江苏省临床医学科技专项(BL2012039)
- 作品数：13 被引量：81H指数：4
- 相关作者：许争峰马定远林颖季修庆张菁菁更多>>
- 相关机构：南京医科大学附属南京妇幼保健院南京医科大学南京市妇幼保健院更多>>
- 发文基金：江苏省临床医学科技专项江苏省自然科学基金南京医科大学科技发展基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 血友病A患者F8基因突变检测方法的建立及临床应用被引量：2
- 2016年
- 目的：应用 Ion Torrent 半导体测序技术建立血友病 A（HA）的 F8基因致病突变检测方法并探讨其临床应用价值。方法方法学建立。应用长距离 PCR（LD－PCR）对9例 HA 患者进行 F8基因22号内含子倒位和1号内含子倒位检测，倒位阴性患者应用 Ion Torrent 半导体测序技术检测 F8基因致病突变，对发现的致病突变进行 Sanger 测序验证。对8个家系中11例女性受检者进行 HA 携带者检测，并对其中1例孕妇进行胎儿产前基因检测。结果患者检测发现4例错义突变（c．1331A＞C， c．1648C ＞T， c．6506G ＞A， c．6544C ＞T），2例移码突变（c．2393＿2394insT， c．6320delG），1例剪接突变（IVS5＋5G ＞A），1例无义突变（c．43C ＞T），1例内含子22倒位突变。在11例女性受检者中，10例为携带者，1例不携带母源致病突变。 对 1例患病高风险胎儿进行产前基因检测，结果表明胎儿未遗传母亲致病突变。 Sanger 测序验证结果证实8个突变位点真实存在，与高通量测序结果一致。结论成功建立了基于 Ion Torrent 半导体测序技术检测 F8基因突变的方法，该方法检测周期短、通量大，是 F8基因突变筛查的有效方法。
- 刘安杨海平马定远谷变利宋雅洁罗春玉张菁菁林颖王玉国许争峰
- 关键词：突变FACTOR
- 江苏地区人群21-羟化酶基因拷贝数变异分析被引量：1
- 2013年
- 目的分析江苏地区人群21-羟化酶基因(CYP21A2)拷贝数变异情况,统计CYP21A2基因大片段缺失/转换突变的携带者频率。方法收集400例体检健康者外周血标本,用多重连接依赖探针扩增技术(MLPA)进行CYP21A2基因拷贝数检测,对检测发现的大片段缺失/转换突变样本进行位点特异性PCR-酶切多态分析和基因全长测序分析。结果 400例健康人中389例携带2拷贝CYP21A2基因;11例存在拷贝数变异,其中携带3拷贝CYP21A2基因的个体共10例(2.5%),CYP21A2基因大片段缺失/转换突变携带者1例(0.25%)。对10例携带3拷贝CYP21A2基因的样本测序分析,发现5例携带p.Gln318X致病突变。结论江苏地区人群3拷贝CYP21A2基因的携带者频率较高加索人群低,携带者筛查具有一定检出率。
- 秦岭张菁菁林颖罗春玉季修庆成建马定远许争峰
- 关键词：21-羟化酶缺乏症拷贝数变异
- 磁珠法DNA提取技术在多重连接依赖探针扩增检测中的应用被引量：1
- 2014年
- 目的探讨磁珠法DNA提取技术在多重连接依赖探针扩增(MLPA)检测样品制备中的应用价值。方法分别用半自动磁珠法和手工离心柱法提取1例21-羟化酶缺乏症患者和16例健康男性外周血、16例羊水细胞标本的基因组DNA,用MLPA法检测CYP21A2基因拷贝数,比较两种方法制备DNA的质量及MLPA结果。用磁珠法提取200例羊水细胞DNA,MLPA法检测染色体非整倍体异常表达情况。结果磁珠法提取外周血DNA的浓度和总量均高于离心柱法(P<0.05)。两种方法提取羊水DNA浓度相当,磁珠法所得总量较高(P<0.05)。21-羟化酶缺乏症患者CYP21A2基因拷贝数比值接近0.5。200例羊水标本中检出正常二倍体188例,21三体9例,18三体2例,特纳(Turner)综合征(45,X)1例,与核型分析结果一致。结论磁珠法制备的外周血和羊水细胞DNA适用于MLPA检测,具有较高的应用价值。
- 秦岭张菁菁林颖罗春玉季修庆成建马定远许争峰
- 关键词：磁珠法DNA提取
- 应用Ion Torrent半导体测序技术检测常染色体显性多囊肾患者PKD1基因致病突变被引量：4
- 2015年
- 目的基于IonTorrent半导体测序技术建立常染色体显性多囊肾患者PKD1基因致病突变检测方法并评价其临床应用价值。方法遗传病分子诊断。收集2013年7月至2014年8月在南京市妇幼保健院就诊的多囊肾患者5例，提取外周血DNA，采用9个长链PCR反应特异性扩增PKD1基因全部编码区，PCR产物混合后进行酶切，经模板制备、乳液PCR和磁珠颗粒富集，应用IonTorrent个体化基因组测序仪进行PKD1基因测序，对发现的致病突变通过Sanger测序验证。结果应用IonTorrent半导体测序技术检测到4例患者存在PKD1基因致病突变，分别为外显子12微小缺失突变（C．2966_2970delCGGCG），外显子15微小缺失突变（C．50145015delAG），内含子23剪接位点突变（c．8972—2A〉G），外显子36错义突变（c．10675G〉A）。结论基于长链PCR技术和IonTorrent半导体测序技术，建立了常染色体显性多囊肾病基因诊断方法，该方法能够特异性检测PKD1基因致病突变，具有较高的临床应用价值。
- 马定远胡平罗春玉张菁菁成建王玉国蒋涛许争峰
- 关键词：多囊肾常染色体显性
- 胎儿主动脉弓离断的超声心动图诊断与分析被引量：3
- 2015年
- 目的 ：探讨胎儿超声心动图诊断胎儿主动脉弓离断的临床价值。方法 ：选取2009年1月-2012年12月在本院行胎儿超声心动图检查并诊断为主动脉弓离断的41例孕妇,回顾性分析其胎儿超声心动图检查资料。结果：主动脉弓离断41例中,A型5例,B型22例,C型14例。结论 ：胎儿超声心动图检查无创安全有效,是诊断胎儿主动脉弓离断的首选检查方法。主动脉弓离断具有特征性的超声表现,产前超声检出率高。充分掌握其产前超声心动图检查的主要切面及各类型超声声像图特征,有助于提高诊断正确性,对于临床判断预后及处理具有重要的提示意义。
- 吴云杨玲曹荔
- 关键词：主动脉弓离断超声心动描记术
- 早期自然流产绒毛组织SNP-array遗传学诊断研究被引量：4
- 2014年
- 目的:初步探讨单核苷酸多态性阵列(SNP-array)在早期流产绒毛遗传学诊断中的临床应用价值。方法:选取临床诊断为早期自然流产的82例患者,刮宫术后获取绒毛组织,行常规绒毛细胞培养G显带核型分析,并同时提取绒毛组织DNA进行SNP-array检测,比较两者的检测结果。结果:常规绒毛细胞培养G显带核型诊断成功率87.8%(72/82),SNP-array诊断成功率为100%(82/82)。G显带分析获得结果 72例,核型正常35例,核型异常37例,异常率51.4%(37/72)。82例SNP-array分析结果中,核型正常30例,核型异常52例,异常率63.4%(52/82)。G显带分析失败的10例标本中,SNP-array检出6例异常;G显带与SNP-array结果不符的12例中,包括2例全基因组单亲二倍体(uniparental disomy,UPD),2例是部分染色体UPD。结论:SNP-array技术具有高准确性、高通量、快速检测等优点,在自然流产绒毛遗传学分析中具有较强的临床应用价值。
- 罗春玉王艳杨吟秋徐青骆潇洁李璃孟露露马定远许争峰胡平
- 关键词：早期流产核型分析绒毛膜绒毛
- 血浆游离DNA高通量测序用于21-三体综合征无创产前检测被引量：22
- 2013年
- 目的初步探讨高通量测序技术检测孕母血浆游离DNA用于21-三体综合征(T-21S)胎儿产前诊断的可行性。方法收集10例T-21S胎儿的孕母血浆和100例健康胎儿孕母血浆(均经过羊水细胞G显带核型确认),分别作为T-21S组和健康对照组,用高通量测序技术对两组标本进行检测,数据经生物信息学统计分析,并将两组测序结果与羊水细胞染色体核型结果比较,评价高通量测序技术的检测效果。结果 10例T-21S组和99例健康对照组的测序结果与羊水细胞染色体核型结果符合率为100%,另1例健康孕妇血浆因胎儿DNA浓度较低未达到检测要求。结论孕母血浆游离DNA高通量测序检测技术用于T-21S胎儿产前诊断具有无创伤、高通量、高准确率等优点,有重要的临床应用价值。
- 林颖孟露露季修庆张菁菁马定远成建刘安周静胡平许争峰
- 关键词：高通量测序无创产前诊断21-三体综合征血浆游离DNA
- 孕妇血浆游离DNA高通量测序用于胎儿性染色体非整倍体检测的初步探讨被引量：13
- 2013年
- 目的初步探讨孕妇血浆游离DNA高通量测序用于产前胎儿性染色体非整倍体检测的效果及临床可行性。方法2011年至2012年收集早、中孕期单胎孕妇5 540例,在知情同意的原则下采集外周血血浆进行游离DNA的高通量测序检测,通过生物信息学分析,获得测序结果;对测序检出的性染色体非整倍体患者行羊水穿刺,进行染色体G显带分析。结果5 540例样本中测序方法共检出10例性染色体非整倍体,其中6例与G带核型分析结果一致,包括3例45,X,1例47,XXY,2例47,XYY,其余4例G带核型正常。结论孕母血浆游离DNA高通量测序可对性染色体非整倍体胎儿进行无创性产前检测,但存在假阳性,还需进一步完善实验方案以提高检测效果。
- 林颖蒋馥蔓秦岭马定远刘立夫陈芳张红云王威季修庆孟露露胡平许争峰
- 关键词：高通量测序无创性产前诊断胎儿游离DNA
- 应用IonTorrent半导体测序技术检测结节性硬化症患者的致病突变被引量：2
- 2016年
- 目的建立基于IonTorrent半导体测序技术的结节性硬化症（tuberoussclerosiscomplex，TSC）TSC1／TSC2基因诊断和产前诊断方法，并评价其临床应用价值。方法应用IonTorrentPGM测序仪对2个TSC家系的患者及1例散发型TSC患者进行TSC1／TSC2基因测序，筛选致病突变并用Sanger测序验证。同时对1例胎儿的TSC1／TSC2基因的相应位点进行检测以明确受累情况。结果家系1患者TSC2基因检测到c．311-312insGCTG移码突变，为可疑致病突变；家系2患者TSCg基因检测到c．1790A〉G（p．His597Arg）错义突变，亦为可疑致病突变，其胎儿未携带同样的突变。结论建立了基于Ion Torrent半导体测序技术的TSC基因诊断方法，可为临床诊断及遗传咨询提供依据，并对1例胎儿进行了产前诊断，具有较高的临床应用价值。
- 王玉国林颖罗春玉梁栋季修庆蒋涛马定远许争峰
- 关键词：下一代测序结节性硬化症突变
- 应用IonTorrent测序技术检测一个甲基丙二酸血症家系的致病突变暨产前诊断被引量：5
- 2016年
- 目的对一个甲基丙二酸血症家系进行基因检测，以明确致病突变，为家系成员再生育提供遗传咨询和产前诊断。方法应用IonTorrent半导体测序技术，对甲基丙二酸血症患儿MUT、MMACHC、MMAA和MMAB基因同时进行检测，筛选致病突变位点，并用Sanger测序法进行验证，同时对患儿双亲进行基因检测。患儿母亲再次妊娠时进行产前基因检测，以明确胎儿受累情况。结果患儿MMACHC基因编码区存在c．609G〉A（p．Trp203X）杂合无义突变、c．658—660delAAG（p．Lys220del）杂合缺失突变。患儿母亲携带c．658—660delAAG突变，父亲携带C．609G〉A突变。产前基因检测结果显示胎儿未遗传父母携带的MMACHC致病突变。结论应用IonTorrent半导体测序技术快速筛查到一个甲基丙二酸血症家系的致病突变，可为临床诊断及遗传咨询提供准确的依据。
- 李璃马定远孙云张菁菁王玉国蒋涛许争峰
- 关键词：ION甲基丙二酸血症突变产前诊断
