重庆市自然科学基金(2005BB5053)
- 作品数：4 被引量：11H指数：2
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- 相关机构：重庆邮电大学重庆邮电学院大连大学更多>>
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- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 拟南芥基因倍增及基因流失分析
- 2006年
- 基因倍增指基因组中含有基因的DNA片段复制出一个或更多拷贝的过程,是进化出新物种的主要原因。采用新的数据和方法研究拟南芥基因组的基因倍增过程,通过分析串联基因倍增和大规模基因倍增的存在比例和同义置换率分布,并估计大规模倍增后基因流失的比例,揭示了拟南芥基因组一次非常明显的全基因组倍增,采用科学的方法估计这次倍增发生在约8000万年前。比较该结果与之前的研究,提出了一种解释拟南芥基因倍增过程更合理的模型。
- 李鸿健谭军
- 关键词：拟南芥基因倍增
- 水稻亚种间基因组水平微卫星多态性分析被引量：1
- 2007年
- 从公布的水稻两个亚种(籼稻9311和粳稻Nipponbare)基因组草图序列中,搜寻了所有的完整微卫星位点,发现单碱基重复中A/T重复占大多数,二碱基重复中AT/TA、GA/TC、AG/CT重复居多,三碱基中GGC/GCC、GCG/CGC、CCG/CGG重复较多。通过相互比较,不同基序和基因区域的微卫星多态性有较大差异:内含子和基因间区中微卫星的多态性较高(分别约为45%和40%),外显子中的微卫星多为三碱基重复,而且多态性较低(约为25%);两个亚种具多态性的微卫星间距平均约为12.7 kb和16.4 kb。
- 谭军徐勤民周其兴薛庆中
- 关键词：水稻亚种基因组微卫星多态性分子进化
- 基因倍增研究进展被引量：5
- 2006年
- 基因倍增是指DNA片段在基因组中复制出一个或更多的拷贝,这种DNA片段可以是一小段基因组序列、整条染色体,甚至是整个基因组。基因倍增是基因组进化最主要的驱动力之一,是产生具有新功能的基因和进化出新物种的主要原因之一。本文综述了脊椎动物、模式植物和酵母在进化过程中基因倍增研究领域的最新进展,并讨论了基因倍增研究的发展方向。
- 李鸿健谭军
- 关键词：基因倍增
- 植物miRNAs前体的生物信息分析被引量：5
- 2006年
- miRNAs前体(pre-miRNAs)是产生成熟miRNAs的基因表达产物,能形成较为稳定的发卡环结构,具有较低的最小折叠自由能(minimal folding free energy,MFE)。在对植物pre-miRNAs长度、不同碱基含量、MFE、熵分析基础上,重点比较不同RNAs序列之间MFE与其长度的比值(MFEL)。结果表明MFEL是区分植物pre-miR-NAs的一个很有效的参数:pre-miRNAs的MFEL值平均为-45.98 kcal/mol,明显低于mRNAs(-23.08 kcal/mol),tRNAs(-22.13 kcal/mol)和rRNAs(-16.83 kcal/mol)。使用MFEL参数可提高预测植物miRNAs基因的效率。
- 陈薇谭军何晨
- 关键词：拟南芥MIRNAS
