国家自然科学基金(31201603)
- 作品数：9 被引量：20H指数：3
- 相关作者：张银东冯仁军王静毅张锡炎李成梁更多>>
- 相关机构：中国热带农业科学院海南大学海南科技职业学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金海南省自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 木薯乙烯信号途径重要基因的生物信息学及表达分析被引量：1
- 2014年
- 木薯是全球三大薯类作物之一,具有抗逆、耐瘠的特性。气态植物激素乙烯在植物生长发育和应对生物及非生物胁迫过程中起着重要作用。本研究收集了木薯乙烯信号途径中的受体基因家族(MeERS1,MeERS2,MeERS3,MeERS4,MeERS5,MeETR2和MeEIN4)和部分转录因子基因家族(MeEIL1,MeEIL2),通过生物信息学方法对这些基因进行了多重比对、保守结构域预测和聚类分析,并采用实时荧光定量PCR的方法测定它们在木薯华南五号不同组织器官中的转录表达水平。生物信息学分析结果表明,受体蛋白都含有高度保守的GAF和HisKA结构域,而转录因子则含有EIN3结构域。另外,受体蛋白都具有跨膜结构域,有的还具有信号肽,而转录因子不具有这些结构域。转录表达分析结果表明,MeERS1、MeERS3、MeEIN4和MeEIL2成组成型表达,在茎、根、块根和叶中没有明显的表达差异;而另一部分基因则成组织器官差异型表达,其中MeERS2和MeETR2主要在茎和叶中高表达,MaERS4、MaERS5和MaEIL1主要在根、茎和叶中表达,在块根中表达量较低。这些结果将为进一步研究乙烯信号途径在木薯抗胁迫过程中的功能奠定基础。
- 任梦云冯仁军史后蕊云天艳张恒王静毅卢利方张银东
- 关键词：木薯生物信息学分析
- 香蕉果皮和果肉中可溶性糖含量测定被引量：3
- 2016年
- 本研究采用多种浓度的乙醇溶液分别对香蕉不同后熟度果皮和果肉中可溶性糖进行提取,并利用检测试剂盒对提取的可溶性糖进行含量测定,以期探索适合不同成熟度香蕉果皮和果肉中可溶性糖的最佳提取方法,同时揭示采后香蕉果实可溶性糖含量随时间的变化规律。试验结果表明,本研究成功建立了不同成熟度香蕉果皮、果肉中可溶性糖的最佳提取方法,同时还发现香蕉果实后熟过程中果肉中葡萄糖含量变化呈现先升后降的趋势,果皮中可溶性糖含量仅呈现出上升的趋势。
- 冯仁军周登博起登凤张妙宜李成梁云天艳张银东张锡炎
- 关键词：香蕉果皮果肉可溶性糖含量
- 一种快速提取香蕉叶片总核酸、总RNA和总DNA的新方法被引量：5
- 2014年
- 在SDS法的基础上,以富含多糖、多酚等次生代谢物质的香蕉叶片为材料,通过选择性添加适量5 mol/L KAc(pH4.8)或不同体积无水乙醇分别提取香蕉叶片总核酸、总RNA(不含DNA)和总DNA(不含RNA)。结果表明:不添加KAc的可提取到总核酸;添加1/3体积和2/3体积的KAc得到总RNA,添加1/3体积无水乙醇处理得到总DNA。该结果获得一种简单、快速,能在1次实验中添加不同试剂提取香蕉叶片总核酸、总RNA和总DNA的新方法。
- 柴娟冯仁军史后蕊任梦云王静毅张银东
- 关键词：香蕉叶片总RNA总DNA
- 一种简便有效的香蕉小分子RNA提取方法被引量：1
- 2015年
- 【目的】提供一种简单、经济、高效的香蕉小分子RNA提取方法,以满足RT-PCR、Northern杂交等分子生物学研究的需要。【方法】以巴西蕉(Musa acuminata L.AAA group,‘Brazilian’)的叶片、雄花、果实和根系为材料,利用改良的CTAB法,结合使用PEG8000分级沉淀DNA和大分子RNA,从而获得小分子RNA。【结果】琼脂糖凝胶电泳显示小RNA带型清晰,无DNA和大分子RNA干扰,说明小RNA质量较好。获得的小RNA经紫外光谱分析其A260/A280的比值在1.872~2.020,产量可达35μg·g-1。以提取的各组织小分子RNA为模板,利用茎环RT-PCR方法在香蕉不同组织小RNA中均检测到mi RNA156a,其扩增片断大小约为70 bp,且测序结果与预测的香蕉mi R156a序列一致。【结论】本实验提供了一种简便高效的香蕉小分子RNA提取方法,可满足RT-PCR、Northern blotting及小RNA文库构建等后续分子生物学研究的需要,为研究人员在实际工作中提供了更多的选择。
- 王静毅冯仁军柴娟陈友张银东马子龙武耀廷
- 关键词：香蕉小分子RNA
- 干旱胁迫下香蕉miRNAs的表达分析被引量：2
- 2017年
- 以干旱驯化和未驯化的香蕉幼苗为研究材料,采用实时荧光定量PCR方法检测干旱胁迫过程中6个miRNAs的表达变化。结果表明:6个miRNAs在所有香蕉幼苗的干旱胁迫响应过程中均有表达,但其表达模式存在差异,在直接干旱处理下,mi R156k、mi R160a、mi R162a、mi R164a、mi R166d的表达均呈现升高-降低的趋势,mi R397b的表达则呈现升高-降低-升高-降低的趋势;在驯化后干旱处理下,mi R156k、mi R162a、mi R166d、mi R397b的表达均呈现升高-降低的趋势,mi R160a、mi R164a的表达则呈现升高-降低-升高-降低的趋势。干旱胁迫响应过程中(除处理后第10天外),驯化后的香蕉幼苗中miRNAs的表达量基本上高于未驯化香蕉幼苗中miRNAs的表达量,同时还发现mi R160a和mi R164a的表达量都非常高。上述研究结果将为香蕉干旱胁迫应答研究奠定基础。
- 张恒冯仁军王静毅云天艳李成梁张银东张锡炎
- 关键词：香蕉干旱胁迫MIRNAS
- 木薯根际放线菌的分离鉴定及其抑菌活性分析被引量：3
- 2016年
- 通过涂布平板法,对木薯根际土壤样品进行放线菌的分离培养和筛选,得到2株拮抗尖孢镰刀菌古巴专化型4号小种的放线菌(MS13、MS14)。形态特征观察、生理生化特性检测、16S rDNA序列分析等结果表明,菌株MS13属于细链孢菌属(Catenulispora),菌株MS14属于链霉菌属(Streptomyces)。皿内抑菌试验表明,菌株MS13、MS14对11种病原菌中的多数皆有较好的拮抗作用,具有较好的抑菌广谱性;但它们对不同属或同一属不同种靶标菌的抑菌效果各不相同,又具有明显的抑菌特异性。
- 云天艳冯仁军陈宇丰周登博高祝芬起登凤张银东张锡炎
- 关键词：放线菌抑菌活性
- 香蕉GAPDH基因家族的生物信息学及转录表达分析被引量：1
- 2014年
- 从香蕉基因组数据库和NCBI数据库中检索香蕉GAPDH基因家族的所有成员,并采用生物信息学方法对其进行亚细胞定位、进化树分析和保守结构域预测。克隆测序发现,巴西蕉内的GAPDH基因家族成员序列与小果野蕉基因组数据库中提供的序列基本一致,同源性超过98%。转录表达分析表明,GAPDH基因家族成员在巴西蕉不同器官的表达模式多样:MaGAPCP1,MaGAPC6/8/10/11成组成型表达,其余的基因则在各组织器官间成差异型表达,且差异型表达的基因在不同组织器官中表达模式也不相同,组成型表达的基因在不同组织器官中表达模式虽相同,但表达量有差异。GAPDH基因家族成员在表达模式上的多样化,可能暗示其功能的多样化,这种多样化可能是在进化过程中为适应环境而出现的功能分化或冗余。结果为进一步研究GAPDH基因家族成员在香蕉生长、发育,非生物胁迫,果实后熟等重要生物学过程中的功能奠定基础。
- 史后蕊冯仁军王静毅柴娟任梦云卢利方张银东
- 关键词：香蕉生物信息学分析
- HXKs基因在香蕉果实后熟过程中功能初探被引量：2
- 2017年
- 香蕉是世界主要水果之一,对乙烯非常敏感,属于呼吸跃变型果实。目前,香蕉果实后熟机理还未完全探明,后熟过程中己糖激酶(HXK)与乙烯的关系还不清楚。通过BLAST比对从香蕉基因组数据库中发现HXK基因家族的11个成员,经克隆获得这些基因的序列,并研究HXKs基因在香蕉果实自然后熟过程中的转录表达谱,重点研究乙烯利、甘露糖、NAG和1-MCP对HXKs基因表达、HXK酶活和内源乙烯生物合成的影响。结果表明:在香蕉果实后熟过程中HXKs基因呈现差异性表达,乙烯利上调大多数HXKs基因的表达和HXK酶活,1-MCP的作用正好相反,这表明外源乙烯正作用于HXK。另一方面,甘露糖加快内源乙烯生物合成,NAG却推迟内源乙烯生物合成,这说明HXK正作用于内源乙烯生物合成。所以,在香蕉果实后熟过程中乙烯和HXK之间存在相互促进的关系。这将为进一步阐明香蕉果实后熟机制提供理论依据,也将为香蕉果实保鲜新技术的挖掘提供新思路。
- 李成梁冯仁军卢利方云天艳张恒张银东张锡炎
- 关键词：酶活乙烯生物合成
