因特征的研究,了解当地HIV毒株流行及耐药毒株发生传播的情况。方法采集当年新确证的、16~25岁未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者的血浆样本,共176份。提取病毒核糖核酸（RNA）,通过扩增HIV-1 pol区片段,进行测序和耐药基因变异分析。结果 3年共获得pol区序列176条,主要以CRF01_AE为主（86.9%,153/176）;其次也发现了少量CRF07_BC、CRF08_BC和B亚型。共有5例（2.8%,5/176）出现耐药突变,4例为异性性传播,1例为注射吸毒传播,其中1例针对蛋白酶类抑制剂（PI）,3例针对非核苷类抑制剂（NNRTIs）,另有2例针对核苷类抑制剂（NRTIs）发生耐药突变。结论当地主要流行毒株为CRF01_AE,广西柳州HIV-1新近感染者耐药传播目前处于低度传播水平,但仍要进一步加强对新近感染者的耐药监测和病人的治疗管理。
- 梁富雄梁淑家张晶陈柳军李剑军刘鑫朱秋映周信娟王江伟周月姣李峥何翠廖玲洁阮玉华邵一鸣邢辉
- 关键词：基因序列
