国家重点实验室开放基金(SKLVBF200906)
- 作品数：2 被引量：5H指数：1
- 相关作者：张兰兰华育平王建琪程成曾祥伟更多>>
- 相关机构：东北林业大学中国农业科学院哈尔滨兽医研究所更多>>
- 发文基金：国家重点实验室开放基金更多>>
- 相关领域：农业科学医药卫生更多>>
- 野禽源AIV PB1-F2基因的遗传进化及部分氨基酸位点组成分析被引量：1
- 2011年
- 在完成14株野禽源AIV PB1-F2基因克隆、测序的基础上,对其进行了同源性、遗传进化关系及氨基酸编码特征的比较分析。结果发现,H5N1亚型高致病性毒株A/lesser_kestrel/Harbin/194/2007(H5N1)PB1-F2的第37,48,50位氨基酸分别为精氨酸、脯氨酸、甘氨酸,与其他13个低致病性毒株均不相同(其分别为谷氨酰胺、谷氨酰胺、天冬氨酸)。为探讨这一现象,从NCBI Influenza Virus Resource中选取1 061个AIV毒株的PB1-F2基因序列进一步展开分析,结果表明:在第37,48,50位氨基酸位点上,97香港H5N1、其他H5N1及其他亚型AIV在此3个位点上氨基酸的构成存在着较为明显的差异,而且还呈现出了一定的规律和特点;并且研究还发现在此3个位点上,H9N2亚型毒株也表现出了较强的时间和空间分布特征。针对PB1-F2基因的遗传进化关系分析表明,H5N1及香港系毒株较其他AIV存在较远的遗传距离。随机的突变和重组似乎不足以解释这种差异及遗传距离形成的原因,其生物学意义有待于进一步探讨。
- 张进李雁冰柴洪亮张兰兰华育平
- 关键词：遗传进化氨基酸组成
- 禽流感病毒H3N8亚型野鸭源分离株基因特征被引量：4
- 2011年
- 根据已知禽流感病毒(AIV)的8个基因序列设计合成12对特异引物,通过反转录—聚合酶链式反应(RT-PCR)技术,分别成功扩增出分离于野鸭(Mallard)的1株H3N8亚型禽流感病毒的全基因片段,将其分别克隆到pMD18-T载体后进行序列测定。同时将8个基因片段与GenBank发表的相应序列进行比较,绘制各基因的进化树。结果表明:所克隆到的8个片段均包含相应病毒基因的完整开放阅读框架,长度分别为PB2/2280、PB1/2276、PA/2150、HA/1734、NP/1497、NA/1413、MP/759、NS/838bp核苷酸,分别编码759、758、716、577、498、4702、52/962、30/125个氨基酸。A/mallard/Sanjiang/359/2007(H3N8)株HA有7个潜在糖基化位点;在HA裂解位点序列为PEKQTR↓GLF,无连续的多个碱性氨基酸插入,具有典型的低致病性禽流感病毒特征。根据A/mal-lard/Sanjiang/359/2007(H3N8)株与参考毒株的序列比较分析结果推测,该分离株可能是不同亚型禽流感病毒通过互相基因交换所形成的基因重组体。
- 王建琪华育平曾祥伟张兰兰程成张玉稳
- 关键词：禽流感病毒
