四川省国际科技合作与交流研究计划项目(HH20080016) 作品数:4 被引量:25 H指数:3 相关作者: 郑晓丽 曾东 倪学勤 宋振银 更多>> 相关机构: 动物疫病与人类健康四川省重点实验室 四川农业大学 更多>> 发文基金: 四川省国际科技合作与交流研究计划项目 长江学者和创新团队发展计划 更多>> 相关领域: 农业科学 医药卫生 生物学 更多>>
鸡产气荚膜梭菌遗传多样性的REP-PCR分析 被引量:9 2009年 为探讨鸡产气荚膜梭菌流行现状的调查方法,采用REP-PCR(repetitive extragenic palindromicPCR)技术对四川省10个规模化鸡场分离得到的34株A型产气荚膜梭菌进行了遗传多样性分析,并与AFLP(amplified fragment length polymorphism)方法进行了分型比较。结果显示,尽管REP-PCR分型方法只能将34株产气荚膜梭菌分为7个亚型,但是,仍然表现出对产气荚膜梭菌菌株的较高的鉴别能力,不失为一种简便、快速、可靠的产气荚膜梭菌分型方法。经对亚型分布情况进行分析,表明产气荚膜梭菌的流行特点与地区差异相关,不同鸡场产气荚膜梭菌的亚型差异明显,而同一鸡场的亚型较单一,以一种亚型为主,交叉有少数其他亚型;优势基因型为REP-PCR基因1型、2型和3型。证实,REP-PCR技术适用于鸡产气荚膜梭菌遗传多样性分析。 郑晓丽 倪学勤 曾东 JOSHUA Gong 宋振银关键词:产气荚膜梭菌 四川地区鸡源产气荚膜梭菌的分离鉴定与基因分型 被引量:7 2009年 目的检测四川地区健康鸡群产气荚膜梭菌的分布状况。方法从四川地区规模化鸡场采集新鲜粪便样品,按产气荚膜梭菌α、β、ε、ι毒素基因cpa、cpb、etx及iA序列,设计针对4种毒素基因的4对特异引物,应用多重PCR方法对产气荚膜梭菌进行基因分型。最后利用重复序列PCR进一步做亚型分析。结果从150份样品中分离到8株(5.3%)产气荚膜梭菌,多重PCR都只扩增出α条带,毒素基因分型结果均为A型。ERIC-PCR、REP-PCR图谱显示两者均适用于产气荚膜梭菌亚型分析,ERIC-PCR是一种更简便、快速和有效的分子流行病学调查方法。结论四川地区健康鸡群中存在的产气荚膜梭菌主要是A型。 倪学勤 宋振银 曾东 郑晓丽 Joshua Gong关键词:产气荚膜梭菌 多重PCR 基因分型 四川地区鸡场产气荚膜梭菌的扩增片段长度多态性分析 被引量:3 2009年 目的了解四川部分地区10个规模化鸡场产气荚膜梭菌的基因型及遗传学关系。方法采用EcoRI、MseI酶对34株不同地区鸡场的产气荚膜梭菌分离株进行扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)分析。结果AFLP能全部区别34株产气荚膜梭菌,辨别力指数为100%,其不同来源菌株呈现多态性分布。按Dice系数≥0.8,可分为19个AFLP基因亚型,AFLP-14为优势基因型,占总菌株数的20.59%。分析亚型分布情况表明,产气荚膜梭菌的流行特点与地区差异相关:不同鸡场产气荚膜梭菌的亚型差异明显;而同一鸡场的亚型较单一,以一种亚型为主,交叉有少数其他亚型。结论四川地区鸡场产气荚膜梭菌的基因型十分丰富,AFLP技术是其分子流行病学研究的有效手段。 曾东 郑晓丽 倪学勤 Joshua Gong关键词:产气荚膜梭菌 基因分型 扩增片段长度多态性 采用AFLP和ERIC-PCR技术研究规模化鸡场健康鸡群中产气荚膜梭菌的遗传多样性 被引量:9 2009年 为了调查产气荚膜梭菌在健康鸡群中的流行现状,掌握我国部分地区规模化鸡场产气荚膜梭菌的遗传多样性,分析其流行特点与地区差异的关系,利用AFLP(amplified fragment length polymorphism)和ERIC-PCR(en-terobacterial repetitive intergenic consensus PCR)方法对从四川省8个市10个规模化鸡场分离得到的34株A型产气荚膜梭菌进行基因型分析。结果表明,用AFLP技术将34株菌分为12个亚型,用ERIC-PCR方法分为8个亚型。分析亚型分布情况发现:不同鸡场产气荚膜梭菌的亚型差异明显;而同一鸡场的亚型较简单,以一种亚型为主,交叉有少数其他亚型;优势基因型分别为AFLP基因Ⅷ型或ERIC-PCR基因1型。该研究结果说明:四川省规模化鸡场健康鸡群中产气荚膜梭菌的遗传多样性较低,其流行特点与地区差异相关。 倪学勤 郑晓丽 曾东 Joshua Gong 宋振银关键词:产气荚膜梭菌 健康鸡群 AFLP ERIC-PCR