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紫稻型水稻线粒体cox Ⅲ基因转录本的RNA编辑被引量：2: 2009年; 紫稻细胞质雄性不育系是本实验室构建的新型细胞质雄性不育系。使用PCR、RT-PCR、DNA测序等技术,得到了紫稻细胞质雄性不育水稻不育系(樱香A)及其保持系(樱香B)线粒体细胞色素C氧化酶亚基coxⅢ基因转录本cDNA序列。通过与水稻"93-11"线粒体基因组序列比对发现,樱香AcoxⅢ cDNA序列中,没有发生RNA编辑;而樱香BcoxⅢ cDNA序列中有13个编辑位点,11个为C-T编辑,2个为T-C编辑。在樱香B cDNA序列中的13个编辑位点位于13个密码子中,所编码的氨基酸有10个发生改变,这些氨基酸的改变大大增加了蛋白质的疏水性。研究表明,RNA编辑在合成具正常功能的COXⅢ多肽的过程中具有至关重要的作用,同时也说明RNA编辑可能与细胞质雄性不育相关。; 魏磊费震江丁毅; 关键词：RNA编辑细胞质雄性不育线粒体

一种鲁棒有序的mRNA差异显示方法: 全基因组表达图谱技术是现代生命科学研究领域的核心技术之一。现今的全基因表达图谱技术可依据其策略分为三大类:基于测序的策略、基于杂交的策略和基于凝胶电泳的策略。其中,测序策略可以为各种生物样本提供具有最大广度和深度的序列信...; 刘宏高胡继红潘磊黄兴国余金洪丁毅; 关键词：鲁棒 MRNA差异显示; 文献传递

紫稻(Oryza sativa L.)线粒体ATP酶atp9基因转录本RNA编辑被引量：5: 2008年; 紫稻(Oryza sativa L.)细胞质雄性不育系是本实验室新构建的新型细胞质雄性不育系。本研究使用PCR、RT-PCR等技术,得到了紫稻不育系(樱香A)及其保持系(樱香B)线粒体atp9基因的基因组序列和cDNA序列。通过对这些序列的分析发现:樱香Aatp9cDNA序列中,没有发生RNA编辑;而樱香Batp9cDNA序列中有2个编辑位点,在樱香B cDNA序列2个编辑位点中,223位点由C替换为T,导致原来编码精氨酸密码子成为终止密码子,保证atp9mRNA编码一个"正常长度"的ATP9多肽。而由于没有终止密码子,樱香A mRNA就不能翻译成正常的多肽。上述研究表明,RNA编辑在生成正常的ATP9多肽的过程中发挥了重要作用,同时也说明RNA编辑可能与细胞质雄性不育相关。; 魏磊严志祥余金洪丁毅; 关键词：RNA编辑细胞质雄性不育

云南紫稻细胞质雄性不育系和保持系线粒体基因组BAC文库的构建: 2008年; 以云南紫稻细胞质无花粉型水稻樱香不育系和保持系为材料，构建了不育系和保持系的线粒体基因组BAC文库．每个文库均保存2304个菌落，外源插入片段介于10～20kb之间．将两个文库的2304个克隆分别集中于96孔板中，根据已发表的水稻线粒体序列对atp6、atp9、cob、cox2等4个基因设计特定引物，对96孔板中的菌落进行了PCR鉴定，均能筛选得到阳性克隆，通过对96孔板中阳性克隆的位置进行推导，可以得到文库中含有相应基因克隆的大致位置及数目．PCR筛选结果显示两个文库均包含用于检测的目的线粒体基因，说明文库典型性良好，并且PCR法用于文库基因筛选具有快速简便的优点．; 严志祥余金洪丁毅; 关键词：细胞质雄性不育线粒体 BAC文库

中国野生稻及栽培稻的5S rDNA序列比较分析: 野生稻是重要的遗传资源,由于它具有多种抗逆基因,因此成为宝贵的基因库,在水稻育种中占有重要的作用。全世界共有20种野生稻,其中我国占有三种,迄今仍没有完全弄清所有野生稻的种间系统发育关系及与栽培稻的亲缘关系。对于中国野生...; 朱小燕丁毅; 关键词：野生稻栽培稻种间关系; 文献传递

湖北省优质杂交稻品种贮藏蛋白的比较研究被引量：2: 2007年; 研究选取水稻品种共20个,其中包括湖北省近两年审定的优质杂交水稻品种10个(‘鄂早17’、‘鄂早18’、‘两优1193’、‘武香880’、‘岳优26’、‘宜优99’、‘协优96’、‘鄂晚12’、‘鄂中5号’、‘两优277’)以及7个普通杂交水稻(‘G98-202’、‘578’、‘两优637’、‘宜优22’、‘3685’、‘3089’、‘加育948’)和国家审定的优质水稻品种3个(‘嘉育948’、‘两优932’、‘舟903’),采用不连续的SDS-PAGE电泳分析种子贮藏蛋白,结果在谷蛋白中主要分离出57 kD的蛋白前体、37～39 kD的酸性亚基和22～23 kD的碱性亚基。同时,选取品种‘3089’、‘嘉育948’、‘537’、‘舟903’和‘两优932’,利用高效液相色谱法分析了种子贮藏蛋白中的谷蛋白亚基的含量。结果表明,水稻谷蛋白亚基含量的多少可以作为评价品种营养品质优劣的参考依据之一。; 何莹邵锦震余夏夏王前和朱伯华丁毅; 关键词：谷蛋白醇溶蛋白 SDS-PAGE 高效液相色谱

基于5S rDNA分子和细胞学特征探讨稻属基因组结构及亲缘关系: 稻属包括20多个野生稻种和2个栽培稻种,其中亚洲栽培稻为全球近一半的人口提供粮食,而众多野生稻则是稻作育种的重要种质资源。进一步用分子生物学手段深入探讨稻属的基因组结构及种间系统发育关系,将成为有效利用野生稻资源的关键。...; 朱小燕蔡得田丁毅; 关键词：稻属系统进化关系 FISH; 文献传递

云南紫稻细胞质无花粉型三系及杂种F_1的AFLP指纹图谱的构建与分析被引量：5: 2007年; 利用AFLP分子标记对云南紫稻细胞质无花粉水稻三系及杂种F1进行了指纹图谱的构建与比较分析。从14对引物中筛选出8对具有明显多态性的引物。天香018(天香A×珞恢018)材料组(不育系、保持系、恢复系及杂种F1)共扩增出179条带,其中有52条多态性谱带,占总带数的29.05%,平均每对引物可以扩增出6.50条多态性谱带;天香806(天香A×珞恢806)材料组(不育系、保持系、恢复系及杂种F1)共扩增出177条带,其中有50条差异带,占总带数的28.25%,平均每对引物可以扩增出6.25条多态性谱带。特别明显的是在引物对E-ATG/M-CAC的扩增中,在AFLP指纹图谱中出现两条特征带(a带和b带),为保持系所特有,能够明显区别于不育系、恢复系和F1。在另外一些引物对中也观察到不育系与保持系之间的差异带。; 胡侃余夏夏余金洪丁毅; 关键词：细胞质雄性不育系扩增片段长度多态性指纹图谱杂交水稻

紫稻(Oryza sativa L.)线粒体ATP合成酶atp6基因转录本RNA编辑被引量：5: 2010年; 紫稻(Oryza sativa L.)细胞质雄性不育系紫稻A是本实验室构建的新型细胞质雄性不育系。本研究使用PCR、RT-PCR、DNA测序等技术,得到了紫稻细胞质雄性不育水稻不育系(樱香A)及其保持系(樱香B)线粒体atp6基因转录本cDNA序列。通过与基因组序列比对发现:樱香Aatp6cDNA序列中,没有发生RNA编辑;而樱香Batp6 cDNA序列中有16个编辑位点,在樱香B cDNA序列16个编辑位点位于15个密码子中,所编码的氨基酸均发生改变:在1003位点由C替换为T,导致原来编码谷氨酰胺密码子(CAA)成为终止密码子(TAA),保证atp6 mRNA编码一个正常的ATP6多肽;而由于没有发生RNA编辑,樱香A mRNA就不能翻译成正常的多肽。研究表明,RNA编辑在合成正常的ATP6多肽的过程中具有至关重要的作用,同时也说明RNA编辑可能与细胞质雄性不育相关。; 魏磊费震江丁毅; 关键词：RNA编辑细胞质雄性不育线粒体

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国家自然科学基金(30571143)