农作物种质资源保护项目(NB2010-2130135-28B)
- 作品数：7 被引量：48H指数：4
- 相关作者：姜慧芳黄莉陈玉宁任小平周小静更多>>
- 相关机构：中国农业科学院油料作物研究所中南民族大学全国农业技术推广服务中心更多>>
- 发文基金：农作物种质资源保护项目国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 青枯菌诱导下花生基因组DNA表观遗传变化的MSAP分析被引量：1
- 2015年
- 以高感青枯病品种中花12号和高抗青枯病品种远杂9102为材料,调查青枯菌接种12 h后花生基因组DNA的甲基化水平和变化模式。甲基化敏感扩增多态性(Methylation-sensitive amplification polymorphism,MSAP)分析表明,正常生长的中花12号和远杂9102的基因组DNA甲基化比率均为35.1%,经青枯菌接种12 h后,中花12号降低到31.3%,而远杂9102的基因组DNA甲基化比率则升高至37.2%。与对照相比,青枯菌接种12 h胁迫下中花12号和远杂9102基因组DNA的甲基化和去甲基化分别为5.9%,12.4%,18.3%,11.9%。由此推测,高抗青枯菌的花生经青枯菌侵染后基因组DNA某些位点的甲基化状态发生变化而使基因表达发生了改变,产生或启动对青枯菌胁迫的能动应激机制。
- 徐志军黄莉姜慧芳
- 关键词：花生青枯菌DNA甲基化甲基化敏感扩增多态性
- 利用SNP标记高密度遗传图谱进行花生出仁率QTL定位被引量：3
- 2016年
- 为进一步明确出仁率遗传基础,本研究以出仁率性状有显著差异的两亲本中花5号和ICGV 86699衍生的RIL群体为材料,以其表型数据结合栽培花生第一张基于SNP标记的高密度遗传图谱,采用Windows QTL Cartographer V.2.5软件的复合区间作图法,对3个单环境及联合环境下出仁率进行QTL定位,共检测到28个QTL。各QTL解释的表型变异为3.98%-13.77%,LOD值介于2.59-7.36之间,其中6个为贡献率大于10.0%的主效QTL。Meta-QTL分析鉴定出7个在不同环境下都能稳定表达的一致性QTL。其中一致性QTL cqSPA4b在3个单环境和联合环境中都能检测到,一致性QTL cq SPB6a在3个单环境中能检测到,且平均贡献率为11.86%。与前人的研究结果比较发现,cq SPA5b与另外两个不同群体鉴定出的A5染色体上出仁率QTL区间相似。本研究结果为出仁率QTL的精细定位及分子标记辅助育种奠定了良好基础。
- 周小静董洋张芳任小平陈玉宁黄莉陈伟刚廖伯寿雷永晏立英罗怀勇姜慧芳
- 关键词：花生出仁率QTL定位
- ICRISAT花生微核心种质农艺性状和黄曲霉抗性关联分析被引量：20
- 2012年
- 以国际半干旱热带地区作物研究所(ICRISAT)花生微核心种质146份资源为材料,鉴定农艺性状和黄曲霉抗性,用26对SSR引物检测多态性位点,在分析连锁不平衡、群体结构和Kinship的基础上进行关联分析。连锁不平衡的分布显示R2平均值为0.185,表明26对SSR引物扩增的120个位点之间具有较低的连锁不平衡程度。群体结构分析结果将146份花生品种分为2个亚群,分别对应疏枝亚种和密枝亚种,与植物学分类和遗传分化分析的结果基本一致。关联分析表明,共有39个位点与10个农艺性状(株高、总分枝数、第一分枝数、小叶宽、结果分枝数、百果重、出仁率、单株生产力、种子长、种子宽)相关联,表型变异解释率为1.50%～20.34%,16个SSR位点与黄曲霉侵染病情指数、黄曲霉产毒量相关联,表型变异解释率为5.23%～17.19%,与农艺性状、黄曲霉抗性同时相关联的SSR位点有13个。关联位点的等位变异效应分析表明,10个农艺性状和2个黄曲霉抗性性状共有63个增效等位变异和47个减效等位变异,并发掘了ICG6022等携有优良等位变异的载体品种。
- 黄莉任小平张晓杰陈玉宁姜慧芳
- 关键词：花生微核心种质SSR标记
- 源于栽培种花生的EST-SSR引物对野生花生扩增的多态性被引量：8
- 2012年
- 以花生属86份野生近缘种和3份栽培种为材料,利用从栽培种花生中开发设计的EST-SSR引物,分析其对野生花生扩增的有效性,探讨EST-SSR引物用于花生资源遗传多样性研究的适用性。随机选取235对EST-SSR引物进行筛选,223对EST-SSR引物均扩增出条带,有效性为94.89%,其中能检测到多态性的53对引物在89份资源中共扩增出238条带,包括206条多态性带。每对引物能扩增出1～12多态性带,平均3.89条,多态性指数为0.044～4.040,平均1.173。统计分析结果表明,89份花生种质材料间的平均相似系数为0.685,变异范围为0.442～0.976,在遗传距离为0.408处,分成2大组9小组,栽培种花生被聚在花生区组中,相同区组的材料基本被聚在一起,A.duranensis与栽培种花生(A.hypogaea L.)的关系较近,聚类结果与花生属的植物学分类基本一致。对含油量和基因型数据相关性分析和t检验发现,POCR437-180/170等6对标记可以作为含油量相关分析标记筛选的后备标记。用这6对标记的引物序列搜索cDNA文库和BLAST库,发现引物POCR437序列对应丙二酸单酰-CoA-ACP转酰酶和酰基载体蛋白的编码基因,这2种蛋白质参与脂肪酸的合成。
- 唐梅陈玉宁任小平黄莉周小静严海燕姜慧芳
- 关键词：野生花生EST-SSR聚类分析
- 高产高油花生新品种中花16及其亲本荚果相关性状的SSR标记鉴定
- 2014年
- 阐释荚果相关性状的遗传基础是改良花生品种产量的重要前提。本研究以高产高油新品种中花16及其2个直接亲本和6个间接亲本为材料,对荚果性状及其相应SSR标记进行鉴定。结果表明,中花16的荚果长、百果重和百仁重低于其直接亲本8130和中花5号,但高于全部供试8个亲本的平均值;荚果宽和种子宽大于直接亲本和间接亲本的对应值;种子长高于直接亲本和8个亲本的平均值。通过136对多态性SSR引物鉴定表明,中花16具有直接亲本8130的64.1%和中花5号87.3%的条带,且中花16还具有一些直接亲本中不存在而在间接亲本中存在的一些条带。综合分析SSR标记带型和表型数据,鉴定出5个与百果重相关、4个与百仁重相关、3个与荚果长相关、3个与种子长相关的候选分子标记。综合分析表明,直接和间接亲本中与大果性状相关的标记IPAHM606-1、IPAHM531-1、GA8-2、1B9-4和HAS0428-2条带在育种过程中传递给了中花16。
- 成良强黄莉任小平陈玉宁周小静姜慧芳雷永黄家权晏立英廖伯寿
- 关键词：花生品种高产高油
- 花生遗传图谱构建及黄曲霉抗性相关QTL被引量：8
- 2015年
- 创制抗黄曲霉种质并建立相关分子标记辅助选择技术是深化抗性遗传改良的基础。本研究以源于对黄曲霉具有不同抗性的花生品种中花10号（感病种质）与ICG12625（抗性种质）杂交构建的重组自交系（RIL）群体为材料,通过重复接种鉴定,发现所涉及重组自交系群体的黄曲霉抗性存在很大分化,遗传分析结果显示,侵染和产毒抗性均符合2对主基因＋多基因遗传模型;获得侵染指数较低的RIL家系1个（QT401）,毒素浓度较低的家系4个（QT344、QT389、QT477和QT483）。通过对RIL群体的多态性检测并应用Joinmap3.0软件,构建了1张由458个SSR标记位点组成、包含20个连锁群、总长为1165.45cM的遗传连锁图。结合抗性鉴定数据,应用WinQTLCart2.0软件的复合区间作图（CIM）法,获得了6个与黄曲霉侵染抗性相关的QTL和10个与产毒抗性相关的QTL,贡献率在6.34%-12.00%之间。
- 李前波杨春燕黄莉任小平王后苗陈玉宁周小静姜慧芳雷永晏立英廖伯寿
- 关键词：花生黄曲霉抗性遗传连锁图QTL
- 花生SSR核心引物筛选及育成品种DNA指纹图谱构建被引量：13
- 2016年
- 根据SSR引物在遗传连锁图上的位置,首先选择200对均匀分布在染色体上,且通过聚丙烯酰胺凝胶电泳银染技术筛选表现为条带清晰、可重复的单位点引物,再利用毛细管电泳技术筛选等位变异数≥4个、引物的PIC值≥0.4、杂合度≤0.1的引物,并参考其所在染色体位置,获得60对具有丰富的多态性、广泛的代表性、均匀分布的SSR引物,同时普通引物和荧光引物都具有较好的扩增效果,作为花生品种构建指纹图谱的核心引物。60对SSR引物在100份材料中共扩增出352个多态性等位位点,引物扩增的等位位点均值为5.87;每对引物可区分的基因型数目均值是6.35;引物的多态性信息指数（PIC值）均值是0.54。高多态性的SSR引物占66.67%,SSR引物杂合度都在0.06以下。品种间的遗传相似系数变幅为0.530~0.683。构建了100份花生的指纹图谱,每一条指纹都具有唯一性,可标识一个品种,为全国花生品种及资源的DNA指纹数据库的构建奠定基础。
- 任小平郑艳丽黄莉陈玉宁周小静陈伟刚雷永晏立英万丽云廖伯寿姜慧芳
- 关键词：花生SSR荧光标记毛细管电泳技术
